Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0008800
Sequence Length
1736 nt
GC Content
0.4384
GAUAAUAUAAACGUUUUCUUGAAAGCUUGUGAACAGAUUGGAUUGAAAGAAGCCCAGCUUUUCCAUCCUGGAGAUCUACAGGAUUUAUCAAAUCGAGUCACUGUCAAGCAAGAAGAGACUGACAGGAGAGUGAAAAAUGUUUUGAUAACAUUGUACUGGCUGGGAAGAAAAGCACAAAGCAACCCGUACUAUAAUGGUCCCCAUCUUAAUUUGAAAGCGUUUGAGAAUCUUUUAGGACAAGCACUGACGAAGGCACUCGAAGACUCCAGCUUCCUGAAAAGAAGUGGCAGGGACAGUGGCUACGGUGACAUCUGGUGUCCUGAACGUGGAGAAUUUCUUGCUCCUCCAAGGCACCAUAAGAGAGAAGAUUCCUUUGAAAGCUUGGACUCUUUGGGCUCGAGGUCAUUGACAAGCUGCUCCUCUGAUAUCACGUUGAGAGGGGGGCGUGAAGGUUUUGAAAGUGACACAGAUUCGGAAUUUACAUUUAAGAUGCAGGAUUAUAAUAAAGAUGAUAUGUCGUAUCGAAGGAUUUCGGCUGUUGAGCCAAAGACUGCGUUACCCUUCAAUCGUUUUUUACCCAACAAAAGUAGACAGCCAUCCUAUGUACCAGCACCUCUGAGAAAGAAAAAGCCAGACAAACAUGAGGAUAACAGAAGAAGUUGGGCAAGCCCGGUUUAUACAGAAGCAGAUGGAACAUUUUCAAGUAAUCAGAGGAGGAUUUGGGGCACCAAUGUGGAGAACUGGCCAACUGUACAAGGAACUUCAAAGUCCUCUUGUUAUUUGGAAGAGGAAAAAGCAAAGACAAGAAGCAUACCCAACAUUGUAAAGGAUGAUCUUUAUGUGCGCAAGCUCAGUCCAGUCAUGCCAAACCCAGGGAAUGCUUUUGAUCAGUUUCUUCCCAAAUGUUGGACCCCAGAAGAUGUGAACUGGAAAAGAAUAAAAAGGGAAACUUAUAAGCCAUGGUAUAAAGAAUUUCAGGGAUUCAGUCAGUUUUUACUGCUUCAGGCCCUCCAAACAUACUCUGAUGACAUCUUGUCUUCUGAAACACAUACCAAAAUUGAUCCCACUUCUGGCCCAAGGCUCAUAACCCGCAGGAAGAAUCUCUCUUAUGCACCAGGCUAUAGAAGAGAUGACCUCGAGAUGGCAGCCCUGGAUCCUGACUUAGAGAAUGAUGAUUUCUUUGUCAGAAAGACUGGGGCUUUCCAUGCAAAUCCAUAUGUUCUCCGAGCUUUUGAAGACUUUAGAAAGUUCUCUGAGCAAGAUGAUUCUGUAGAGCGAGAUAUAAUUUUACAGUGUAGAGAAGGUGAACUUGUACUUCCGGAUUUGGAAAAAGAUGAUAUGAUUGUUCGCCGAAUUCCAGCACAGAAGAAAGAAGUGCCGCUGUCUGGGGCCCCAGAUAGAUACCACCCAGUCCCUUUUCCCGAACCCUGGACUCUUCCUCCAGAAAUUCAAGCAAAAUUUCUCUGUGUACUUGAAAGGACAUGCCCAUCCAAAGAAAAAAGUAAUAGCUGUAGAAUAUUAGUUCCUUCAUAUCGGCAGAAGAAAGAUGACAUGCUGACACGUAAGAUUCAGUCCUGGAAACUGGGAACUACCGUGCCUCCCAUCAGUUUCACCCCUGGCCCCUGCAGUGAGGCUGACUUGAAGAGAUGGGAGGCCAUCCGGGAGGCCAGCAGACUUAGGCACAAGAAAAGGCUGAUGGUGGAGAGACUCUUUCAAAAGAUUUAUGGUGAGAAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-461.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -496.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 492.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...........((((((((((((((((((.(((((...((((((...((((((...))))))..((((((........))))))((((((((.((..(((((.((..(..((......))..)..)).)))))....)).))))))))(((((((...((.(((..................)))))..)))))))((((((.(((((((.(((.((..((((((..((((((((........)))..)))))..))))))..))(((.((((.......)))))))(((((..(((((((.(((((((.(((((((.(((....(.((((.........)))).)..))))))))...(((.(((((.(((...........))).)))))...))))).)))))))...))))))).)))))...))).))))))).))))))(((.((((((((((..((...))..)))))))))).)))......(((((((.......(((((((((.((..(((.((.((..(((.((((....)))))))..)).)).)))....)))))))))))...................((((((...(((....)))((((..........................))))........((((((.((((((....(((.....((((((((((((...............(((((((((((.(((((((((.....