Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LIN54_0002900

Sequence Length

489 nt

GC Content

0.4928

GCAGUGAAAUCAACUGUGCAGACCAUCACUGUUGGAGGAGUGAGCACAUCACAGUUUAAGACAAUUAUUCCUCUGGCAACUGCUCCCAAUGUCCAGCAGAUUCAAGUGCCUGGAAGCAAGUUUCAUUAUGUCCGACUUGUUACUGCCACAUCAGCCAGUAGCUCAACCCAGCCAGUUAGUCAGAAUCCCAGUACAAACACUCAGCCUCUUCAGCAAGCAAAGCCAGUGGUUGUUAAUACAACCCCAGUGCGGAUGUCAGUUCCAAUUGUCUCAGCUCAGGCUGUCAAACAAGUUGUUCCAAAACCAAUCAAUCCAACUUCACAAAUAGUAACUACUAGCCAGCCACAGCAACGGCUUAUCAUGCCUGCCACACCACUGCCACAGAUCCAGCCCAACCUCACUAACCUGCCACCAGGCACUGUCCUGGCACCAGCUCCGGGAACAGGGAAUGUGGGUUAUGCAGUGCUUCCAGCUCAGUAUGUUACUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-114.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -124.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 103.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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