Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0012500
Sequence Length
1002 nt
GC Content
0.4471
UAAUCAGAGGAGGAUUUGGGGCACCAAUGUGGAGAACUGGCCAACUGUACAAGGAACUUCAAAGUCCUCUUGUUAUUUGGAAGAGGAAAAAGCAAAGACAAGAAGCAUACCCAACAUUGUAAAGGAUGAUCUUUAUGUGCGCAAGCUCAGUCCAGUCAUGCCAAACCCAGGGAAUGCUUUUGAUCAGUUUCUUCCCAAAUGUUGGACCCCAGAAGAUGUGAACUGGAAAAGAAUAAAAAGGGAAACUUAUAAGCCAUGGUAUAAAGAAUUUCAGGGAUUCAGUCAGUUUUUACUGCUUCAGGCCCUCCAAACAUACUCUGAUGACAUCUUGUCUUCUGAAACACAUACCAAAAUUGAUCCCACUUCUGGCCCAAGGCUCAUAACCCGCAGGAAGAAUCUCUCUUAUGCACCAGGCUAUAGAAGAGAUGACCUCGAGAUGGCAGCCCUGGAUCCUGACUUAGAGAAUGAUGAUUUCUUUGUCAGAAAGACUGGGGCUUUCCAUGCAAAUCCAUAUGUUCUCCGAGCUUUUGAAGACUUUAGAAAGUUCUCUGAGCAAGAUGAUUCUGUAGAGCGAGAUAUAAUUUUACAGUGUAGAGAAGGUGAACUUGUACUUCCGGAUUUGGAAAAAGAUGAUAUGAUUGUUCGCCGAAUUCCAGCACAGAAGAAAGAAGUGCCGCUGUCUGGGGCCCCAGAUAGAUACCACCCAGUCCCUUUUCCCGAACCCUGGACUCUUCCUCCAGAAAUUCAAGCAAAAUUUCUCUGUGUACUUGAAAGGACAUGCCCAUCCAAAGAAAAAAGUAAUAGCUGUAGAAUAUUAGUUCCUUCAUAUCGGCAGAAGAAAGAUGACAUGCUGACACGUAAGAUUCAGUCCUGGAAACUGGGAACUACCGUGCCUCCCAUCAGUUUCACCCCUGGCCCCUGCAGUGAGGCUGACUUGAAGAGAUGGGAGGCCAUCCGGGAGGCCAGCAGACUUAGGCACAAGAAAAGGCUGAUGGUGGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-264.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -283.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 245.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......(((((.(((((((((.....(((.(((((((((..........(((((((......(((((((.(.....).))))))).........((..((((((((.(((....(((....(.(((((.....((.((....)).)).....))))).)))).....))).))))))))..)))))))))((((...((((.....((((..........)))).....))))....))))...(((((........))))).((((((...)))))).))))))))))))))))))))).))))).....))((((.(((.((((((.(((((((.........(((.((.((....)).)).))).(((.(((((((....((.(((....((((((.((((((.....)).)))).))))))..)))))..)))..)))).)))...(((((..(((((.......)))))..)))))...(((((((((((....((((((((....(((((...((((((((..........))))))))...)))))....)))).))))))))(((.(((((.(((((..(......)..))))).))))).))).((((((((..((.(((......))).))..))))))))..((((...........))))..((((((((....))))))))......))))))).......((((...(((((.......)))))...((((((....((......))...)))))).(((........)))...(((..((.(((((.........))))).))..)))...))))))))))))))))).)))(((((..(....)..)))))(((((...)))))..((((((((((((((.((((((((((..(........)..))))))))))........(((((....))))).)))))))((((...(((......))).....)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((......(((((.(((((((((.....(({((((((((((....,,,,,,{((,{((......(((((((.(.....).)))))))....,....((..((((((((.(((.....,(,...(,(((((.....((.((....)).)).....))))).)).......))).))))))))..))}))))}||{((...{{{|,,...((((..........)))).....}}}}....}))},.}}|..,..|,...})}}}..((((({...}))))).))))))))))))))))))))).))))).....))((((.{{(,((((({.(((((({....,,.....{,,,,{{,,,.{.{{{,{((((...)))},......((.(((....(((((({({{,((.....)).}})).))))))..))))).,((((.((((((((.(((((((..(((((,......)))))..)))))...))))))))))..)))){({{({,,{(.(((((...((((((((.{,....}}.))))))))...)))))..}})}}).}}}||||.|,|,|.}}|}|||{{,||}}.,,{|{({|{,,,,,,|,||||,((((((((..,..(((......))).})..)))))))),.{{{|||,,||||,,.}|||..((((((((....))))))))...,,,{{,{{,,{{{{{{{..{,...(((((.......)))))...,||..|||...|||||||||,,...{{{,.(((........}},...,.....,.,...,||||..,,.},,)),)))})))}..,..)))))))))),,)).},}{((((..(....)..))))|((((({..,,((......))|.((((((((((..(((((....,((((.(......).))))}...))))).)))))))))),.)))))),,{(({.{,,.|{,.}}}....},,}}))))).})))))))))
Back