Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0013900
Sequence Length
1493 nt
GC Content
0.3945
UCAGUUUUUACUGCUUCAGGCCCUCCAAACAUACUCUGAUGACAUCUUGUCUUCUGAAACACAUACCAAAAUUGAUCCCACUUCUGGCCCAAGGCUCAUAACCCGCAGGAAGAAUCUCUCUUAUGCACCAGGCUAUAGAAGAGAUGACCUCGAGAUGGCAGCCCUGGAUCCUGACUUAGAGAAUGAUGAUUUCUUUGUCAGAAAGACUGGGGCUUUCCAUGCAAAUCCAUAUGUUCUCCGAGCUUUUGAAGACUUUAGAAAGUUCUCUGAGCAAGAUGAUUCUGUAGAGCGAGAUAUAAUUUUACAGUGUAGAGAAGGUGAACUUGUACUUCCGGAUUUGGAAAAAGAUGAUAUGAUUGUUCGCCGAAUUCCAGCACAGAAGAAAGAAGUGCCGCUGUCUGGGGCCCCAGAUAGAUACCACCCAGUCCCUUUUCCCGAACCCUGGACUCUUCCUCCAGAAAUUCAAGCAAAAUUUCUCUGUGUACUUGAAAGGACAUGCCCAUCCAAAGAAAAAAGUAAUAGCUGUAGAAUAUUAGUUCCUUCAUAUCGGCAGAAGAAAGAUGACAUGCUGACACGUAAGAUUCAGUCCUGGAAACUGGGAACUACCGUGCCUCCCAUCAGUUUCACCCCUGGCCCCUGCAGUGAGGCUGACUUGAAGAGAUGGGAGGCCAUCCGGGAGGCCAGCAGACUUAGGCACAAGAAAAGGCUGAUGGUGGAGAGACUCUUUCAAAAGAUUUAUGGUGAGAAUGGGUAAGUUGUGUGGUUCACAGUAAAAAAUCUGUGCGUGUUGUUUGUUCUUUGUAUAACUUACUGUAUUUCUGGCAUGGCAUGUCACUAAAUGGGGUUGUUGUGUGCUGUGCAUGAUAUUUUUUAAGUGGGAAAUGUUUAUCUUGCAACCUAAUGGUAAUAUUUCUGUGUCUUGGUGCCCAGUGCAAGAUAAAAUUAUUUGUUUUAUUAAAAAUUUAAACUUCAGCUUCAUCCCUUCUUUUUUCCUUUUUAAAAAUUUAAUGAGUUGAUUAAAAGUCACAAAAGCACUUGCCUAAGAUUAGGUAUAUGUAUUUUGGUAUUUGGUUGCUACAUAGACUAAAAUUCUGAUUUAUGGAUGCUAAAGCCCAAAUUACUACAUUUUAGAAAAUCUGUGAUGGAAAAAGAAUAUUAGCAUUUACUUCAAGUUUAGAAUACACCCAGUUGACAUUAUCCUAUAAUCGGCCAACUGGGAGCUUCGUUAGUAGGGAUGCAUUAAACUUCCCUAGGUGGUAUUUGGAAGUAUUAUAUUUUCAAGAUUCCUGAUUAGGAAAAAAAAGUUAUAACAUGGCUAUAUUUAUAGUGCAAAAUAGACCUUCAAAAACUGCAAAAAUAUUUUUAAUUUCUAAUAUCACUGUUGCAAAAACUACAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUCGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGAAGUGGCGCAAUCUUGGCUCACAGCAACUUCCACCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-375.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -405.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 397.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((....))))((..(((..............((.((.((((...)))).)).))........((((.((((.(.((((((((((((...(((........((.(((....((((((.((((((.....)).)))).))))))..)))))..((((.((((((((.(((((((..(((((.......)))))..)))))...))))))))))..))))(((((((....(((((...((((((((..........))))))))...)))))....)))).)))((((((((((...((((((.(((((((.((((((....(((((((...((((((((..((.(((......))).))..))))))))..((((...........))))..((((((((....))))))))((((((((...................(((((.......)))))...((((((....((......))...))))))((((((((((.(((((..((((..(((((..(((((((((..........))).)).)))).((((((((((((((((((((..(....)..))))(((((((....((......))(.((((((((((..(((((....(((((.(......).)))))...))))).))))))))))).)))))))(((((...((((((..(((...(((...((..(((.((((...)))).)))..)).)))...)))........))))))...)))))(((((........))))))))))))))).)))))).......)))))...))))))).)))))))))).))...(((((..(((..((((.((((.(((((((((((..((((((........)))))).(((....))).((((.((((.(((((((.((..(((((..((((((((.....)))))))).............((((((.(((......(((((........)))))....)))))))))...............))))).))))))))))))).))))(((.(((((..((((((.....((((((.((......)).))))))...))))))..))))).)))..((((.((((...)))).))))...)))))))))))))))(((((.((((((.........((((((((.((((((...))))).)..))))))))))))).)..)))))....))))..)))..)))))))))))))(((((((((...)))))))))..(((((....))))).....((((((...))))))........))))))).....))))))......(((((..(((((..........))))).....)))))....)))))))..................))))))...))))))))))...)))..)))))))....))))).))))).))))................)))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((....))))((..(((..............((.((.((({...}))).)).))........((((.((((...((((((((((((...(((........((.(((....(((((({({{,((.....)).}})).))))))..))))).,((((.((((((((.(((((((..(((((,......)))))..)))))...))))))))))..)))),{,{{{,,{{.(((((...((((((((.{,....}}.))))))))...)))))..}})}}).}||((((((((((...{{((({.(((((((.((((((....(((((((...((((((((..{,.(((......))).,}..))))))))}.((((...........))))..((((((((....))))))))((((((((.,{{{{,.......,,...(((((.......)))))...{({{{{....||,..,.,|},.,||||||{(((((((((,((((,.,((((..(((((..((((,.{{,,...,}},..,,,.,,.},}}.||{{(((((,{(((,((,(({{({{,,|{{|}},{((((({.,,{((.,.,,.|}|.((((((((((..(((((,..,{((((.(......).))))}...}}}}}.})))))))))}.))))))}||{({|({{,((({..(,,.....,,}.||,.{||,{(((...}})),))}..}}.,}|.,.})),}.,}}}}},,}))},}))))}|{|||.....,,})),)))))))))),)})))))).,.....)))))...))))))).)))))))))).}}..{((((((((.,(((((({(.(({({{{{{,,,,,,,,.,(((({{({({(({,{{{.{{{..,.)))}||||}}|||,|||{{{|}|}.}}}})),.((((((((.....))))))))..........,}.,||||}}|||...,,,(((((,,,...,.||,,,.,,,}|}}}}||||,..,},}},,,,,,|||..((((({....))))))..))}.,||||{,,{(((((|,,..{{{{|||||,.,,,,||,}|}}||{,,|||||,..}}}},.,,,..((((.((({...)))).)))),,,}}}}}}..}}}}}}},,,.,}})))}.}}}}},...((((((((.((((((...))))).}..)))))))).}|}}}}..},{(((((.,.......,.)))))}))))))))(((((((((...)))))))))..(((((....))))).....((((((...))))))........))))))).....))))))......{((((..,{{{,.,........)),},.....))))}....)}}}}}}..................}))))),,.))))))))))}..)))..))))))},.},})))).,)))).))))................)))...))
Back