Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_KLHL2_0004600
Sequence Length
2746 nt
GC Content
0.3948
AUAACUGGGAUGUCAGCAUUAUGAGCAACUCUUUUGGUAGCCACACAAUGGUUUAUGACACAGUCUCUUGGUUUUAUAUAAAUAUUCCUGCCUUCCUGUCCCCCCAUUGCACGUUCUCCUUGUCUCCUUUAUCCCUGAUUCCUGGAGACCCAAAUCGUUACCCCAUUUUCCCUCUCUUGGGUGAGUAAAGGACAAAUAUUACUACUGUUCUCUGUAUGUAAUAGCACAGUUUUCCUUUUCAUCUUCAUUUUAAUGUGUAAAAGUGAACUAUUGCGUGGAAAUAGAAAUCUUAUAUUCAAACUUUGAGGAUUAUGAAAUCUAUAACUCAGUGUUAUUUAUCAAAAAAUUUAAAAAAUGUUCCCUUCUGAAAUUUUAGAAAAAUUGGUCUUCAUCAGAUAUAUCAUCUAAGACUCUUUCAACUAUUGUCUCUUGGGCAGUUUUGAAGUUUUGAACAGAACCCUAAAUACAAGGUUUAUCUUAACAUGCAUCCCAAUUCUGUAAUUUUUACAACCUUGCCCCCCCCGCCGUUUUUGGGUGGUCAGAGGUGAGGGUAUUGUAUAUUUUCUUUAUUAAUUAUGUUUAUUUUAUUUAUUUAUUUUUUGAGAUAGAGUGUCGCUCUUUCGCCCAGGCUGGAGUGCAUUAGUGCAGUCUCAGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCAGGUUCAAGAGAUUCUCAUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCACGCACUAUCAUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUGGUAGAGACGGGGUUUCGCCAUCUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGAUCUCAAAGCGAUCCAACCGCACUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGAGUGAGCCACCGUGCCUGGCCAACCAAAAUGUUGUCUGUUUGUUUGUUUGUGAGACAGAGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGAAGUGUAAUGGUGCAAUCUCGGCUCACUGCAACUUCCACCUCCUGGGUUCAAGUGAUUCCCAUGCCUCAGCUUCCCCAGUAGCUGGGAUUACAGGUGUGCACCACCAUGCCUGGCCAAUUUUUAAUUUUUGUUAUUUUUUGUGGAGAAAGGGGACUUGCUGUUAACCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGAGCUCAUGAUCUGUCCGCUUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGACGUGAGCCACCAUACCUGGCCAAGAAGAAUAACAGGCCUGAAAAAAAUUAUGUAGUUGGUUUAUGUUCAGUCUUCUUUUAAGACUUUUAAAAUUCAUUCUGCUCUCCAGUUACCAAAAACUAAAAUGGGCUUCUUUUUGGAAAUUUGGGAUUUGCUCUCUGAUUCAGGAAUCAUUUUUUGCUUUGUACCCAUCUUUCUUUAAUUCUAAGUACAGGUAGGUCAUUGCCUAGUCAAGGCUGCAAAUCUCCUCUUUUUGUGUAUAUGAGUUACUCCAUAUUCUGUUUGUUUUUAUUUUUUGUUUCUUUCUAACAUCUAUUUUUCCAAUCAUUAUCUCUUCUUUUCCUGAAGGUCCUUGCCAUUCUUUACAGUUUUUGAUUUGAGACAUCAUUAAUGUUUACAUUAUUCUGAUUUGAUGGCUGUUAUUUUCACUGUUGCCAGAGAGUGUCUGUGCAUACUCAGUAAAAGGCAGACACAUUGAUUUCUAAAUUCUAUCCAUUUAGCAAGACCAUAGAUCAGGUUCCAGGAAGCUUUCACUAAAUUACGGCAGCUUUUCAUUUUCUGAUCAGCAGUAGCAGUUACGUCUAUACUAAUCACAUAAUUUUUCGAUCAUAUGUAAUUGUGUACUCUUCUUGAGUUACUUCAUAAGUCUUGUCUCCUUAGUGAGAUCUAUCAAGUCUUGAAGGGUAGAGACCAUGUCUUAUAUUUCUUAUGUAUAACACCUAACAUAGUUCUGGACACAUAUAGACCGUAGGCAUUUAGUAAAUAGUUGUUGGAUUGAGUUGAGGGAACUUAUAGACCUCAUUUAUUCUCAAAAGUAGACUUUUAUGUAUUUGUUCAUUAUGAUAUCUAGCAUCUCCAUUACAUGUCCUGUUAGGUUGUUUUAUUUGUGGGGCAUCAGGAAAGGUCUCUACUGGAGAUUCGGGAAUCUGUACUCUUGUGAGCUCCAAUUCAAUUACUCCUCCUUUUUCAAUAUUUUUUUUCCUUCUUCCAUCUUUCUUUUAAUACUUACUGUCCGUUUCACUUCACCUACCCAGUAACAUAUGUUUCAUUUCUAUCUUCUCUCCUGGAUUAUGGAGUUCUAAUGCCUGGUCAUUGCAAAAACCAGGAUCUAGUUUAUAGCAAGCCCUAUGACAUACUGCAGCCUUGCCAGUAAUAACUGCGUGCUGUUUUUUUGCUUAAAUAACUGCUUUUGCUUGAAGGAUCAGAAACUUAGUUUCUGAAGUCCUUAUUUUUGACUAAAUGUGCUGGACGAUAGAAUUGUAUUUUUAACGUGUGUCCCCUUGGUUGAUGUUUAUGAAAUGUUGGUUAGGUGGUUAGAUGUUUGUAUUCGCCAGCUCACCCUAUCAUCUUCAUCCUAACACUUCCCACACCAGUGUCUUUGUAGGACAUUUUAAAUCCUGAAUAUGUAAUAGUCAUUUGUUCAAGUGCUUACAUUUCUGCCCUUGUAGUUGAUGGUGGUGGUUGGGGGCCAAGCACCAAAGGCUAUCCGGAGUGUGGAAUGCUAUGACUUUAAAGAAGAAAGGUGGCACCAAGUAGCAGAGUUGCCUUCCAGGAGGUGCAGGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-697.