Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ITCH_0000900
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.4160
GUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGACCAAUAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACGAAAGUUAGCCAGGCGUGGGGGUGCACGCCCGUAGUGUAGUNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCUCCCAAGUACCUGGGACUACAGGCGCCCGCCACCACACCUGGCUAAUUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGGCGGGGUUUCACCGUGUUAGCCAGGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-112.29 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -114.59
Frequency: 0.0241
Diversity: 9.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(....)..)))(((((((.(.((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((.((((..((((.(((((((.....................................................))..((((......))))))))).))))..)))).)))).))))))))))...)))))))))))))))))))).)))))))))))))))).).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(....)..)))(((((((.(.((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((.((((..((((.(((((,,.{,..................................................})..((((......))))))))).))))..)))).)))).))))))))))},,}})))))))))))))))))).)))))))))))))))).).)))))))
Back