Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_KLHL2_0003700
Sequence Length
2378 nt
GC Content
0.3970
AAUCUUACUCUGUUGCCCAGGCUUGGGUGCAGUGGCGUGAUCUCGGCUUACUGCAACCUCCUCCUCCCAGGUUCAAGCAAUCCUGCCUCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAGUACAGGUGUGUGCCACCAUGCCUGGCUACUUUUUGUAUUUUUUGUAGAGACGGGGUUUCGCCAUAUUGUCCAGGCUGGUCUUGGACUCCUGACCUCAGGUCAUCCGCCCACCUUGGCCUCCCAGAGUGCUGAGAUUACAGGCGUGAGCCACCAUGCCCUGCCAACCUUUUGUAAAUUGAAUAGUUUUUCAUGAGAUUUAUGAAAAUGCAGGUUUUAUUUUUCAAAUGUCAUUGAAGGGGAAGCCAACUGUUCCUUUUUAUGGUAUGUUGAAAUACAUAUUUGAAAUGAAUCUUUUAUUUCACCUUAUAAAACAGUUUUAUAAACUCUAUUUAUAAGGGUUUUAUAAGGUGAAAUAAAUAUGGUUCAUUGUGACGACCUAGAAAUUAACCUAGAUUUUCUAGCAAAAUUUUACUUUAGAAUUUAUAAUAUUAACAAGAGCUAAGUUAUUGAAUCCUUACUCUCUACAGACACAGUUCUAGGUGCUUUAUAAACCACUAGCUUAUUUAAUCCUCACAGCAAUCUUAUUUUUAUUAUCCUCAUUUUACAGAUGAGGAAACCAAGGCUUAGGGAAAUUACGUUAACUGCCCAAGGUUGUACAAGCUAGCAUAUGGCAGAGCUGGGAUUCAACCCUGGUAUGUCUGAAUCCGCAGCCCAAACCACCACAUUCCCUUGUGAGGCAGAUUUGCAAGAAAGGUUAUUUUACAAAAGAUUCGUUCUUUGUAAGGUUUUCAAUCAUUGCACUGAUAGUCUUUUCCCCCCUUGGAUGGAGGACGUAUCGGAUAUUAAACUGAUAAGAACAGAUACUACACUUGAUCUUAGCCAAAAGGCCAAGAAGCGAUCUUUUUUCCCCUUGGGAAGAGUGGCCAUAUUUGUGAAAUCAAGGGAAAAAAAUUUUUUAAGUAUUUAAGAAUUACUAAUUUUACAAGUUUCUGGAAAUGGGUUGAGGCAUAAAAUCCUGGAAUUUGAUCCGAAAUAAACUAUUUAUUUAGAAUUCAGAGCUAUCUAUAUCAUAAACCAAUUCUGUCUCUCUUUUUUUUUUUUUUUCUGAGACGGAGUCUUGCUCUGUCUGUCAUCCAGGCUGGAGUGCAGUGCUGCGAUCUCAGCUCACUGCAAGCUUCGCCUCCCAGGUUCAUUGCCAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAACUGGGACUACAGGUGUCCAUCACCAUGCCUGGCUAAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACUGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUUGUGAUCCGCCCGCCUCUGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGCAUGAGCCACUGCGCCCGGCCCAAUUCUCUCUUUUUAAAAAAAUGUUGGUCAUAUAUUCAGAUUGGCUAGCAUUUGAGAUUUCUUUAGUUUCCAAAUAAAGCAGGGCUUUUUUCCUUACUCCAUAAGGAACAACCCUCUAAUGUUUCACAUGAUAUGACAUGUAGGAUAUGACAAUAUGACAUCAUGUUCUUUAUCUGAUUUAUAUAAUCAAAAGGUUUUACAAAUUUAAGUACUGAUGGUGUCAUACCAUAUAAGGAAUAGAUUUUUUUAAGCCUAAAAUACCACCAUGUAAAACAAGAAUGAUUCAACUAAGUGCGUGUAUAUUAAGGCAGCUUCCCUCCUUGCACUGCUACUGUGCUGUUGUAUAAACAAAUCACUGAAGGUACAUCCCCAGGUGUCUCUGAGUUUGUUUGGGUUUGUCUUGUUAGUUCUUGCCUGGAGGUGUGCAAUUGGUUUUCUCAUUCUUAAGUUAGAUUAAAUUAAGAAAAACCUUUUUUAAGCAGUUUGAAACUAUGAUAAUGGAAUGUUGAUGUUAGUGGAUUUUCUUUUUAAUUCCCAAACAGAGCAACAUUUUGCAGAUGUUGUACUUAGUGAAGAAUUUCUCAAUCUUGGCAUCGAACAAGUGUGCAGCUUAAUCUCAAGUGACAAACUUACCAUUUCUUCAGAAGAGAAGGUAUUUGAAGCAGUAAUAGCAUGGGUGAACCAUGACAAGGAUGUGAGGCAAGAGUUUAUGGCCCGACUGAUGGAACAUGUACGGUUACCUUUGCUUCCUCGGGAAUAUUUAGUUCAGAGGGUUGAAGAGGAAGCAUUGGUCAAGAAUAGCAGUGCUUGCAAAGAUUACCUCAUUGAAGCAAUGAAGUACCAUUUGCUGCCAACAGAGCAGCGUAUAUUAAUGAAGAGUGUCCGGACCCGGCUGAGGACACCCAUGAACCUUCCCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-657.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -703.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 586.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((((....((((.(((((((((((((.(((((((.((..((((((..........((((((....(((..((((.((((.((((..(....)..))))))))..))))....)))......)))))).(((.....)))....)))))))).))))))).))))..((((.((((((((((..(((((.((((..(((((....(((((....((((((((......(.((((((((((..((((((......))))))((((.....(((((((((((..((........))..)))))))))))..))))((..((((((((....(((((((((((((((........)))))))))).(((((((......)))))))...((((((((.((((((((((((((((((((..(((((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))...))))))))))))).((((((((......(((((...)))))..((((((((...))))))))............((((.((((..........))))))))............))))))))(((............)))........(((((.((..................(((((((((...)))))))))..((((((....((((((..((.....(((((....(((((....)).)))....))))).(((((((((((((........)).))))))).)))).....((..((((......)))).))(((...(((((((..((..((((((((((.((.....))))))))))))..))..)).))))))))...))..)))))).)))))).)))))))..((((((........)))))).))).)))))..))...)))))))))))...))))))))..))).((.((((((((...)))))))).))(((.