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -751.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 622.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((..((.((((((..(((((..(((((((.......((((((.....((((.........((...............))........))))...))))))............((((((...(((...)))....))))))......((..(((((((((.(((......))).))))..((((((...........)))))).(((((((((((((((((((.....(((((((((((......((.(((.(((....(((((.......)))))....))).))).)).....))))))...))))).....))))..))))))))...................(((((..((((((....)))))).....((((((....((((.....)))))))))).((((((..(((((((...))))))).))))))....)))))(((((..........)))))......))))))).........(((((...))))).((((((((...(((((.......)))))...).))))))).............((((((((((..(((.........................((.(((((...))))).))(((.((((((((((((.....((((((........))))))..((((((((...))))...)))).......(((((.....(((((......)))))....))))).))))).))).))))))).........)))..)))))))))).)))))..))......(((((((((((((..(..(((((((((((((.............(((((((....))..)))))))))))..)))))))..)..)))).)))))))))))))))).)))))..........(((((.(.((((((((...)))))))).).)))))......)))))).))..)))))))....((((..(((.(((((((((((...((((((((((.....(((((((........)))))))....((((((((......))))))))(((((((..((((((((((((((((((..((((....((((((.(((........))).))))))...))))((.(((((((.(((((...((.((((((.....)).))))))...))))))))))))))(((....)))....))))))))))).........)))))))...)))))))........((((((.....))))))........(((....((((((.((((.(((((((..............))))))).)))).))))...))....)))....))))))))))..(((((.((..((((((((((((............((((((....))))))(((((.(((.(((((.........)))))(((.......)))(((((((((((...............((((.......))))........(((((((((((((((..((.....(((((((....((((((.....(((....((((...((((((.....))))))..))))..)))....))))))....)))))))(((....))).(((((.(((((((((.((((...((((..((((((((((......(((((((((((((((((((((.....(((((((.....(((((((.((..........)).))))))).....)))))))(((((.((((((((..............((((((((..............))))))))((((.....))))..(((((..((.((((((((......)))).....)))).)))))))((((((((((((((((((((........(((.(((((((((((((((..((((......((((.((((((((..(((((((.((((.(((((.(((((.((((...........))))))))).)).))).....))))))))).))..)))...)))))...)))).....))))..)).))...))))))).)))).))).)))))))))).......))))))))))((((......((((..(..(((....)))..)..)))).....))))..............................................((((((...((............)).)))))).......................((((........))))..(((...((((((..........))))))...))).((((((......))))))......(((((..(((.(((....)))))).))))).............)))))))).)))))..(((((((((((((...))))))))..)))))..))))).)))))))........)))))))))......)))..))))))).))))((..(.((((.((((((((..(((.((.((((..((((....)))).)))).)).)))....))).)))))...)))))..))......((((((((...)))))))).......)))).))))).)))).)))))