Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_KLHL2_0002300

Sequence Length

1085 nt

GC Content

0.4571

UCAAAAUUUGCUGUGCGAUGUCACAAUUGUGGCAGAAGACAUGGAAAUUUCUGCUCAUAGAGUGGUGCUGGCCGCCUGUAGUCCUUAUUUUCAUGCCAUGUUUACAGGUGAGAUGAGUGAGAGCCGAGCAAAGAGAGUUAGAAUAAAAGAGGUAGAUGGCUGGACCCUGAGGAUGCUAAUUGAUUAUGUUUACACUGCAGAAAUUCAGGUUACAGAAGAAAAUGUACAGGUACUUCUCCCAGCAGCUGGUCUCUUACAGUUACAGGAUGUGAAGAAGACUUGUUGUGAAUUUUUGGAAUCCCAGCUUCACCCUGUCAACUGCUUAGGAAUCCGGGCUUUUGCUGAUAUGCAUGCAUGUACCGACCUUCUGAACAAGGCCAACACCUAUGCAGAGCAACAUUUUGCAGAUGUUGUACUUAGUGAAGAAUUUCUCAAUCUUGGCAUCGAACAAGUGUGCAGCUUAAUCUCAAGUGACAAACUUACCAUUUCUUCAGAAGAGAAGGUAUUUGAAGCAGUAAUAGCAUGGGUGAACCAUGACAAGGAUGUGAGGCAAGAGUUUAUGGCCCGACUGAUGGAACAUGUACGGUUACCUUUGCUUCCUCGGGAAUAUUUAGUUCAGAGGGUUGAAGAGGAAGCAUUGGUCAAGAAUAGCAGUGCUUGCAAAGAUUACCUCAUUGAAGCAAUGAAGUACCAUUUGCUGCCAACAGAGCAGCGUAUAUUAAUGAAGAGUGUCCGGACCCGGCUGAGGACACCCAUGAACCUUCCCAAAUUGAUGGUGGUGGUUGGGGGCCAAGCACCAAAGGCUAUCCGGAGUGUGGAAUGCUAUGACUUUAAAGAAGAAAGGUGGCACCAAGUAGCAGAGUUGCCUUCCAGGAGGUGCAGGGCAGGCAUGGUCUACAUGGCUGGACUUGUUUUUGCUGUUGGUGGCUUUAAUGGCUCAUUAAGAGUUCGCACUGUAGAUUCCUACGACCCUGUGAAGGACCAGUGGACCAGCGUUGCUAACAUGAGAGACCGGAGAAGCACUUUGGGAGCUGCUGUGUUAAAUGGAUUAUUAUACGCUGUGGGAGGCUUUGAUGGGAGUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-324.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -344.41

Frequency: 0.0000

Diversity: 303.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(........)((((((..((((((....))))))...............(((.(((((..(((((((((((((((.((..((((((.............(((((((((((((.....((((((((((((...................(((((..(((((((...((((((..(((....(((......)))....)))....))))))...))).....(((((((.((((((((...((((((((((..(((((((((((((((..((((((...((.....))......((((....))))))))))))))).)))))..)))))..))))....))))))(((((....)))))..(((((((((((((..(((((.(((((((((((.(((((((((...))))))))).))..((.((((.........)))).))...((..((((.....))))..))....((..((((..((((.((((((...)))))).))))))))..)).......)))))))))..((.(.(((....))).)))..........)))))...((((.((((((.(((....)))...)).)))))))).........)))))))))))))..((((((((((((...........))))))))..........))))...........))))))))....((((((....).))))))))))))........((((((............))))))))))..))))).(((......)))(((((.((((...)))).)))))..(((..((((.....))))..))).(.(((((........))))).)((((((.((((((((..(((((....)))))(((((.(((.((((.....)))).)))..)))))))))))))))))))))))....))))).)))....))))).))))))))...............)))))))))))).)))))))))))...))))))))(((..(((((.((((.(.(((.(.((((.(((.....))).)))))))).).)))))))))..)))..))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{,{.....,)((((((..((((,...,((((((((((,.........})))))).)))),..(((((((((((,((.{,.(((((({,{((({(,,(,(,,...,,})))}})))})}}}}{((({.{{.......,,,.........,{(((,,.{({((({..((((((..(((....{((......))}....)))....)))))).,,{(,.......}}}|||{{|,|||||,{{,{{((((({..||{{,|{|{{{{{{{..{{{{{|,,,||,,,,.||......{{({....))))))))))))))),)}))),,},||,.((((((({(((,,{(((((((...,.,,,..(((((((((((((..{{....(((((((((,{.(((((((({...})))))))).}}..{(,((({....,,,,.}|||,}}......,|||{.||..||||..,,..,,||..||,|,,((((.((((((...}))))).))))}}))..}).......)))))))))..||.{..{.{(((.((((((.{{..((.((((..((,.....,))..)))).))..}}.))}}})).)))),}}.........)))))))))))))....(.((((((((.,.......,.)))))))).},,,...(((.((((((...)))))).)))...}}}((((({....}.))))))))))))}..,,})}}.})))))),))))))),)))),|{{{,.,(((.{((({......})).}),))}))),))))}})))))){(((((.((((.((((((.,,((((((..((((...,,}},,,,)))))}(((..(((((.(((.({{(((((,.{(((((,,,,(((.({((,,,,,|}}|,}}}..||,(({{{{,,((((((((((.....{||,{||||...,,|{{{{{.(((((....)))))....}))}}),,.,,))))),))),,})))))}}}}..}}}}}}.......))))))))))))).))).)))))..)))....,,.)))))).)))).))))))))))...))))))