Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_KLHL1_0003700
Sequence Length
2873 nt
GC Content
0.3178
GUGGAAGAAUUCUGCUGUUCUUGCUAUAUGUGCUUGAGCCCGAAUUCUUAAAAUACAUGCUGAGAAGUGGCCAUAUUCUGGGGUUGUAAUUUGCGAACUUGUGAAAGGCAAACAUAUGGUACAGCAAAAUUUGUAUUAAUUUCAAAUAUUUAAAGGAGAACUUGAAAAGUCUGAUGAAGAUAACAUAUUGUGUAGAUAAAUAUAUAUAUUGCAGAUAACAGAGAACACAGGUAAUAUCAGUGGAUAUAGAAUUUGGUAAGCUUCUCUGUCAAUUUUUUCGGAUUUUCUAUGUGCACAAACACAUCUUCUGGAAAUAAUAUCAAUUACGUAUUUUCUUAUUCAAAAAUAAUGUUUUUUGUUGUUGUUUACACUUUACUGGUAAGGCUCUCCGAAUUUUUUAUUUUGCAUAACUGUGGUUCUGCAUCUCAAGAGGAAGAGGUUCAAUAAAAUAUAAUGUUUUCCAAAUCAGUGUAUUAGGUGUUUCUAUACGAUUAAAACGUGUUUAAGUCCAAUUUCACUGGAAUCUCUUUCCUGAAGUAUCUAACAAAUUUUUGAAAAUUCUUGGCCAUUAUUUCCUCACAUGGCUUUUGUCCCAUCAUUUCUCCCCUCUACUUUUAAGAUUACAGAAUAUAGUAAUUACAUGAAUAUUAUAAUUUUACCGUUUUUUGUUUUCUAUAUUUUUAUCUCAGUAACUUAGUUUGAGUAUUUUCUAUUAAUUUAUUUUUCAUACCGUCAUUUGUUUGCCUUUUAUCGACUAAUUUUGCACAUCAAAAUCUUAAAUUAUUGUAUUGCCUUAUUUGUUUCCAUUUGAUUUUUUUCAUAUGACUUGAAAUUAUCCAGCUUAUUAUCUAUAUUAAAAGACCAAUGAAAGUUAUUUUUAUAUCUAUUAAGUAAUAAUUGUGAUCCAUAUAUUCGAACAUAUCUGUAGCAACUGGGAGACUGUUUCUGUUGUCUGUUUUUCUCAUUGUGUCCAGUUUCUUUACAAACCUACUAUUUUUUUCCUUUAAUGCCAGGCAUUGUGUAUAAGAAAUCACAGAGUCCAUAUAAGAAUGUCUUUUCCUAAAUAUAAACUAUAUUGUUUGCUGGUACUUCAAUUAAAAGUUCAGCUUAAUGAAAUCAGAGAUUUUCACUGAUACAACUCUAGGUUUCAGUCUUCGUAUUAUCCUCAGAAGAUCUGCUUAGCUGCCAUAUUAUGUUGAGCUCCUUGGACUCUCACUCUAUGUUGUUAAUAACUAGUAAAUACCUUGAGAGGGAAAGAAUACGCAGUGAAUAAUUUUGAGAUGACUCUAAUUAAUUUAUCUGUAUUUCAGGAUCUUAGCUUUCUAAGUCCUGAUUGCCUCAGUAGAGCCUAUUGAAUGCAAAUAAUUAUUUUGAUAUUGUAUGUAACUUUUUUGUGGUUUUCGUGGAGAGGGAUUUAGUCAGCUGCAAAUUACUACUUUGCAAUUGGAACCAGAAUUCUCCAUGUUACUUUCUAAGAUAUUUAUCAUGAAGUAAGCAAUUUUAGUCUUAACUUUAUGAAUCUAAUUAAUAUUUAAUUUUAGGUUAUUUAAGCAAUUGUCAUCAGAACACUUGAUUGGGUCUGCUGGGCUUUAUCAUGUGUCUAUCAUGAAACUUGAAUAUUAACAGUCUUCCCUAUGAUGGAGUAUAGCACUUAUUAAAGUUAUUUUUUUUGAAACAGUCUAUAUUAUUAAUACAUGAAGUAACAAAACUUAAGUAUCAUGGACUUUCCAAAAUCAUAAAGUUUAUUAAAAUAUCUAUUAAUGAUUAAAGUUAUUAUAAGUACUGAGUUAAUACAUUCUACUUUUUUGUUUAAUAGUGGGGUGCAGAACAUGAAAGUCAAUAAUUUACUUACAAAUUUAAUUGUCAGUAUUACUUGAAAACCAGGUUUUAUAUUUUUUUCAUAAUAAAAAUCACCUAUUUCUGCAAGGCAACAUUUACUAUGACAUCUCAAGAAUUCUAUUUAGAAUAGUAUAAUUAAGCUAUCUUCCUCAAUAUCAAAUGAACGAAAUUAACAUUUCAUUGCUAAUUAAUUUUAGAAUAGGCAUGUAAAUAAUUUACUAUUUCUGUGAGAUUUCAGGUUUACUAACUUAAGGUCCUAAUCAAUACAGACAACAUAUUUUUAAACCUCUUUUAAAGAACUUUUCCAUUUAUUUAUUAUUCCCUAGAGCAAAUCACUUAUCCCACAAUAGAUUAUUCGACUUUUAUUUAUUGAAGUUGUAUUAAAAUAUAAAAAUAAACACAGAUAUAUUAGUUUUCUUAAGAAAAUGAUAAAAACCUGUAUGUUAUUCUAGAUAAUUGGCUCUUUAUAAAUCCCUUUAUUAUUUUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGGUUUAUAGGCUGUCAUCAACCGGCCAUUCAAUGACACCUCAAAGUGAUUUGGACUCCAGUAGCUCUGAAGAAUUCUAUCAAGCUGUUCAUCAUGCUGAGCAAACCUUCAGAAAGAUGGAAAGUUAUUUGAAGCAGCAGCAACUUUGUGAUGUUAUCCUGAUUGUUGGGAACCGAAAGAUACCUGCACAUAGGCUUGUUCUGAGUUCAGUCUCCGACUAUUUUGCGGCCAUGUUUACAAGUGAUGUUUGUGAAGCCAAGCAAGAGGAGAUCAAAAUGGAAGGCAUAGACCCCAAUGCUCUCUGGGACCUUGUCCAAUUUGCAUAUACAGGCUGCUUGGAAUUAAAAGAGGACACCAUUGAGAACCUUCUUGCUGCAGCGUGCCUUCUUCAGCUUCCACAGGUGGUGGAAGUGUGCUGCCACUUCCUCAUGAAGCUUUUGCAUCCAUCUAACUGUUUAGGAAUUCGAGCCUUCGCAGAUGCUCAAGGAUGCAUUGAGUUAAUGAAGGUGGCCCACAGCUACACAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-621.