Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_IGSF11_0003000
Sequence Length
377 nt
GC Content
0.4509
CUCUACACAUAUUUGAGGGCCAGUGUCCUUAACUGUGUCUUGUAUAUUUGAGAAGCCGUAUGCCAUAAUGUAUUCUGGAGCACACUUCUUAGAUUUGAAUCUCAGCUAGCCCACUUACACACUUAGACCCAGAAAGAAGAGGGCAGCACACCUCAGGGCCAGCAGGAGGAAGGGGAGUCAUCCAGGACAUGUACUCUCAACUGGCGGUUGGGAAGAAGACAGAAAGAGAUAGACAUGUGGGUCGAAGUCUUUACUGGGGUCCGUCGUGUUACCCAAAUGUUUCCUGUCACUUUGCUGAAUUUCAGUGUUCUCUCUUGGAUGAUCUAUUUGAAGUGUGAUUUUUCUCCUCACUAUUUUGUUUCUUCUUAGUGGAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-98.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -106.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 99.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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