...((((.((..........)).)))).))..)).)))))))))))))((((..........))))...)))))))))))..))).))))).....)))))))))))).)).)))))(((....)))..))))))))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,.((((((({.((.((((({{,({({{..(((((((..((((.((((((((((({{{{{{{......(({...{,.....,},....)}}...,))}.......{((((((({......((((((...(((...)))....))))))............,,.{.,..,,,......))),|||.{(((((.,,.(((((((((........))).)))))).....,},,)))))}.,...........}))))))))..))))))))))).))))..,{{{{,.,,.,,..|{{,{,,.|||||,,{{,.|,..}})}|{{|,,,..))),,,|||||||{,,,.,,,,,{,{{,,...((((((....)))))).....((((((....((((.....))))))))))..(((((..(((((((...))))))).)))))|{{..|{...(((((..........))))).}}..}}}.,|||,,,,,....{(({,...,}}||,((((((({...(((((.......)))))...).))))))),,,,,}}},,....,..,,,.,,..,,,...,...,,.......,,,,,,}}}((.(((((...))))).))({{{((((((((((((....,((((((........)))))}..((((((({...))))...)))).......{((((.....(((((......)))))....))))}.))))).))).))))))}.....,,,,,,},,}||||,||{{{,{,|}},},)),,.,((((((((((((({{(..((((((({(((((....,........((((({{....}},.}))))))))))..)))))))}})..)))).)))))))))))))))}.))))}|,.,,.....(((((.(.((((((({...)))))))}.}.))))).||..,})}))).))},})))))),,..{{{{..(({.(((((((((({...{(((((((((.....(((((((........)))))))....((((((((......))))))))(((((((..((((((((((((((((({..((((....((((((.(((........))).))))))...)))){(.(((((((.(((((...{{{((((((.....)).))))))...)))))))))))))}{{{....})}||,.})))))))))}},.......}))))))...)))))))........((((((.....))))))........{{{....(({{{(,((((.(((((({,,.....,},.,..))))))).}}}}.)))}...))....}))....)))))))))},{((((({(,..((((((((((((........,,..((((((....}}||}|{{{{{.|||.(((((.........)))))|{,....,..}}}(((((((((((...((((((..............{(((({{,{((,,,..((((,((((.{{,{,,{......,||||{,....((((((.....(((....((({.,{((((((.....)))))).,))))..)))....))))))....}}}}}}|,,{.(((((((.....)))).))).|,{|||,..((((..((((((((((......((((((((({{((((((({,,.....(((((((.....(((((((.((..........)).))))))).....)))))))(((((.((((((((.....,,{{.,,,.{((({,,,....,,...|||||.}}})}}}((((.....)))}..(((({.,((.((((((((......)))).....)))).)))))))((((((((((,{,(((({{,..{{,,{,(((.((((((((((({{((..((((......((((.((((((((..{{(((({.((((.{((((.((((,{((((...........))))))))).)),}},.....))))))))).}}..)))}..,))))...)))).....))))..)).)),..)))))))},))).))).,)))))),)).,}},..)))))))))}((((...,,,(({{..{..{||,,..))},,)}.}}}}.....,,,}..............................................{(((((...{{............}}.)))))),.,,,|.......,{{{{..,,.,....)))..}}))))..{,{...((((((..........))))))...}}|,((((((......}))))},.....(((((..(({{(((....)))))).))))).....,,...,..)))))))).)))))..(((((((((((((...)))))))}..)))))..}}}}}.}}))))},},,,,,.)))))))))......)))..))))))).)))),,,}}},|,....}}}}}))))).,))))}}))))}((((((...((.(((((.((((((((((.{{.{{{{{{{{{{,,...,,,...|)))|...,,})))),,,,........,{{{,({{{{..|{.||{{|...,}})))}}})))},,}.|,...}).)).)))))).))))))))).)).)))))}..)))))).,..)))))))))))..))).))))).....)))))))))))).,,}))},)||}}}..,,,..})))))))))).)))))))
Back