Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0011300
Sequence Length
2764 nt
GC Content
0.4446
GCACUCGAAGACUCCAGCUUCCUGAAAAGAAGUGGCAGGGACAGUGGCUACGGUGACAUCUGGUGUCCUGAACGUGGAGAAUUUCUUGCUCCUCCAAGGCACCAUAAGAGAGAAGAUUCCUUUGAAAGCUUGGACUCUUUGGGCUCGAGGUCAUUGACAAGCUGCUCCUCUGAUAUCACGUUGAGAGGGGGGCGUGAAGGUUUUGAAAGUGACACAGAUUCGGAAUUUACAUUUAAGAUGCAGGAUUAUAAUAAAGAUGAUAUGUCGUAUCGAAGGAUUUCGGCUGUUGAGCCAAAGACUGCGUUACCCUUCAAUCGUUUUUUACCCAACAAAAGUAGACAGCCAUCCUAUGUACCAGCACCUCUGAGAAAGAAAAAGCCAGACAAACAUGAGGAUAACAGAAGAAGUUGGGCAAGCCCGGUUUAUACAGAAGCAGAUGGAACAUUUUCAAGUAAUCAGAGGAGGAUUUGGGGCACCAAUGUGGAGAACUGGCCAACUGUACAAGGAACUUCAAAGUCCUCUUGUUAUUUGGAAGAGGAAAAAGCAAAGACAAGAAGCAUACCCAACAUUGUAAAGGAUGAUCUUUAUGUGCGCAAGCUCAGUCCAGUCAUGCCAAACCCAGGGAAUGCUUUUGAUCAGUUUCUUCCCAAAUGUUGGACCCCAGAAGAUGUGAACUGGAAAAGAAUAAAAAGGGAAACUUAUAAGCCAUGGUAUAAAGAAUUUCAGGGAUUCAGUCAGUUUUUACUGCUUCAGGCCCUCCAAACAUACUCUGAUGACAUCUUGUCUUCUGAAACACAUACCAAAAUUGAUCCCACUUCUGGCCCAAGGCUCAUAACCCGCAGGAAGAAUCUCUCUUAUGCACCAGGCUAUAGAAGAGAUGACCUCGAGAUGGCAGCCCUGGAUCCUGACUUAGAGAAUGAUGAUUUCUUUGUCAGAAAGACUGGGGCUUUCCAUGCAAAUCCAUAUGUUCUCCGAGCUUUUGAAGACUUUAGAAAGUUCUCUGAGCAAGAUGAUUCUGUAGAGCGAGAUAUAAUUUUACAGUGUAGAGAAGGUGAACUUGUACUUCCGGAUUUGGAAAAAGAUGAUAUGAUUGUUCGCCGAAUUCCAGCACAGAAGAAAGAAGUGCCGCUGUCUGGGGCCCCAGAUAGAUACCACCCAGUCCCUUUUCCCGAACCCUGGACUCUUCCUCCAGAAAUUCAAGCAAAAUUUCUCUGUGUACUUGAAAGGACAUGCCCAUCCAAAGAAAAAAGUAAUAGCUGUAGAAUAUUAGUUCCUUCAUAUCGGCAGAAGAAAGAUGACAUGCUGACACGUAAGAUUCAGUCCUGGAAACUGGGAACUACCGUGCCUCCCAUCAGUUUCACCCCUGGCCCCUGCAGUGAGGCUGACUUGAAGAGAUGGGAGGCCAUCCGGGAGGCCAGCAGACUUAGGCACAAGAAAAGGCUGAUGGUGGAGAGACUCUUUCAAAAGAUUUAUGGUGAGAAUGGGAGUAAGUCCAUGAGUGAUGUCAGCGCAGAAGAUGUUCAAAACUUGCGUCAGCUGCGUUACGAGGAGAUGCAGAAAAUAAAAUCACAAUUAAAAGAACAAGAUCAGAAAUGGCAGGAUGACCUUGCAAAAUGGAAAGAUCGUCGAAAAAGUUACACUUCAGAUCUGCAGAAGAAAAAAGAAGAGAGAGAAGAAAUUGAAAAGCAGGCACUUGAGAAGUCUAAGAGAAGCUCUAAGACGUUUAAGGAAAUGCUGCAGGACAGGGAAUCCCAAAAUCAAAAGUCUACAGUUCCGUCAAGAAGGAGAAUGUAUUCUUUUGAUGAUGUGCUGGAGGAAGGAAAGCGACCCCCUACAAUGACUGUGUCAGAAGCAAGUUACCAGAGUGAGAGAGUAGAAGAGAAGGGAGCAACUUAUCCUUCAGAAAUUCCCAAAGAAGAUUCUACCACUUUUGCAAAAAGAGAGGACCGUGUAACAACUGAAAUUCAGCUUCCUUCUCAAAGUCCUGUGGAAGAACAAAGCCCAGCCUCUUUGUCUUCUCUGCGUUCACGGAGCACACAAAUGGAAUCAACUCGUGUUUCAGCUUCUCUCCCCAGAAGUUACCGGAAAACUGAUACAGUCAGGUUAACAUCUGUGGUCACACCAAGACCCUUUGGCUCUCAGACAAGGGGAAUCUCAUCACUCCCCAGAUCUUACACGAUGGAUGAUGCUUGGAAGUAUAAUGGAGAUGUUGAAGACAUUAAGAGAACUCCAAACAAUGUGGUCAGCACCCCUGCACCAAGCCCGGACGCAAGCCAACUGGCUUCAAGCUUAUCUAGCCAGAAAGAGGUAGCAGCAACAGAAGAAGAUGUGACAAGGCUGCCCUCUCCUACAUCCCCCUUCUCAUCUCUUUCCCAAGACCAGGCUGCCACUUCUAAAGCCACAUUGUCUUCCACAUCUGGUCUUGAUUUAAUGUCUGAAUCUGGAGAAGGGGAAAUCUCCCCACAAAGAGAAGUCUCAAGAUCCCAGGAUCAGUUCAGUGAUAUGAGAAUCAGCAUAAACCAGACGCCUGGGAAGAGUCUUGACUUUGGGUUUACAAUAAAAUGGGAUAUUCCUGGGAUCUUCGUAGCAUCAGUUGAAGCAGGUAGCCCAGCAGAAUUUUCUCAGCUACAAGUAGAUGAUGAAAUUAUUGCUAUUAACAACACCAAGUUUUCAUAUAACGAUUCAAAAGAGUGGGAGGAAGCCAUGGCUAAGGCUCAAGAAACUGGACACCUAGUGAUGGAUGUGAGGCGCUAUGGAAAGGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-757.