Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LIN54_0003900
Sequence Length
2953 nt
GC Content
0.3386
GUAGUUGUCAGUGUUAAGUUUAGUCAGAGUAUUGAGACUGUUAGGGUAUAGAUAGCAGGCAACGGUGGAAGAUGGAGGCCAUCUUGAAAAAUGAAGAAAAGAGGUGACCUUUGAAGCCAGAGGCAGUAACAGAGGUAUAAUUAUAUGUAAUAACAGAUAUAUAAACACUUUCCCAUGUUUCCUGUGCAUAGUAUAUAAGAGUAGUACAUAACUAGCAGUCUGGAACAAUAUAACUCCUUACUAGCUCCUGAAUCUAUCCAACACAGUGCCAAAAAUUACUUGUAUAUAUUAUUUGAUGACAUAUUUUACUACCUUAUUUGUAAGUUUUUUUUCAUGUUUAUCUUAAGCUGCUGAUUCUAUAAACUUGUUAAAGUAAUCUUUGAUGCUUUGUUUUACUUAAUAAUUUUGUUCCAGGAUACUUUAGAAUUCAUAGUGCAAAAAAAUCAUAGUUCCUUAAUGGAACCAAAAGUUAUUAUUUUCAGCACCACUAAAGAAACAUAACCACAAGGGCAAGAUGAGAUUGUUUAUUUGAAUAAUUAAUGUGCUUCUGGUUGUACUGUUUAUAUUUUUUUCUUACUGAUAAGUAUUCAUAUACUCAUGAUUGUGAAAAAUCAGUUUAAAAUGGGGAAAUACUUUAAGCCCAUAAUUGUUAUAGCUAAGGUUAUUUAUUGCUAAUAUGGCUUUCUAAGAAUAUUAAUACUUCUACCUCUAGAGAUUGUUAAUAUUAUAGAUACAAUAGAUACAAUUUUGACUGACUUUAGGGUUUUAAGUCUGUAAACAUACUUGAGAAAUUUGUAUUUCUCUAAAUUUCAUUAGCUUUCUAGAGUAUAAUUAUAGAUUUAUUUGAGUAUGUUAUAGUUUUGCAAGUCGGCCGUUUUUAAAUACAAUAAUGGGUAUGUUUUUUUUUAAGUGAUUUGUAUUUUAUAUACAGUUGGUUUUUGUCAGUAAUGUGCUCUGAGUAUAAAAAAGUAAUAUAUUGUAGGUGUAAGAUGUGUUAUUUAGUUUAAUUUAUAAUUUGAGCACAAAGAGCUAAUAUUUGUCUAGUUCUGUGAUCUAUCAUAACUUCCGGUGUAUUUCUGUUAUUCAUGUUGGUCAUAUUUUUUCAUUUGAGUCACUAUUUCCUAUAAUAAAUAGUUCUUUUACAGUCUCAAUUUUCAUUGCCAAAAGAUAUAAUUAAUAUUUAAUGUUCUUCACACUCUAAAAUUCUUUGAUUUUUAUCCCAGGUAAAUUUCUUCUUUUAACUUUUAGAAGAAGCUGUGUCUUUGUAUAUGGUGAUAAUCGCAAUAUAAAAAAUUGGUAACUCUACACUCCUUGACUUGUGGAGAAUUAUAAUUCAGGUCAACAGUGUGCCAAUAUGUAACUUCAAAUUGGAGAUGAAUUAAAUAUAGUUUCUCUCUUCAAGGAAUUUAAAAUAUAAUAAACAGUUGCUGUAGCCCAGGAGUUUGAGGCUGCAGUGAACUAUGAGUGCACCACUGCACUCCAGUCUGGGUGACGAGAUGAGACCCAGUAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUCACUCACUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAAUCUCGACUCCCUGCAACCUCUGCUCCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUAAGAUUAUAGGUGUGCGCCACCACACCCUGCUUAUUUUUGUAUUUUUGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUCAAGUGUCUGCCUGCUUCAGCCUCCCAGAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGCGCCUGGCCAGGACCCCAUCUUUAAAAGAAGAAAAGUGUAGUACAUAAUAGUUUAGUAAAUAAUAUUUCAGAGCUGUUGCCCUUAUAAUAGUUUCUGUUCUACCAAAUUUUUCUCUUUUGUACCCUAGGGCUUUAACUUAUUUAGUUCUCCCUUAAUCUACUCCUGAUAUUUAGAUCUAAAGUUGAAAAUCUAGUCAUAAGCCUACCUUUAAUGUGUAUUUAUUUAUAUUUUGCAUCCAAGGGCCAAUGUAAUUGUGUAUAUAGGUGGCUUUGUCAUUCGCACUAUACUUUCUUUACUUACUCUUUUUAUUAUUGAGUAAUUUGUUAUUUUGAACAAGAAUAUUACUGUGCCACAGUUUUAUUUUUUCAUUAAGCAUUAUUAUUAAUUUUGUUUUCAUCAUAUGCAUAUAUCCAAGACAUGAAAAUAAGGAAUUGUAAUAAAAUGCAAAGGUAUUAUUAUAUAUGGGAUUAAGGAUAUAAUAAUAUUAAUAUUUUGAUGAAUGUCUGCAUUUUAAAUGUUCUUAACAUUAACACACAGAUAUAUUCUGUUAAGUGAGCUGGUUUUACAUGUGCUACUUUGUGUGAAUCUUUGGUAUAAUUUUGAUUUAAUAGGCAUUUUAUAGAAACAGAUGGUCUUCAUAGUUAUUUAUAUGUUUCAGAUUGCUAAGAAGCCUCGAACGCCAACCUCUGGUCCAGUAAUCACGAAGCUGAUCUUUGCAAAACCAAUUAAUAGUAAAGCAGUUACAGGACAGACAACUCAAGUUUCACCACCAGUUAUUGCAGGUAGGGUUCUUUCACAGUCUACUCCCGGAACUCCAUCAAAGACCAUAACAAUAUCUGAAAGUGGUGUUAUUGGAUCAACUUUAAAUUCUACAACACAGACACCAAAUAAAAUAGCCAUCUCACCUUUGAAAUCGCCAAAUAAGGCAGUGAAAUCAACUGUGCAGACCAUCACUGUUGGAGGAGUGAGCACAUCACAGUUUAAGACAAUUAUUCCUCUGGCAACUGCUCCCAAUGUCCAGCAGAUUCAAGUGCCUGGAAGCAAGUUUCAUUAUGUCCGACUUGUUACUGCCACAUCAGCCAGUAGCUCAACCCAGCCAGUUAGUCAGAAUCCCAGUACAAACACUCAGCCUCUUCAGCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-724.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -783.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 702.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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