Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ITCH_0002700
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.3960
GUCAGGAGUUCGAGAGCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUUUGUACUAAAAAUACCAAAAAAUUAGCCGGGUGGGGUGGUGGCGCACCUAUAAUCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCGAGUAGCUGGGAUUACAGGUAUGCGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUGUAUUAUCAGUAGAGACAGGGUUUCUCCAUGUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -86.10
Frequency: 0.0283
Diversity: 10.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((....)))..)))))).(((((((.(((((((..(((.((((...(((((...(((((((((.((((...((((((((((((((.((((((....................................................(....)...((((..(....)..)))))))))).))))..)))))))))))))).))))))))))))))...)))).)))..))))))).))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((,....,))..)))))).(((((((.(((((((..(((.((((...(((((...(((((((((.((((,..((((((((((((((.((((((....................................................(....)...((((..(....)..)))))))))).)))}.,)))))))))))))).)))))))))))))).,.)))).)))..))))))).))))))).
Back