Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0015000
Sequence Length
2443 nt
GC Content
0.4363
UUUUUACUGCUUCAGGCCCUCCAAACAUACUCUGAUGACAUCUUGUCUUCUGAAACACAUACCAAAAUUGAUCCCACUUCUGGCCCAAGGCUCAUAACCCGCAGGAAGAAUCUCUCUUAUGCACCAGGCUAUAGAAGAGAUGACCUCGAGAUGGCAGCCCUGGAUCCUGACUUAGAGAAUGAUGAUUUCUUUGUCAGAAAGACUGGGGCUUUCCAUGCAAAUCCAUAUGUUCUCCGAGCUUUUGAAGACUUUAGAAAGUUCUCUGAGCAAGAUGAUUCUGUAGAGCGAGAUAUAAUUUUACAGUGUAGAGAAGGUGAACUUGUACUUCCGGAUUUGGAAAAAGAUGAUAUGAUUGUUCGCCGAAUUCCAGCACAGAAGAAAGAAGUGCCGCUGUCUGGGGCCCCAGAUAGAUACCACCCAGUCCCUUUUCCCGAACCCUGGACUCUUCCUCCAGAAAUUCAAGCAAAAUUUCUCUGUGUACUUGAAAGGACAUGCCCAUCCAAAGAAAAAAGUAAUAGCUGUAGAAUAUUAGUUCCUUCAUAUCGGCAGAAGAAAGAUGACAUGCUGACACGUAAGAUUCAGUCCUGGAAACUGGGAACUACCGUGCCUCCCAUCAGUUUCACCCCUGGCCCCUGCAGUGAGGCUGACUUGAAGAGAUGGGAGGCCAUCCGGGAGGCCAGCAGACUUAGGCACAAGAAAAGGCUGAUGGUGGAGAGACUCUUUCAAAAGAUUUAUGGUGAGAAUGGGAGUAAGUCCAUGAGUGAUGUCAGCGCAGAAGAUGUUCAAAACUUGCGUCAGCUGCGUUACGAGGAGAUGCAGAAAAUAAAAUCACAAUUAAAAGAACAAGAUCAGAAAUGGCAGGAUGACCUUGCAAAAUGGAAAGAUCGUCGAAAAAGUUACACUUCAGAUCUGCAGAAGAAAAAAGAAGAGAGAGAAGAAAUUGAAAAGCAGGCACUUGAGAAGUCUAAGAGAAGCUCUAAGACGUUUAAGGAAAUGCUGCAGGACAGGGAAUCCCAAAAUCAAAAGUCUACAGUUCCGUCAAGAAGGAGAAUGUAUUCUUUUGAUGAUGUGCUGGAGGAAGGAAAGCGACCCCCUACAAUGACUGUGUCAGAAGCAAGUUACCAGAGUGAGAGAGUAGAAGAGAAGGGAGCAACUUAUCCUUCAGAAAUUCCCAAAGAAGAUUCUACCACUUUUGCAAAAAGAGAGGACCGUGUAACAACUGAAAUUCAGCUUCCUUCUCAAAGUCCUGUGGAAGAACAAAGCCCAGCCUCUUUGUCUUCUCUGCGUUCACGGAGCACACAAAUGGAAUCAACUCGUGUUUCAGCUUCUCUCCCCAGAAGUUACCGGAAAACUGAUACAGUCAGGUUAACAUCUGUGGUCACACCAAGACCCUUUGGCUCUCAGACAAGGGGAAUCUCAUCACUCCCCAGAUCUUACACGAUGGAUGAUGCUUGGAAGUAUAAUGGAGAUGUUGAAGACAUUAAGAGAACUCCAAACAAUGUGGUCAGCACCCCUGCACCAAGCCCGGACGCAAGCCAACUGGCUUCAAGCUUAUCUAGCCAGAAAGAGGUAGCAGCAACAGAAGAAGAUGUGACAAGGCUGCCCUCUCCUACAUCCCCCUUCUCAUCUCUUUCCCAAGACCAGGCUGCCACUUCUAAAGCCACAUUGUCUUCCACAUCUGGUCUUGAUUUAAUGUCUGAAUCUGGAGAAGGGGAAAUCUCCCCACAAAGAGAAGUCUCAAGAUCCCAGGAUCAGUUCAGUGAUAUGAGAAUCAGCAUAAACCAGACGCCUGGGAAGAGUCUUGACUUUGGGUUUACAAUAAAAUGGGAUAUUCCUGGGAUCUUCGUAGCAUCAGUUGAAGCAGGUAGCCCAGCAGAAUUUUCUCAGCUACAAGUAGAUGAUGAAAUUAUUGCUAUUAACAACACCAAGUUUUCAUAUAACGAUUCAAAAGAGUGGGAGGAAGCCAUGGCUAAGGCUCAAGAAACUGGACACCUAGUGAUGGAUGUGAGGCGCUAUGGAAAGGCUGGUUCACCUGAAACAAAGUGGAUUGAUGCAACUUCUGGAAUUUACAACUCAGAAAAAUCUUCAAAUCUAUCUGUAACAACUGAUUUCUCCGAAAGCCUUCAGAGUUCUAAUAUUGAAUCCAAAGAAAUCAAUGGAAUUCAUGAUGAAAGCAAUGCUUUUGAAUCAAAAGCAUCUGAAUCCAUUUCUUUGAAAAACUUAAAAAGGCGAUCACAAUUUUUUGAACAAGGUAAACCACAAAGCUAACAAUUCAUGCACUUUCAUGGAAUUGUUCUCCCUCUCCACUCUUCCUCAUGGUCUGUGGUGCUGGGCACUGAGCCUCUUCAAUUUGUCUGUCAUUAUGACCAAGCGACAUAACCCAUUUCCAUUCUUUCCCUAGGGUCAUCAGGCUUUUCUUACAGUUCAUGGGUCUACCUCUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-669.