Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ITCH_0020800
Sequence Length
353 nt
GC Content
0.4051
AAUCAAGAUUUAUUUGCUACAUCACAAAGUAAAGAAUUUGAUCCUCUUGGUCCAUUGCCACCUGGAUGGGCAAUGGACCACAGAAAUUCUGCAUUGAAAAAGUUGGGAAAGAAAAUUGGCUACCCAGAAGUCAUACCUGUUUUAAUCGCCUGGACCUGCCACCAUACAAGAGCUAUGAGCAACUGAAGGAAAAGCUGUUGUUUGCCAUAGAAGAAACAGAAGGAUUUGGACAAGAGUAACUUCUGAGAACUUGCACCAUGAAUGGGCAAGAACUUAUUUGCAAUGUUUGUCCUUCUCUGCCUGUUGCACAUCUUGUAAAAUUGGACAAUGGCUCUUUAGAGAGUUAUCUGAGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-87.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -95.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 61.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(((((.((((((.........))))))))))))))).(((.((((((((((((.........))))))))))))......((((..(((.....)))..)))).......((((...((((......................))))....))))((((((((((.(((((.(((((...((......))...).)))))))))....(((((..(((...(((((((.........((((..(((((.(((....))))))))..)))).........)))))))...)))..))))).....)))))))....)))...((((((((....))))))))..))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((({(({.((((((.........))))))})))))))).(((.((((((((((((.,......})))))))))))){{{{..,||||,{{({{,,..,,{{({...{,...,((({...||||...}}...,},.}}}},,}.,,,|}}....||||{{{(((((((.(((((.(((((...((......))...)})))))))))..{.(((((..(((...(((((((.,,......((((..(((((.(((....))))))))..))))...,..,,.)))))))...)))..))))).}...)))))))....)))...((((((((....))))))))..))).
Back