Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ITCH_0023800

Sequence Length

234 nt

GC Content

0.3889

AUCAAAUGGACAAAUUCUUUGAAAGAUAUGUCACCAAAAUGGACACAAGAACAGAUACAACUGGCCAUGCCACAGCACAUAAAGAUUACAGUGACAAGAAAAACAUUGUUUGAGGAUUCCUUUCAACAGGUCCUUUUAUGUGGAAUGCAAGAGAUUGAUUUGAAUGACUGGCAAAGACAUGCCAUCUACCGUCAUUAUGCAAGGACCAGCAAACAAAUCAUGUGGUUUUGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-43.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -47.52

Frequency: 0.0017

Diversity: 39.25

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((...((((...))))..)))).(((...))).........(((......)))((((.((((((.(((((((.....((((((..........))))))..(((((..(((......))))))))))))))).............((((((((((((((((((......)))))......)))))).(((........)))..)))))))))))))..))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,{,,,.{(({,..,||||,,,.,}}..|||}.((,...}))..,......(((......)))((((.((((((.(((((((,....{(((((..........))))))..{((((..(((......))))))))))))))).............{(((((((((((((((((......)))))......)))))).(((........)))..))))))}))))))..))))..