Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ITCH_0015900
Sequence Length
701 nt
GC Content
0.4522
GCAAUGAUGGUGGAAGAGUAGAGGGAGAAUGUGAAAGUGGGAUCAACAGGACUUAGAUACUGAGUGUCAAGAGGCACAGGGAGGAAAAAUGUAAAAUUGCCUGGGAAAGACAGCAGUAUCGUUCAUAGAACCAAAACCUAAGAAGGAAGGAAGACCAUAGGAAGAGAAUGUUUAGAGGGACGGGAGGACCUGGCAGGGCAUGGUGGCUAACACCUAUAAUCCCAGUGCUUUUUGGGAGGCCCAAGGGGAAGAUUGCCUCAGCCCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGAGGGACAAAGCGAGACCCCAUCUCUACAUAAAAUAAAAAAUUAGCCAGGUGAGGUAGCAUGCUCCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGCUAAGGCGGGAGGAUCCCUUGAGCCCAGGAGUUCAAAGUUGCAGUGAACUGUGAUUGCGCCAUUGCACUCCAGCUUGAGUGACAGAGCAAGACUCUUGUCUUUAAAAAAAGGAAGAAAGGGAGGGCCUUGGGAUGGGAGAGUUAUUCUAGAUCUCCUGCAUUUAGUUGAUAAUUUGAUACUAGAGGAUGGGAGUGAGAUAAAGAGUAGAGAUUGAUUUGGGAAUCAUUCUCUGAGAUAACCUUAGAAAUCAUGGAAUUUGAGAUCCUAGGGAAAAAUCUGUGGAGAAAGAAAAGGAGAACAAGAACACAAUCAUAGAGACCUAUAUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-184.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -195.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 181.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(.((....)).)..(((((.(((.....(((((..(((((.((....((((...(((((((..((((......(.((((.((.............)).)))))....)))).)))))))))))...)).))....(((........)))....((((((...............(((..(....)..)))(((.(((((.((((.....)))).....((((((......))))))..(((...))).....)))))..)))(((((((.((..(((.(((((.(........)((((.....)))).....................)))))..)))..)).)))))))((.(((((....(((((..((((((((((((((.(((((..(.((((.(((((.(((.(.((((((........)))))).).))).))))).((((........))))....(((((.(((((........)))))))))).)))))..)))))((((......))))....))))))).)))))))............)).)))..))))).))..........((((((.(((((....))))).))))))......((((((...(((.......)))....))))))......))))))......................)))..)))))....))).))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(.{{....}}.}..(((((.(((.....(((((..(((,,.{{....{,(({{,({{{|||,,|{((,,,{{{({(,((,(.............,||{}}||.....}})),))))}||||||.,,|}.},....{||,.,,},)..||....||,,,{.......{{{{{{..(((..(....)..))),,,.||||}}((((.....)))).....||||,|,}}}}}))))||{{(|{,,{({{....,|||||..|||(((((((.((..(((.(((((.{{{......,{{{,.,,,.}}}}.................,...)))))..)))..)).))))))){(,({{{{,||,{{{,{..|(((((|(((((((.{((((..(.((((.(((((.(((.(.((((((........)))))).).))).))))).((((........))))....(((((.(((((........)))))}}))).)))))..))))|{{{(......})))...|))))))).|)))))}.......,....}),}}}..)))}),}},,,,...,.,||{(((.(((({....})))).)))))},,....((((((,..(((.......)))..},)))))).....}))}}}),.....................)))..)))))....))).))))).
Back