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -717.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 464.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...(((((...((((................(((.((((((.(((((((.........(((.((.((....)).)).))).(((.(((((((....((.(((....((((((.((((((.....)).)))).))))))..)))))..)))..)))).)))...(((((..(((((.......)))))..)))))...(((((((((((....((((((((....(((((...((((((((..........))))))))...)))))....)))).))))))))(((.(((((.(((((..(......)..))))).))))).))).((((((((..((.(((......))).))..))))))))..((((...........))))..((((((((....))))))))......))))))).......((((...(((((.......)))))...((((((....((......))...)))))).(((........)))...(((..((.(((((.........))))).))..)))...))))))))))))))))).)))(((((..(....)..)))))((((((....((......))(.((((((((((..(((((....(((((.(......).)))))...))))).))))))))))).)))))).)))))))))....)))(((((((((((.(((((((..(((((...)))))......((((.((.((((((((((........(((.((.((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..(((((((((.(((...................(((((((..(((((((..(((((...(((((((((((......(((((((....(((((...((((.........))))......(((((((((((((.........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((...)))...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..((((..((.((..(.....)..)))).))))...(((.(.(((.................))).).)))....(((((((((((............((((.(((.....)))..)))).((.(((((.....))))).))...((......)).........)))))))))))...)))))))((((((.(((((........))))))))))).(((((.(.(((.((.......((((.....(((((((((((((.(((((.((((((.((((((.....((((...))))..)).)))).)))).)).....(((((.(((((((.........))))))).....(((((.(((....(((......)))))))))))))))).........))))).)))).))))))...)))...)))).......(((((((.....))).)))).)))))))))))......((((((............))))))..(((((..(((((..((.(......).)).....))))))))))...........)))))).)))))))..((((((((((((...........))))....(((.....)))..))))))))(((((((((..((((((((((..(((((....))))).....(((....))).(((((((((((....((((((((..(.(((.(((((.....((((....)))).....))..))).))).)..)))).......))))....)))))))))))(((.((.((((((((..((((((((...(((((((((((.(((.(((....))).))).)))))).)))))..........................(.((((....)))).)(((((..(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))....((.(((((((.(......).)))))))...))...((((((..........))))))...)))))....))))))))..))))))))..)).)))....))))))).)))..))))))))).(((((((....(((((.((((.((.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))...))))).....)))))))......)))))..))))))...)).................)))..)))).)))..)))))))...))).)).)).))))).(((((.((((((.((((((.((((....))))...)))))).)))))))))))