Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_KLHL1_0002700
Sequence Length
547 nt
GC Content
0.4534
GCUUGUUCUGAGUUCAGUCUCCGACUAUUUUGCGGCCAUGUUUACAAGUGAUGUUUGUGAAGCCAAGCAAGAGGAGAUCAAAAUGGAAGGCAUAGACCCCAAUGCUCUCUGGGACCUUGUCCAAUUUGCAUAUACAGGCUGCUUGGAAUUAAAAGAGGACACCAUUGAGAACCUUCUUGCUGCAGCGUGCCUUCUUCAGCUUCCACAGGUGGUGGAAGUGUGCUGCCACUUCCUCAUGAAGCUUUUGCAUCCAUCUAACUGUUUAGGAAUUCGAGCCUUCGCAGAUGCUCAAGGAUGCAUUGAGUUAAUGAAGGUGGCCCACAGCUACACAAUGGAAAACAUAAUGGAAGUUAUCAGAAAUCAAGAGUUUUUACUCCUUCCAGCUGAGGAGCUCCAUAAACUACUGGCCAGUGAUGAUGUCAAUGUUCCUGAUGAAGAAACCAUCUUCCAUGCAUUGAUGAUGUGGGUCAAGUAUGACAUGCAGAGUAGAUGCAAUGACCUGAGCAUGCUUCUUGCCUUUAUAAGACUGCCACUGCUUCCACCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-149.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -158.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((...((((((.((((((.....(((((((((....((((((((.....)))))))))))..))))))))))))......(((((((((........((((......((((...)))).....))))......(((((..........((((((..............))))))...))))))))))))))(((((((((((.....))))))((((((((((((((..((((..(((((.(((((((......((((..(((........)))..))))........)))))))..))))).)))))))))))....))).)))).(((.....)))..((((((..............((((....))))))))))))))).))))))........)).)))(.(((.((..((((.......))))(((((.....)))))((((((((.((..(((..((((....))))..)))..)).))))).)))....(((((.((.(((((......)))))..))...))))).)).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,(,.,,{,{{,,,((((((..,..(((((((((....((((((((.....}))))))))))..)))))}))))}|,..,.,(((,(((({.,..,,{,||||..,.}}||,{...}|||...,,||,....|||||{,|}||{{,....{|{{|{.|,|||,|,,||..}}))))},}}|,,,}))))}})|||||,|||||{..{{{||||||((((((((((((((..((((..(((((.(((((((...,,.((((..(((........)))..)))).},.....)))))))..))))).)))))))))))....))).)))).{((.....}}}..((({{({{.{{(,.......{(((,,..}}}}|||,,,,))))})))}},}}},}}},,,}}}}|.,||,|,,,{{|{{{{{...,{,,(((({.....)))))||{|||||}||..{{{,,((((....}))).,))).,)).}}))),.,),,,}|||||,{{.{{{{|,,....}}}})..))...})))))))}))).)
Back