Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0007500
Sequence Length
1807 nt
GC Content
0.4355
UUUGAUUAAUAAGCUUAAACCUGGCGUCAUUAAGAAGAUCAAUAGACUGUCUACACCAAUAGCAGGAUUGGAUAAUAUAAACGUUUUCUUGAAAGCUUGUGAACAGAUUGGAUUGAAAGAAGCCCAGCUUUUCCAUCCUGGAGAUCUACAGGAUUUAUCAAAUCGAGUCACUGUCAAGCAAGAAGAGACUGACAGGAGAGUGAAAAAUGUUUUGAUAACAUUGUACUGGCUGGGAAGAAAAGCACAAAGCAACCCGUACUAUAAUGGUCCCCAUCUUAAUUUGAAAGCGUUUGAGAAUCUUUUAGGACAAGCACUGACGAAGGCACUCGAAGACUCCAGCUUCCUGAAAAGAAGUGGCAGGGACAGUGGCUACGGUGACAUCUGGUGUCCUGAACGUGGAGAAUUUCUUGCUCCUCCAAGGCACCAUAAGAGAGAAGAUUCCUUUGAAAGCUUGGACUCUUUGGGCUCGAGGUCAUUGACAAGCUGCUCCUCUGAUAUCACGUUGAGAGGGGGGCGUGAAGGUUUUGAAAGUGACACAGAUUCGGAAUUUACAUUUAAGAUGCAGGAUUAUAAUAAAGAUGAUAUGUCGUAUCGAAGGAUUUCGGCUGUUGAGCCAAAGACUGCGUUACCCUUCAAUCGUUUUUUACCCAACAAAAGUAGACAGCCAUCCUAUGUACCAGCACCUCUGAGAAAGAAAAAGCCAGACAAACAUGAGGAUAACAGAAGAAGUUGGGCAAGCCCGGUUUAUACAGAAGCAGAUGGAACAUUUUCAAGACUCUUUCAAAAGAUUUAUGGUGAGAAUGGGAGUAAGUCCAUGAGUGAUGUCAGCGCAGAAGAUGUUCAAAACUUGCGUCAGCUGCGUUACGAGGAGAUGCAGAAAAUAAAAUCACAAUUAAAAGAACAAGAUCAGAAAUGGCAGGAUGACCUUGCAAAAUGGAAAGAUCGUCGAAAAAGUUACACUUCAGAUCUGCAGAAGAAAAAAGAAGAGAGAGAAGAAAUUGAAAAGCAGGCACUUGAGAAGUCUAAGAGAAGCUCUAAGACGUUUAAGGAAAUGCUGCAGGACAGGGAAUCCCAAAAUCAAAAGUCUACAGUUCCGUCAAGAAGGAGAAUGUAUUCUUUUGAUGAUGUGCUGGAGGAAGGAAAGCGACCCCCUACAAUGACUGUGUCAGAAGCAAGUUACCAGAGUGAGAGAGUAGAAGAGAAGGGAGCAACUUAUCCUUCAGAAAUUCCCAAAGAAGAUUCUACCACUUUUGCAAAAAGAGAGGACCGUGUAACAACUGAAAUUCAGCUUCCUUCUCAAAGUCCUGUGGAAGAACAAAGCCCAGCCUCUUUGUCUUCUCUGCGUUCACGGAGCACACAAAUGGAAUCAACUCGUGUUUCAGCUUCUCUCCCCAGAAGUUACCGGAAAACUGAUACAGUCAGGUUAACAUCUGUGGUCACACCAAGACCCUUUGGCUCUCAGACAAGGGGAAUCUCAUCACUCCCCAGAUCUUACACGAUGGAUGAUGCUUGGAAGUAUAAUGGAGAUGUUGAAGACAUUAAGAGAACUCCAAACAAUGUGGUCAGCACCCCUGCACCAAGCCCGGACGCAAGCCAACUGGCUUCAAGCUUAUCUAGCCAGAAAGAGGUAGCAGCAACAGAAGAAGAUGUGACAAGGCUGCCCUCUCCUACAUCCCCCUUCUCAUCUCUUUCCCAAGACCAGGCUGCCACUUCUAAAGCCACAUUGUCUUCCACAUCUGGUCUUGAUUUAAUGUCUGAAUCUGGAGAAGGGGAAAUCUCCCCACAAAGAGAAGUCUCAAGAUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-473.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -508.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 492.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....((((((((.............((((((((((........((((((..((.......))..))))))........))))))))))))))))))...))))((((..........(((((((((((((((((((........))))))((((((((.((..(((((.((..(..((......))..)..)).)))))....)).))))))))..((((.(((((((((.......((.....))..((.(((((..((((((((((.(((((((.(((.((..((((((..((((((((........)))..)))))..))))))..))(((.((((.......)))))))(((((..(((((((.(((((((.(((((((.(((....(.((((.........)))).)..))))))))...(((.(((((.(((...........))).)))))...))))).)))))))...))))))).)))))...))).))))))).))))))....((((((((((..((...))..)))))))))).))))..)).))).))........(((((((((.((..(((.((.((..(((.((((....)))))))..)).)).)))....)))))))))))..))).......(((.(.((.....)).).))).......(((.....)))...))))))))))......)))........))))))))))..............((((..((((((........