Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LMO7_0007400

Sequence Length

922 nt

GC Content

0.4187

UUUGAUUAAUAAGCUUAAACCUGGCGUCAUUAAGAAGAUCAAUAGACUGUCUACACCAAUAGCAGGAUUGGAUAAUAUAAACGUUUUCUUGAAAGCUUGUGAACAGAUUGGAUUGAAAGAAGCCCAGCUUUUCCAUCCUGGAGAUCUACAGGAUUUAUCAAAUCGAGUCACUGUCAAGCAAGAAGAGACUGACAGGAGAGUGAAAAAUGUUUUGAUAACAUUGUACUGGCUGGGAAGAAAAGCACAAAGCAACCCGUACUAUAAUGGUCCCCAUCUUAAUUUGAAAGCGUUUGAGAAUCUUUUAGGACAAGCACUGACGAAGGCACUCGAAGACUCCAGCUUCCUGAAAAGAAGUGGCAGGGACAGUGGCUACGGUGACAUCUGGUGUCCUGAACGUGGAGAAUUUCUUGCUCCUCCAAGGCACCAUAAGAGAGAAGAUUCCUUUGAAAGCUUGGACUCUUUGGGCUCGAGGUCAUUGACAAGCUGCUCCUCUGAUAUCACGUUGAGAGGGGGGCGUGAAGGUUUUGAAAGUGACACAGAUUCGGAAUUUACAUUUAAGAUGCAGGAUUAUAAUAAAGAUGAUAUGUCGUAUCGAAGGAUUUCGGCUGUUGAGCCAAAGACUGCGUUACCCUUCAAUCGUUUUUUACCCAACAAAAGUAGACAGCCAUCCUAUGUACCAGCACCUCUGAGAAAGAAAAAGCCAGACAAACAUGAGGAUAACAGAAGAAGUUGGGCAAGCCCGGUUUAUACAGAAGCAGAUGGAACAUUUUCAAGACUCUUUCAAAAGAUUUAUGGUGAGAAUGGGAGUAAGUCCAUGAGUGAUGUCAGCGCAGAAGAUGUUCAAAACUUGCGUCAGCUGCGUUACGAGGAGAUGCAGAAAAUAAAAUCACAAUUAAAAGAACAAGAUCAGAAAUGGCAGGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-221.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -241.04

Frequency: 0.0000

Diversity: 247.09

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((................(((((((((((((((((((........((((((..((.......))..))))))........)))))))))...((((.((...(((((((..........(((((((((((((((((((........))))))((((((((.((..(((((.((..(..((......))..)..)).)))))....)).))))))))..((((.(((((((((.......((.....))..((.(((((..((((((((((.(((((((.(((.((..((((((..((((((((........)))..)))))..))))))..))(((.((((.......)))))))(((((..(((((((.(((((((.(((((((.(((....(.((((.........)))).)..))))))))...(((.(((((.(((...........))).)))))...))))).)))))))...))))))).)))))...))).))))))).))))))....((((((((((..((...))..)))))))))).))))..)).))).))........(((((((((.((..(((.((.((..(((.((((....)))))))..)).)).)))....)))))))))))..))).......(((.(.((.....)).).))).......(((.....)))...))))))))))......)))........))))))))))....)))))))...)).))))........((((((((....((((....)))).......))))))))(((.....)))....))))))))))(((((..(((((.........)))))..))))).........(((............))).............))))(((...........)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((({{{......,,,....(((((((((((((((((((...,,...((((((..((.......))..))))))...,,...))))))))}...((((.((...(((((((.{{.......((((((((((({,((((((........))))))((((((((.({..(((((.((..{..((......))..)..)).)))))....}).))))))))..((((.(((((((((..,,,..((.....}}..,}|{,..,,..{{{(((({(,(((((({.(((.{{.,(((({(..{(((((((,,,...,,||||,.,}||..||||||{,,|(((((((({(,....}}}}),,||||{..,(({((,.{{||{||.,{(((((.(((....,.((((.,.....,.)))).},,))))))))..,(((.(({{,.|||,,,...,}}..))).)))))},,))),,.))))}}}...,|||}||{||||},..,}}.}})})))}))))))|||.{{||||||||,,{{...)),,)})))}}})}.,,,}}}}||||,.|}}||}}...,,,{{((({.{{..{{{.((.{(..(({.((((....))))}))..)).)).)))....}}}}})))))}}.}}}.......|||,,.,,...,.}},|||,,..|,...{((.....))}...)))))))))}......},,.....,.}))))))))))....)))))))...)).))))..,,,,,.((((((((...,(({,,,..,,}}.,,....})))}}))|||,....))),,.,}))))))))|(((((..(((((.........)))))..)))))|,.......|||,,.,........,}}..........,..,,.)|||,},,.,..,..}})