(((((((((((...((.........(((((((....)))))))...)).)))))))))))...)))....(((((((((((........((((......))))(((((((...))))))).((...((((((..................((((((((((...................))))))))))...))))))....))....((((.(((((((((((..((.......)).))))))..)))))))))....(((.....))).......)))))))))))...))....)))))....)))).)))))..)))).)))))).))))...........................((((((.(((((..((((...(((((...((((.(...).)))).)))))...))))..).)))).)))))).(((((......))))).....(((....))))))))))))))))......((((((.......((((((((((((...........))))))))))))((((((.....)))))).....(((((...))))).(((((((.....)))))))(((((((((.((((((.(((((......))))).)))))).....(((((((((((...........(((((.((.((((....)))).)).))))).........)))))))))))((((((((((((.....))))))).((((..((((....((((((......(((...))).......))))))..)))).)))).((((((.((((((.((((((..(((((....)))))......(((((..(((((((((.(((((((...((((....................))))....))))))).)))))))....((((((.....((((((...........))))))))))))....((((((.........((((....))))(((((((.((((.(.(((.((.......)).)))).))))...))))))).((((.((.((((.(...((.((((.........)))).))...).)))))).)))))))))).))..)))))((((..((((.((((((...)))))).)))))))).)))))).....(((((.....))))).)))))).).))))).......)))))(((((.....((((((.(((....)))...)).)))))))))............)))))))))))))))((((((((...........))))))))(((((...(((.((((((...)))))).)))...)))))...))))))))..............((((.((((((............))))))........)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,,,.((((((((,...((({{(((((((((((((.(((((((.({..((((((..........((((((....(((..((((.((((.((((..(....)..))))))))..))))..}|)},......)))))).(((.....))}....}))))))).))))))).))))..{(((.((((((((((..(((((.((((,,({{{(|||,..(((....((((((((......{.((((((((((,,((((((......)))))){||{{,..,,{{((((((,,{{(({{{{{(((((({...)))))))),..,,{({{{{.,{((((((,,,,,,|||||||{|||}}}.,}}})))}}}}}}},|(((({{......))))))},,,|(((((((.((((((((((((((((((((..{((((((((.....)))))))),))))))))))))))))))))...)))))))|{{{{.,((((((((......(((({...)))))..((((((({...))))))))............((((.((((..........))))))))............)))))))).|,}}}},,.,,.,{|||,,......,{{{{.{,,.................(((((((({...}))))))))..{,,,((,..,({({{,..,|.}|,.{{|||..,}|||||...,}}|}),...}))),|.((((((((((({{........)}.))))))).)))).....,,..((((......)))).))|}}...{((((({..{{..(((((((({{{((.....))))))))))))..}}..)).))))){||{{,||{{||||||.,,,,))..})))))}.||||||........|||,}}.,..},}..........))))))))))}...))))))))..)))..,.{(((((((...)))))))}|}}|{{.(((((((((((..,{{,{,,.....|||||,(,,,.}}}}}}}.},)).)))))))))))...}}|....{((((((((((........((({......}}},((((((,...})))))).((...((((((..................((((((((((...................))))))))))...))))))..,.}}....((((.(((((((((((..((.......)).)))))),.}))))))))....||{.....))).......)))))))))))}},}},...}))))....)))).)))))..)))).)))))).)))}...........................((((((.(((((..((((.,.(((((...((((.(...}.)))).)))))...))))..).)))).)))))).(((((......))))).....(((....))))))))))))))))......,(({{{.......((((((((((((...........))))))))))))((((((.....)))))).....{{(((...)))}}.(((((((.....)))))))(((((((({.((((((.(((((......))))).)))))).....(((((((((({,,,{{,{,..,((((,.,,.||||,...)}}|.}}.}}}}},,,}.,...)))))))))))||,,...{|{,{{{{{,|||},,}.((((,{.((({{{((({{{,...,,,,,..,.}},......})),)))}}}.}}.}))).((((({,((((((.((((((..{((((.,,,}}}},.,,,..,{(((,,,,(((((((.(((((({...((((........,,......},..))))....))))))).)))))))..,,|||{({..,,{({((((,{{{,.,|,,.|||||||}}}}},,}}||||,,,||}},.,}||,|,,..}})}||((((({(((({(,(((.,{,,,,,..},.}},}.,}}|,.{||||||||,{{|,||}||||.|,..||}||||}..}}.,}.,}))}))}}}},}))|||.||},||||,,.,,.,))),,||,|,,((((.((((((...}))))).)))),,}}.)))))).....(((((.....))))).)))))).).))))),||,||||||||,((({,,,..{{{{||.|{{,,,.,,||..}}|}))})}})|{{{.....,,,,))))))))),)))))|(((((((.{.......,.))))))))(((((...(((.((((((...)))))).)))...))))),},}))))))).},,|,.......,|,,{.((((((............)))))),,.,,,..}}},.....
Back