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -681.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 619.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((....((((..((.......))..))))..))))))))......((((((((((((.(((.((((..(((((((......((((((.((((((((((((((((.((((((....(((((....((((((...(((((((((((.(((...((((.......((((((((((.((...((((((......))))))...)).(((.((((((((((...((((((((..(((((((.(((((((((..(((((..((..........(((((......(((((......)))))..)))))((((((((.(((..(((((((((........))))).))))...))).))))))))..........))..)))))..))))))))).)))).((((.(((....))).)))).....((.(((((((((((...((((((...))))))......(((((.(((.((..(((..(((((.......)))))..))).)))))..))))))))))))))))))((((((.............(((........((((((...........)))))).........)))...........))))))...((((((........)))))).)))..))))........)))))))))))))).))).))))))))))))))...)))..)))))))))))...))))))..)))))...))))))....)))))))))))))).....)).))))))......))))))).......)))).)))......((((((((.(((......))).)))....))))).((((((.(((((((.....((((.(((...((((((.....)))))).))).)))))))))))))).))).............(((..(((((((((..(((((((..........))))....((((((.(((((((.((((......))))............((.((((((.(((((((.(.(((((..........((((((((.....(((......)))........((((......))))(((((.((((.......)))))))))....(((((((((((................)))).)))))))((((((............))))))..(((((((...........)))))))....))))))))...((((((((((((.....((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((..(((....))).)))).))))).))))...((((((.(((((....)))))))))))((((.(((((((...)))))))..)))).((((((((..((((((....((((...(((((((((((...(((((((((((((..((((.((((((.......)))))).)))).....))))))((((((.(((((.............(((((((((((((.......).))).)))))))))((((((.............))))))((((((((......((((.(((.(((.((((.((((((...)))))).)))).))))))...))))..))))))))............((......))(((((((.(((..((((((.......))))))...))))))))))...........((((......))))))))).)))))))))))))))))))))))).))))...))))))....))))))))...........(((((((((((....(((((((((.((......)).)))))))))...))).((.((((.((....)))))).))..........))))))))(((((.....)))))....))))))))))..................)))).)))))....)))))))))))))..........(((....)))(((((........)))))(((((...........(((((..(((((.((......)).)))))....(((((((((((..(((((...))))).....(((((.(....(((((.......(((..((((((((.((((.((((((.((((.........((.(((((((.((((((.((((((............((.(((((((((((((........(((..(((.((((((((........))))))).).)))..)))....(((.(((((.((((((...........(.(((((((((((......((((.....(((......))).....))))......))))))))))).))))))).))))).)))((((.(((....(((((........)))))....))).))))....))))))))))..))).))....(((((((.......(((.((((.....)).)))))......))))))).)))))))))))).))))))).)).........)))).)))....)))))))))))).)))..)))..)))))).)))))))))))))))))))))((((((.....(((((((((....((((((((.....)))))))))))..))))))))))))......)))))))))))).....((((......((((...)))).....))))))))).).))))))).)))))).))))))).)).)))))))))..))))))))).))).)))).)))))((((((.....))))))((((((((((((((..((((..(((((.