Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_KLHL2_0001700
Sequence Length
1583 nt
GC Content
0.4479
AUGCACAAAGCAGGGUCAUCAGAAGCCUCUCGAUUCAAAAGAUGAUAAUACCGAAAAACACUGCCCAGUGACAGUGAAUCCUUGGCAUAUGAAGAAAGCUUUCAAAGUCAUGAACGAAUUAAGAAGUCAAAAUUUGCUGUGCGAUGUCACAAUUGUGGCAGAAGACAUGGAAAUUUCUGCUCAUAGAGUGGUGCUGGCCGCCUGUAGUCCUUAUUUUCAUGCCAUGUUUACAGGUGAGAUGAGUGAGAGCCGAGCAAAGAGAGUUAGAAUAAAAGAGGUAGAUGGCUGGACCCUGAGGAUGCUAAUUGAUUAUGUUUACACUGCAGAAAUUCAGGUUACAGAAGAAAAUGUACAGGUACUUCUCCCAGCAGCUGGUCUCUUACAGUUACAGGAUGUGAAGAAGACUUGUUGUGAAUUUUUGGAAUCCCAGCUUCACCCUGUCAACUGCUUAGGAAUCCGGGCUUUUGCUGAUAUGCAUGCAUGUACCGACCUUCUGAACAAGGCCAACACCUAUGCAGAGCAACAUUUUGCAGAUGUUGUACUUAGUGAAGAAUUUCUCAAUCUUGGCAUCGAACAAGUGUGCAGCUUAAUCUCAAGUGACAAACUUACCAUUUCUUCAGAAGAGAAGGUAUUUGAAGCAGUAAUAGCAUGGGUGAACCAUGACAAGGAUGUGAGGCAAGAGUUUAUGGCCCGACUGAUGGAACAUGUACGGUUACCUUUGCUUCCUCGGGAAUAUUUAGUUCAGAGGGUUGAAGAGGAAGCAUUGGUCAAGAAUAGCAGUGCUUGCAAAGAUUACCUCAUUGAAGCAAUGAAGUACCAUUUGCUGCCAACAGAGCAGCGUAUAUUAAUGAAGAGUGUCCGGACCCGGCUGAGGACACCCAUGAACCUUCCCAAAUUGAUGGUGGUGGUUGGGGGCCAAGCACCAAAGGCUAUCCGGAGUGUGGAAUGCUAUGACUUUAAAGAAGAAAGGUGGCACCAAGUAGCAGAGUUGCCUUCCAGGAGGUGCAGGGCAGGCAUGGUCUACAUGGCUGGACUUGUUUUUGCUGUUGGUGGCUUUAAUGGCUCAUUAAGAGUUCGCACUGUAGAUUCCUACGACCCUGUGAAGGACCAGUGGACCAGCGUUGCUAACAUGAGAGACCGGAGAAGCACUUUGGGAGCUGCUGUGUUAAAUGGAUUAUUAUACGCUGUGGGAGGCUUUGAUGGGAGUACAGGUUUGUCAUCUGUGGAAGCAUACAACAUAAAGUCUAAUGAGUGGUUUCAUGUAGCUCCCAUGAAUACAAGGAGGAGCAGUGUUGGUGUGGGUGUUGUUGGAGGUUUGCUCUAUGCUGUAGGAGGUUAUGAUGGAGCAUCACGUCAGUGUCUUAGCACAGUAGAAUGCUAUAAUGCUACAACAAAUGAGUGGACCUAUAUAGCAGAAAUGAGCACCAGGCGGAGUGGAGCAGGUGUUGGUGUGUUAAACAAUUUAUUGUAUGCUGUAGGAGGUCAUGAUGGCCCUUUAGUACGAAAAAGUGUUGAAGUAUAUGAUCCCACCACUAACGCAUGGAGACAGGUUGCAGAUAUGAACAUGUGCAGAAGAAAUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-467.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -495.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 487.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((....((((((((((.((((((((.............(((((((((.(..((((((((((.(((((..((((..(((............)))..))))..)))))...((((((..........))))))((((((..((((((....))))))...).)))))...(((((((((((..(((((((((((((((.((..((((((.............(((((((((((((.....((((((((((((...................(((((..(((((((...((((((..(((....(((......)))....)))....))))))...))).....(((((((.((((((((...((((((((((..(((((((((((((((..((((((...((.....))......((((....))))))))))))))).)))))..)))))..))))....))))))(((((....)))))..(((((((((((((..(((((.(((((((((((.(((((((((...))))))))).))..((.((((.........)))).))...((..((((.....))))..))....((..((((..((((.((((((...)))))).))))))))..)).......)))))))))