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -811.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 690.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(............)((((((.((....)).......((((((.((((((((((...(((((((((.(((....(.((((.........)))).)..))))))).....((((((..((((((((((((((((((.....(((((((((((((........(((.(((((((.(........).))))))))))(((.((((((((((..((...))..)))))))))).)))......(((.((.((((...(((((((((.((..(((.((.((..(((.((((....)))))))..)).)).)))....)))))))))))......................(((((((((....((...(((.....)))....)).......)))).)))))......((((((.((((((....(((.....((((((((((((...............(((((((((((.(((((((((.....(((.(((((((((..........(((((((......(((((((.(.....).))))))).........((..((((((((.(((....(((....(.(((((.....((.((....)).)).....))))).)))).....))).))))))))..)))))))))((((...((((.....((((..........)))).....))))....))))...(((((........))))).((((((...)))))).))))))))))))))))))))).)))))........))))))..)))).)).))))))........)))....))).))).))))))((((...)))).)))))).)))......((((((.((((((.....)).)))).)))))))))))))))((((.((((((((.(((((((..(((((.......)))))..)))))...))))))))))..)))).....)))).......)))))))))))))))......)))..)))))).....)))))...))))))...(((.(((((.(((((..(......)..))))).))))).))).((((((((..((.(((......))).))..))))))))..((((...........))))..((((((((....))))))))...))))...))))))..(((.(....).)))..((((((((.........(((((((((((((.((.((((((...(((........)))..............((((((.((((.(((.....((((.........))))...........(((((..(....)..))))).(((....(((((..(((((..(((((((.((((((((((..(........)..))))))))))........(((((....))))).)))))))(..((((.(((((((..(((.((((((((((.((((.((((((((...(((((.....((((((((.(((.(((((((...((((((((..(((((((..(((((.........)))))..)))))))....(((((.((.......................((((.(((((.(((.((((..(((((.(((..........))).)))))......))))...))).)))))(((((........(((((.(((((...........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((...)))...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..((((..((.((..(.....)..)))).))))...(((.(.(((.................))).).)))....(((((((((((............((((.(((.....)))..)))).((.(((((.....))))).))...((......)).........)))))))))))...)))))))((...........))....))))).))))))))))))))..(((((((.................))))))).)).)))))...((((.((((((.....((((...))))..)).)))).))))((((...))))((((((((((.........)))))))..)))))))))))....)).))))).....(((((..((((((..(((....((.(.((((((..(((((...............)))))..)))))).)))))).))))))..((.(....)))..((((((............))))))..(((((..(((((..((.(......).)).....))))))))))....)))))))))))))))))))))...))))...((((...........)))).....)))))))))))).))))))..)))..))))))).))))..)..(((((....))))).....(((....)))((((((((((((....((((((((..(.(((.(((((.....((((....)))).....))..))).))).)..)))).......))))....))))))))))))....((.((....)).)).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))).)))))).)))))