(((((((......((((..(((........)))..))))........)))))))..))))).)))))))))))....))).)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{((((((((.{..((((..((.......))..)))),.)))))))}.........(((((((((.(((.((((..(((((((...,,.((((((.((((((((((((((((.((((((..,.(((({....((((((...((((((((((({(((,{,,{({...{{,{({(({|{{{{..,...((((((......}})))),,,||.(((,,,(((((,,({{{({{{,,,,,,{,{((((.(((((((((..(((((..({{.......,{{((((......(((((......)))))..)))))||((((((.(((..(((((((((........)))))},)))...))).))))))},.,.,......))..)))))..))))))))).))))}}},,,.,||||}.|||||.||||,|{{((((((((((((...,{{{{,...}}}}}}......(((((.{,{.((..{({..(((((.......)))))..}}}.)),},..))))))))))))})))))|||||,,,...,,,......|,...,....((((((...........))))))..,},....}}}.,}},,,...,|.}},,,.||||.,|||||||||||,,..,,{.{{,,..,,.....,))},)))))}))),.))),))))))})))),})},.}}}..)))))))))))...))))))..))))).,.))))))....))))))))))))),,,,..}}.)))))).,,...))))))).......)))).)))......,....(((.(((......))).)))..,,|||||,(({{{(,((({(({.,,,.{{((.(((...{{{{{{|,..})))))).)}).})))))}))))))}.}}}........,,},.{{{..(((((((((..(((((((..........))))....((((((.{((((((.(({,......,}}}............((.((((({.(((((((.(.((((({.{,,.....((((((((...,.(({......}}}....,,,,({{{......}}}}(((((.((((.......)))))))))....(((((((((((.,,.,....}}.....)))).)))))))((((((............))))))..(((((((...........)))))))....)))))))).,{((,.{((({,((,{{{{({{{{,,,.((({{,,||||...,,{{{,(((((((((((((..(((....))).)))),})))).}))),,,((((((.(((((....)))))))))))((((.(((((((...)))))))..)))).((((((((..((((((..,.{,((((,,.{((((((((...(((((((((((((..((((.((((((.......)))))).)))).....))))))((((((.(((({...,{({{.....(((((((((((((.......).))),})))))))){{((((,{{,...,}}},.}))))}{(((((((......((((.((,{(((.((((.((((((...)))))).)))).))))))...))))..)))))))}......},,,,.,,...,,,))(((((((.(((..((((((.......))))))...))))))))))...........{{{{......})))))))).)))))))))))))))))))))))))),}}...))))))....)))))))).}}}}}}}}..||||,,|}||,....(((((((((.((......)).))))))))){{{{{{,,{..,,{{{{.....{{{{.((({......)))).)))),,|,|||,....)}|||{{|.|{{{,,,.....,,})}}}}},.{||,{.,,|,|}}||....,}}}}|}}|||,|{{{{{{|{,.{{{....|||{((((........))))}||,,.,,,........|||..{{(({....|}}}}..||{|,|||....{{{{|||{||{,.((((,...}))))...,,||{||}},,.,||(({.......(((..((((((((.((((.(((({(.((((.........((.(((((((.{((((((((((((............{{.(((((((((((((........{{{,,{,{..(((((((........))))))).|,,,...}}}........(((((.((((((...........{.(((((((((((......((((.....(((,....,))).....))))......))))))))))).)))))))})))})|}|.((((.(((.,..(((((........)))))....))).)))),.,.))))))))))..))).})....(((((((.......((,{((((.....)}.)))))......))))))).)))))))))))}.))))))).)).........)))).))),...)))))))))))),,))..)))..})))))}}))))))})))))))},,,..((((((.....(((((((((....((((((({.....)))))))))))..)))))))))))).....,|||,{((({,|....,.}}}}}.}}),(({{...))))..,}}.,,)))))).}.))))))).}))))).)))))))).).)))))))))..))))))))).))).))))}})))){|||||...,.||||},{((((,,(((((((..((((..(((((.(((((((...,,.((((..(((........)))..)))).},.....)))))))..))))).))))))))))).}})),)}))})..,.
Back