Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ITCH_0027700

Sequence Length

376 nt

GC Content

0.4202

AUAAUGAGCUUCAGUCCCCAAGAUCUGCGAAGACGUUUGUGGGUGAUUUUUCCAGGAGAAGAAGGUUUAGAUUAUGGAGGUGUAGCAAGGGAGCAAUGGACCACAGAAAUUCUGCAUUGAAAAAGUUGGGAAAGAAAAUUGGCUACCCAGAAGUCAUACCUGUUUUAAUCGCCUGGACCUGCCACCAUACAAGAGCUAUGAGCAACUGAAGGAAAAGCUGUUGUUUGCCAUAGAAGAAACAGAAGGAUUUGGACAAGAGUAACUUCUGAGAACUUGCACCAUGAAUGGGCAAGAACUUAUUUGCAAUGUUUGUCCUUCUCUGCCUGUUGCACAUCUUGUAAAAUUGGACAAUGGCUCUUUAGAGAGUUAUCUGAGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-92.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -99.20

Frequency: 0.0000

Diversity: 59.48

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((...((((.((((((.(((.....(.((((((((((.....((((((.(((.....))).(((((.(.((((((.((..(((((((((...((.(((...(((......)))....))))).......))).))).)))....)).)))))).)..))))).)))))).....)))).)))))).)(((((.(((((...((......))...).)))))))))....(((((..(((...(((((((.........((((..(((((.(((....))))))))..)))).........)))))))...)))..)))))))).)))))).......))))...)))))((((((......)))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....(((((...((((.((((((.(((.....(.((((((((((.....((((((.(({,,{({{.,.((((.,{,,(({(({((..{{,,{{,,{...{{.(({...{||,,....}},....}}}}}........}}.))),))),..,))}},)))).}},},,)).)))))).....)))).)))))).)(((((.(((((...((......))...)})))))))))....{((((..(((...(((((((.,,......((((..(((((.(((....))))))))..))))...,..,,.)))))))...)))..)))))))).)))))).......))))...)))))((((((......)))))).