Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_KLK3_0003000

Sequence Length

660 nt

GC Content

0.5530

GUGUCUAGUCAGAGAGUAGUCCUGGAAGGUGGCCUCUGUGAGGAGCCACGGGGACAGCAUCCUGCAGAUGGUCCUGGCCCUUGUCCCACCGACCUGUCUACAAGGACUGUCCUCGUGGACCCUCCCCUCUGCACAGGAGCUGGACCCUGAAGUCCCUUCCCCACCGGCCAGGACUGGAGCCCCUACCCCUCUGUUGGAAUCCCUGCCCACCUUCUUCUGGAAGUCGGCUCUGGAGACAUUUCUCUCUUCUUCCAAAGCUGGGAACUGCUAUCUGUUAUCUGCCUGUCCAGGUCUGAAAGAUAGGAUUGCCCAGGCAGAAACUGGGACUGACCUAUCUCACUCUCUCCCUGCUUUUACCCUUAGGGUGAUUCUGGGGGCCCACUUGUCUGUAAUGGUGUGCUUCAAGGUAUCACGUCAUGGGGCAGUGAACCAUGUGCCCUGCCCGAAAGGCCUUCCCUGUACACCAAGGUGGUGCAUUACCGGAAGUGGAUCAAGGACACCAUCGUGGCCAACCCCUGAGCACCCCUAUCAACCCCCUAUUGUAGUAAACUUGGAACCUUGGAAAUGACCAGGCCAAGACUCAAGCCUCCCCAGUUCUACUGACCUUUGUCCUUAGGUGUGAGGUCCAGGGUUGCUAGGAAAAGAAAUCAGCAGACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-225.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -239.41

Frequency: 0.0000

Diversity: 171.96

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(..(((((.(((((...((((((((..((((((((.(((((((..((((((((((((..(((((.((((((((.(((........)))..)))).)))).).))))))))))))))))..))))......))).)))....((((......)))).....)))))..))))))))((....)).....))))))))))...)(((((((.(((....((((((..((....(((((....))))))).))))))))).))))(((........))).((.((((....))))..)).(((((((...((((((.......))))).)...)))))))......(((((.....((((((...))))))....)))))......(((((((..((((((((...(((((....((....(((((((((...))).))))))...))....)))))....)))))))).((((((((....(((....)))......).)))))))(((..((.....))..))).((((.((((((....(((.(((...(((((...(((((......))))))))))))))))(((((..((((...))))((((........))))..)))))...)))))).))))...........))))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(,{(((((.(((((.,{((((((((..(((((..,.{({((((..((((((((((((..(((({.((((((((.(((........)))..)))).)))).}.})))))))))))))))..))))..,,...,},}||{|..((((......)))).,,,,)))))..)))))))){(....||...,,}}}})}}))}..,}{{(((,{.{(({,..{|||||..||,...(((((....})))))}.})))))|||,,|||{,,........|||.((((((((..{||{(((...,|||,||}}}|,,|||}}}}},,),|||{.,{{,,,,,,)}}.))}}}|||,|,,.((((((...))))))..,,})))},,|||,{((((({..((((((((...(((((....{(...,(((((({{{...}},.))))))}..))....)))))....)))))))).(({(((((.,{.{{(,...})}.,.,..}.))))}))|||}}||.,,,,})}}))),((((.((((((....{((.(((...(((((..,(((((......)))))))))))))))}(((((..((({...})))((((........)))),.)))))...)))))).))))...........))))))}}})