(((.(((((((((..........(((((((......(((((((.(.....).))))))).........((..((((((((.(((....(((....(.(((((.....((.((....)).)).....))))).)))).....))).))))))))..)))))))))((((...((((.....((((..........)))).....))))....))))...(((((........))))).((((((...)))))).))))))))))))))))))))).)))))........))))))..)))).)).))))))........)))....))).))).))))))((((...)))).......((.(((....((((((.((((((.....)).)))).))))))..))))).))))))((((((((.(((((((..(((((.......)))))..)))))...)))))))))).))).))))))))))..)))))..)))))))))))...((((.(((((.(((((..........((.((((((((..........)))))))).))......((((((((((((((((((....)))))......).)))))..))))))).....(((.(((((.........(((((...(((((.((((((.(((........(((((((((((((.((((...(((((.......)))))...((((((....((......))...)))))).(((........)))...(((..((.(((((.........))))).))..)))...)))).)))))...........(((((..(....)..)))))...)))..))))).......(.((((((((((..(((((....(((((.(......).)))))...))))).))))))))))))))..)).))))..)))))...))))).........))).)).))))))))..))))).)))).........))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...........((((((({((((((((((.(((((...((((((,...{{{(((((((((({,.((((((........))))))((((((((.({..(((((.((..{..((......))..)..)).)))))....}).)))))))),,((((.{{(((((((..,....{{.....}}..}}}||..,|,,|||(((({(,(((((((.(((.{(..(((({(..{(((((((,.....,.))}|.,}))}..}}||||,,}|((({((((,{,....}}}})}}||||{..,(({(({.{{||{||.{{(((((.(((....,.((((.,.....,.)))).},,))))))))...(((.(({{{.{||,,....,,,..))).))))),,,)))}}.))))}}}...}|||}|||||||},..}}}.}})}))),))))))|{{.{{({((((((..((...))..))))))}))).}},,,,,||||{,||,||,,...,,{((((((.{{..(((.((.((..(((.((((....)))))))..)).)).)))....}}})))))))}|.|,,.......}},,,..{|,{{{,|,|{|....||...(((.....}}}...,))}}))}},..,,,,|},.......{||||||||||((.,,.(((.....((((((((((((...,..{{{{{{{{{((,{{((((((.(((((((,,{{..,(((,((,,{{{{{...}|.}}}}.||..||}},,},|||||||,|}}}}})}))}}|||,.,{{{...((..((((((((.(((.....,(,...(,(((((.....((.((....)).)).....))))).)).......))).))))))))..)).)))),}}|||..,{((({{,..(({(,,,..,,,,,||||....,|||.....||||,.|||,,,..|,..,|}}},..{,{|||,..}})))).})))))))})))}}))))})).}})))...,,}..}}})}},.)))),,).))))))........}}}....}))..))}))))))||,(,,.||||,,,....((.(((....(((((({({{,((.....)).}})).))))))..))))).}||||.||||||||.||(((((..(((((,......)))))..))))).,})}))))))))},},.,.}.))))))..)))))..))))))))))),{,((((.(((((.(((((..{{{,,...,{|(({({{{{.,{,...,..,}}}||,}|,},,,|},{||||||}}}|,,|||,({(((({{..,..{((......))},}),,))}}}}})|.{(((...........})))..((((((((....))))))))...((((((((,,(((((((..{,...(((((.......)))))...,||..{{{...(((((((((.....(({{,(((........,,....,.....,.,....{||,........})})))}))))..,..)))),,))))..},....|((((..{....)..))))|((((({.,,,{(,.....))|.((((((((((..(((((....,((((.(......).))))}...))))).)))))))))),.)))))),|{{{......,...))).}..)))))))))).,))))))))))..))))).)))).,,,.....))))))).
Back