Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_KIAA1244_0004100
Sequence Length
1244 nt
GC Content
0.5651
CAUCAUGGAUGGCAUGACCGAAGCAUGCAUCAAGGGUGGCAUCGAAGCUUGCUAUGCAGCCGUGUCCUGUGUCUGCACCUUGCUGGGUGCCCUGGAUGAGCUCAGCCAGGGGAAGGGCUUGAGCGAAGGUCAGGUGCAACUGCUGCUUCUGCGCCUUGAGGAGCUGAAGGAUGGGGCUGAGUGGAGCCGAGAUUCCAUGGAGAUCAAUGAGGCUGACUUCCGCUGGCAGCGGCGAGUGCUGUCCUCAGAACACACGCCGUGGGAGUCAGGGAACGAGAGGAGCCUUGACAUCAGCAUCAGUGUCACCACAGACACAGGCCAGACCACUCUCGAGGGAGAGUUGGGUCAGACUACACCCGAGGACCAUUCGGGAAACCACAAGAACAGUCUCAAGUCGCCAGCCAUCCCAGAGGGUAAGGAGACGCUGAGCAAAGUAUUGGAAACAGAGGCGGUAGACCAGCCAGAUGUCGUGCAGAGAAGCCACACGGUCCCUUACCCUGACAUAACUAACUUCCUGUCAGUAGACUGCAGGACAAGGUCCUAUGGAUCUAGGUAUAGUGAGAGCAAUUUUAGCGUUGAUGACCAAGACCUUUCUAGGACAGAGUUUGAUUCCUGUGAUCAGUACUCUAUGGCAGCAGAAAAGGACUCGGGCAGGUCCGACGUGUCAGACAUUGGGUCGGACAACUGUUCACUAGCCGAUGAAGAGCAGACACCCCGGGACUGCCUAGGCCACCGGUCCCUGCGAACUGCCGCCCUGUCUCUAAAACUGCUGAAGAACCAGGAGGCGGAUCAGCACAGCGCCAGGCUGUUCAUACAGUCCCUGGAAGGCCUCCUCCCUCGGCUCCUGUCUCUCUCCAAUGUAGAGGAGGUGGACACCGCUCUGCAGAACUUUGCCUCUACUUUCUGCUCAGGCAUGAUGCACUCUCCUGGCUUUGACGGGAAUAGCAGCCUCAGCUUCCAGAUGCUGAUGAACGCAGACAGCCUCUACACAGCUGCACACUGCGCCCUGCUCCUCAACCUGAAGCUCUCCCACGGUGACUACUACAGGAAGCGGCCGACCCUGGCGCCAGGCGUGAUGAAGGACUUCAUGAAGCAGGUGCAGACCAGCGGCGUGCUGAUGGUCUUCUCUCAGGCCUGGAUUGAGGAGCUCUACCAUCAGGUGCUCGACAGGAACAUGCUUGGAGAGGCUGGCUAUUGGGGCAGCCCAGAAGAUAACAGCCUUCCCCUCAUCACAAUGCUGACCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-467.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -487.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 347.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((((((((.......))))).....(.((((((........)))))).)(((.(((((((((((((((((((....))))))...))))..((((((((........))).))))).(((((((((.(((.....))).)))).)))))(((.(.((((.((.(((((((..((((((......))))))............(((((.(((((...(((((((.....)))))))...........((((((((((((((((......(((((((.....((((((((((.(((((......))))).((.....))((((((..((((..((((((.((((((...((((((.....)))))).............)))))...).).)))))..)))).))))))..((((..((((((...(((.(((((.((((.((((((((....((((.((((((.(..(((..(((....)))..)))..).))))))........(((((.(((....))))))))....((((((.((.(((.(((...((.((.((.......)).)).)).))).))).))...))))))(((((((((((.....)))))).))))).)))).((((....(((((.((((((..(((..(((((...((((((.(.((((....))))...).)))))).......)))))..)))..))))))........)))))))))...)))))))))))).))))).)))((((.((((...(((((((((((.(((.(((((((((((((....))))..)))))..((((.........))))..(((((.(((((........))))).))))).)))).))).))..)))))))))...))))(((((....))).))....(((((.......)))))....)))))))))))))).))))))))))..(((((.((((.........))))....)))))....)))))))..)))))....))))))))))).........))))))))))...(((.(..((((((.(((.((((((((......((((.((((......)).)).))))...)))))).))))).))))))..).)))))))))))).)))).).))).))))).))))))).((.(((((((.((.(((((....))))).))....))))))).))..)))).)))))(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((((((((((.,....,))))).....(.((((((........)))))).)((,{(((((((((,,,,((((((.,.,||}|}|{{{||,|,.{{{||{||,}},...,|||||||||,{((((((({.(((...,,|||,||||,|||||{((,{,((({,((.(((((((,.(({({({{,...||||||{,.,.,,..{{,((({({(((((((({..,||||||,||||||.},,))}..,.,.{(((((((((((((((......(((((((.....((((((((((.(((((......))))).((,,.,,||((((((..((((..((((({,|{((((...((((((.....)))))).........,...}})))...},).)))))..)))).))))))..||{||.{((((({..(((.(((((.((((.((((((((....((((.{(((({,(,,(((..(((....)))..))}..,,|||||}........{{{||,|||....)))))})),,..((((((.((.(((.(((...((.((.((.......)).)).)).))).))),),...))))))(((((((((((.....)))))).))))).)))).((((....(({({|((((((.,(((..(((((.,.((((((.(.((((....))))...}.)))))).....,.)))))..))),.)))))).||...,,)))))))))...)))))))))))).))))).)))||{{,,{,,.,,{((((((({{(.(((.((({(((((((((....)))).,)))))..{(((.........)))),.(((((.(((((........))))).))))).)))).))).)}..))))))))).,,)))}}}))}}{{,...|}}..,,|||||,,,....))))}...||||,,}||)}}}}}.))))))))))..(((((.((((........,))))....)))))....)))))))..)))))....)))))))))))....,,.,,)))}})}}}|..,{{|}|,.((((((.(((.((((((({,{{{..{(((,{(((......))},).)))).}}))))))},}))).))))))..},))))))}}}})),,)))})}),}.))))),,)))))).((.(((((((.{(.(((((....))))).}}....))))))),)}..)))).}})))(.....)
Back