(((((((((((((((...((((((.((((((.((((...........((((((((..(((((((..(((((.........)))))..)))))))....(((((.((.......................((((.(((((.(((.((((..(((((.(((..........))).)))))......))))...))).)))))(((((........(((((.(((((...........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((...)))...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..((((..((.((..(.....)..)))).))))...(((.(.(((.................))).).)))....(((((((((((............((((.(((.....)))..)))).((.(((((.....))))).))...((......)).........)))))))))))...)))))))((...........))....))))).))))))))))))))..(((((((.................))))))).)).)))))...((((.((((((.....((((...))))..)).)))).))))((((...))))((((((((((.........)))))))..)))))))))))))))..)))..))).)))))).....)))))))........((((((.(((((((..................(((((((..((..((..((.....))..))..)).......((((((............))))))..((((((.(((((...(((((..((((((...(((....)))....))))))...)))))....((((....))))....))))).))))))...)))))))))))))).)))))))))))))).....))))))..)))).....(((((....))))).....(((....)))......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.({.((((((((.............((((((((((...,,...((((((..((.......))..))))))...,,...)))))))))))))))))),},))))(((({{{.......((((((((((({,((((((........))))))((((((((.({..(((((.((..{..((......))..)..)).)))))....}).))))))))..((((.(((((((((..,,...((.....}}..,}|{,..,,,.{{{(((({(,(((((({.(((.{{.,(((({(..{(((((((,,,...,,||||,.}}||..||||||,,}|((({(((({{,....}}}})}}||||{..,(({(({.{{||{||.,{(((((.(((....,.((((.,.....,.)))).},,))))))))..,(((.(({{,.|||,,,...,,}..))).))))),,,)))},.))))}}}...}|||}||{||||},..,}}.}})})))}))))))|||.,{||||||||,,{{...)),,)})}}}}}}}.,,,}}}}||||,.|}}||}}...,,,{(((({.{{..(({.((.{(..(((.((((....))))}))..)).)).)))....}}}}})))))}}.}}}.......|||,,.,,..,,.}},|||.,..|,...{((.....))}...}))))))))}...,..},,.....,.}))))))))))..,,...,|||...((((..(((((,..,{{{{,((({((((({{,,,..,}{(((((,{{{{{{.{{((......,,,..{{((({((,.{((((((..(((((.........)))))..))))))}..,,|,,{{|||,,.........,,..........,,.{,(((((,((,.((({,,(((((.{{{,{.....,,.}}).))}}}......|,...,,})}.}})))||,,.........(((((((((((((.........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((...})}...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..||{{,,((,((..(....,|..|},}||,},...(((.(.(((.................))).).)))....(((((((((({......,,||||||,..|||.....||},.,}}}.{{.(((((.....))))).))...{{......,}{{,...,}})))))))))))...)))))))(({{(,,(((((........)))))))))))}|||{|||.,(({(({{.....{({,.....,,,|||||||{||.|||||}{,((((.((((((.,...{(((...))))}.))},))).)))),||,...,|||((.(((((((.,,...,,.)))))))..,,,|||||}|||}}}..||},.}.},))))))||||,}||||||......|||||{||||||}}}})...}},..,)))}.,,,{{{((((,.({..,,.,|{,,,..)),,)),,))|{(((....)))||,..({{.....))).,),.((((((.(((((..,({{{{..{{|||{...,{|,,,,))),,..,,}}}}...)))))}.}}||||,...,}}}...,|||}}.}}}}}}..,)))}}}))))))))))}}))})))))))},,,.,})))))..)))).....(((((....))))).....(({....)))..})),))))
Back