..............(((.......))).((((....)))).))))))))(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...{{...},..)((((((((({..,.....}..}}}||,,.{,(((({(,.{(((((((..(((.(((,.((((((......(((((((({......(((((((({{{{{,...,||(((((((((((((((.....((({(((((((((,,......(((.(((((((.(........).)))))))))){((.((((((((((..((...))..)))))))))).)}}......(((.((.(({{...,{{((((((.{{..(((.((.{(..(((.((((....)))))))..)).)).)))....}}))))))}||{{,.........}},},..|,.(((((((((....((...(((.....)))....))..,....)))),}))))......((((({,((((((....(((.....((((((((((((..,,..,{{{,{{{{((,{{((((((.((((((({{,,..,(((,(({{{{{{{...}|.||||.||..||},,,,,||||||{,|,,,,,),))}}|||,.,{{{...((..((((((((.(((.....,(,...(,(((((.....((.((....)).)).....))))).)).......))).))))))))..)).)))),}|||{..,{((({{,..(({(,,,..,,,,,||||....,|||.....||||,.|||,,,..|,...})}},..{{{|||,..}})))).})))))))))))}}))))})).}})))...,,}..}}})})..))))},).))))))........)))....))).,))}))))))((((...)))).,}},}}.))}......{{(((({({{{((.....)).,,)).)))))))))))))))((((.((((((((.(((((((..(((((,......)))))..)))))...))))))))))..)))).....,)))...,...))))))))))))))).{{{,.{{|{{,(((((..,{,,|,,..,,|||{{{{{.,{{.,,,.,,|||||,}|.},,,}},{||||||}}|||,|||{({{{{{||,.,..{{{......)}},)),,))}}}}}||,{(((,,.........||||,.{{((((((,...})))))}}...{{{(({{({,{{{{(((,.{,...(((((.......)))))...,,|..{{{...(((((((((..,..(({{,(((........,,....,.......,..,,{||,.......,}}}}))}))))..,..)))),,)))}..,,....|((((..{....)..))))|{{{|||.,,|||,.....}}|.((((((((((..(((((....,((((.(......).))))}...))))).)))))))))),,))}))),}|||..,,,,}...))),}..}},}}}}))).})}))))}}}}.,))))).,}}}..)))))))).....)))))))))}}}}}}..,.}}})))),)})..})})))}}...,{((((.(((((((.(((((((,,((({.((((...,.,,{{{,............{{((((((((..(((.(((((((.{{{,{.....,,.,||,||}}}......,.....|}}|.}}}}}.,.,.,,......(((((((((((((.........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((...})}...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..||{{,,((,((..(....,|..|},}||,},...(((.(.(((.................))).).)))....(((((((((({......,,||||||,..|||.....||},.,}}}.{{.(((((.....))))).))...{{......,}{{,...,}})))))))))))...)))))))(((((,,(((((........))))))))))).(((({{{.(((.((.,.....((((.....(({((((((((((.(((((,({((((.((((((.,...{(((...))))}.))},))).)))).)).....(((((.(((((((.,,...,,.))))))).....(((((.(((....{{{......}}}))))))))))))).........))))).))))}})))))...)))...)))).....,,{((({{(,....})),)))}.))))))))))),{{{..,,||||{,..{{{.....))),,),.((((({{((,{{.{((........)}),.....))))))))))...........)))))).)))))))...,{{,,..((((...........))))...,,))))))))..)))))))))),))).,}.)))).})))......(((((....))))).....(((....))).{((((((((((....((({{{{{,.{,,{{,{{,,,.,...((((....))))..,|,||,,,,},))),),,)},).......)))),,..))))))))))))))))))..))))))).))))))}))),(((({{({(((,(((.(({....))).))).)))))).)))))..........,...|||{{{......(.((((....)))).)..,,,,.(((((((...(.((((....(((((....)))))..,.....)))).))))))))..,)))))
Back