Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ITCH_0002500
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.3680
GUCAGGAGUUUGAAACCAGUCUGGUCAACAUGGUGAAACUCCAUCUCUACUAAGAAUACAAAAAUUAGCAGGGUGUGAUGUCAUGUGCCUGUAUUCCCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCGAGUAGCUGGGAUUACAGGUAUGCGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUGUAUUAUCAGUAGAGACAGGGUUUCUCCAUGUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-80.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -84.06
Frequency: 0.0026
Diversity: 16.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...(((....)))))))).)(((((((.(((((((..((((((((...(((((((((.(((((.(((((((.((.(.((((((((((.((((((....................................................(....).(((........)))...)))))).)))))))))).).)).))))))).))))))))))))))...))))))))..))))))).))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((.,,{,,..,,,,,))))).,(((((((.(((((((..((((((((...(((((((((((((((.(((((((.((.(.((((((((((.((((((....................................................,....|.{{{.,......}})...)))))).)))))))))).).)).))))))).))))))))))))))...))))))))..))))))).))))))).
Back