Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_IGSF11_0003600
Sequence Length
431 nt
GC Content
0.4571
UAUACUGUACUUUCCUCAAAGAUACCUUAUUCAUCUUUGUAUUAGCUGCUCUUGGCCCAGUGUCUUAAUUCAUGCCCUAUUAACGUUGGUUGACUUGAGCUGAACUCUGUCCCUUGCUUUUGCUUCAGACCUUUGUUUAGCAGUCUGCCUAUCAGCUCUACACAUAUUUGAGGGCCAGUGUCCUUAACUGUGUCUUGUAUAUUUGAGAAGCCGUAUGCCAUAAUGUAUUCUGGAGCACACUUCUUAGAUUUGAAUCUCAGCUAGCCCACUUACACACUUAGACCCAGAAAGAAGAGGGCAGCACACCUCAGGGCCAGCAGGAGGAAGGGGAGUCAUCCAGGACAUGUACUCUCAACUGGCGGUUGGGAAGAAGACAGAAAGAGAUAGACAUGUGGGUCGAAGUCUUUACUGGGGUCCGUCGUGUUACCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-106.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -114.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 106.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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