...))))).)).))))))))))))).)).)))).))))))).)))))))..........((.....))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...(((((...((((.,,,............(((.((((((.(((((((...........,.,,.{{,...|..,,.|{(((...)))|,......((.(((....(((((({({{,((.....)).}})).))))))..))))).,{(((.((((((((.(((((((..(((((,......)))))..)))))...))))))))))..)))}((({((,,{{.(((((...((((((((.{,....}}.))))))))...)))))..}})))).))),|||.{,|,|,,,{|||{{{{|{,,.,,{{{({,{,,,,,,|,}|||,((((((((..{,.(((......))).})..)))))))),.((((((,,((((...,(({..((((((((....))))))))..........,,,.........{{...(((((.......)))))...,||..}}}...))))))))))).,|||,..(({.....,..}})...,.....,.,..,,}}}}}}}}})}})).))},))}.....,,))))))))))))).))){((((..(....)..))))|((((({..,|||,.....}}|.((((((((((..(((((....,((((.(......).))))}...))))).)))))))))),.}}})))})))))))))....)))(((((((((((.(((((({.{(((((,.{|||,,..,}||...{,((.{,(((((((,,(,.((((.((.((((((.(((.((((((((.(((((..((((((.(((((((.(((((((,,((((.((((...,.{{{{{,............{(((((((((..(((.(((((((.{{{,{.....,,.,||,||}}}......,.....||||.},}}}.,.,.,,......(((((((((((((.........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((...})}...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..||{{,,((,((..(....,|..}},}||,},...(((.(.(((.................))).).)))....(((((((((({......,,||||||,..|||.....|}},.,}}}.{{.(((((.....))))).))...{{......,}{{,...,}})))))))))))...)))))))(((((,,(((((........))))))))))).((((({(.(((.((.......((((.....(((((((((((((.(((((,({((((.((((((.,...{(((...))))}.))},))).)))).)).....(((((.(((((((.,,...,,.))))))).....(((((.(((....(((......)))))))))))))))).........))))).)))))))))))...)))...)))).......{((((((.....))).)))}.))))))))))),{{{..,,||||,,..{{{.....))),,),.((((({{((,{,.{((........)})......))))))))))...........)))))).)))))))...,,{,,..((((...........))))...,,))))))))..)))))))))),))),,}.)))).})))......(((((....))))).....(((....))).{((((((((((...,((({{{{{,.(,,{{,{{,,,.,...((((....))))..,,,||,,},},))),},,)},).......)))),,..))))))))))))))))))..))))))).)))))).((((((((,{,,,,{,|{,,(((,...,||,|}|{||}},,.{{{.,,,....,,,.....}}}..,,,|.,,|,||....((((((((((((.,,(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))...((((((((.((((...,((,,(((((((((.,....((((((..........))))))....,.))}}}))))}.,||.......|,.......{{..(((((..{{((({.......)},,.(((((({...,{((({,((((.({,........((((((((...))))))))))))))))))))))))))....,}}}...}))))..)).......,)))....)))).))))}...,)))(((((((((((......)))})))))))),,.)))).))))))))..,})).))})))))))))))))..))))).)))))....)))))).))))))...)).).))).},.)}}))))))))))))}))..,,,,))))))).))))))),.........((,....)),.})))
Back