..((.(.(((....))).)))..........)))))...((((.((((((.(((....)))...)).)))))))).........)))))))))))))..((((((((((((...........))))))))..........))))...........))))))))....((((((....).))))))))))))........((((((............))))))))))..))))).(((......)))(((((.((((...)))).)))))..(((..((((.....))))..))).(.(((((........))))).)((((((.((((((((..(((((....)))))(((((.(((.((((.....)))).)))..)))))))))))))))))))))))....))))).)))....))))).))))))))...............)))))))))))).)))))))))))...)))))....)))))).......((((((((((.(((..((((.(.((((((.((..((((....(((((.(((((.(.(((....)))).))))).)))))......))))..)).)))))).).)))))))))))))))))............)).))))))))....).)))))))))))))))))((((((((((......)))....)))))))..(((.(((.(((..(((((..((((....))))..)))))..)))..))))))(((((.(((((((...((.((((((..((........)).)))))).)).......((((....)))).)))))))..))))).))))))))))(((((((......))))))).(((..((.(((((...........))).))))...))).....))..))).((((.......)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.{((,,.{,({{((((((.{((((((({,.........,,(((((({((,,..((((((((({,(,(({..{{{{||||{|||,.....,,..||{{||||{{|||,|...{,.........,,,..{{{{{.(((({{..((((((....))))))...},))})}}}}}}|((,(((((..(((((((((((((({{((..(((((({{..,,.,.....((((((((((((({{,,,{{{(((((({((....,,,{{{.........(((((..(((((((,..((((((..(((....{((......))}....)))....)))))).,.||}.....,{{{{{(,((({{{{{,.,({((((((((..(((({((((((((((..((((((...||...,.}}......|{{{....)))}))))))))))).)))))..})))).,|||||||,{|}}||((((({...},}}}..(((((((((((((..{{....(((((((((,{.(((((((({...})))))))).}}..{(,((({....,,,,.}|||,}}......,|||{.||..||||..,,..,}||..||,|,,((((.((((((...}))))).))))}}}}..}}.......)))))))))..||.{..{.{(((.((((((.{{..((.((((..((,.....,))..)))).))..}}.)))}})).)))),}}.........)))))))))))))..,,(,((((((((.,.......,.)))))))).}......,,|.||((((...)))))),)))}}.,..((((({....}.)))))))))))),.....,,|{||||}},.,,,,},,.)))))|||}}..|||}|,(((......)))(((((.((((...)))).))))).,(((..((((.....|||}.,|||,{.,((((......,.}}}))|}||{{{{.(((((({{..({{{{....))))){((({,(((.((((.....)))).)))..)))})}))))))}}}}}))})}}...}})))),)},....))))).)))))))).....,,.....)},)))))))))))).)))))))))))...)))))}},.}}},,..,.}))))|||||||,|,|||}},,,|}}}||||||,,|..||||}}}}|||||,||||{.{.{{,}.},))))})||||.|||||.{.{..|||,..,}.,,))),}),)))))}}}},||||||,|,....,,.,}.)).))}|||||,,,,|,||}|||||}}}||}}}|(((((((,,{{,,....,}}},,)))))))}.(((.(((.(((..(((((..((((....))))..)))))..)))..))))))(((((.(((((((...((.((((((..((........)).)))))).}},{.....|||..,,,}},,.)))))))..))))).}}}))))))|((({(((......))))))),|,|.,||.|||||,,}}},,,}}.||,.,,}}..,|||{.,,.,,..})).||||.......}))),
Back