Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0015300
Sequence Length
423 nt
GC Content
0.4728
GUGAACUUGUACUUCCGGAUUUGGAAAAAGAUGAUAUGAUUGUUCGCCGAAUUCCAGCACAGAAGAAAGAAGUGCCGCUGUCUGGGGCCCCAGAUAGAUACCACCCAGUCCCUUUUCCCGAACCCUGGACUCUUCCUCCAGAAAUUCAAGCAAAAUUUCUCUGUGUACUUGAAAGGACAUGCCCAUCCAAAGAAAAAAGUAAUAGCUGUAGAAUAUUAGUUCCUUCAUAUCGGCAGAAGAAAGAUGACAUGCUGACACGUAAGAUUCAGUCCUGGAAACUGGGAACUACCGUGCCUCCCAUCAGUUUCACCCCUGGCCCCUGCAGUGAGGCUGACUUGAAGAGAUGGGAGGCCAUCCGGGAGGCCAGCAGACUUAGGCACAAGAAAAGGCUGAUGGUGGAGAGACUCUUUCAAAAGAUUUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-108.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -117.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 83.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((....)))))......).)))))..))))))(....((((.(((((.........(((((...(((((.((((((.(((........(((((((((((((.((((...(((((.......)))))...((((((....((......))...)))))).(((........)))...(((..((.(((((.........))))).))..)))...)))).)))))...........(((((..(....)..)))))...)))..))))).......(.((((((((((..(((((....(((((.(......).)))))...))))).))))))))))))))..)).))))..)))))...))))).........))).)).)))).....((((....)))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((,{{(,,(((({....})))}...,..,.,,,,,..))))))(,..,((((.(((((.........(((((...(((((.((((((.(({.,......{{{(((,{{.{((((.{,...(((((.......)))))...,||..{{,...(((((((((.....(({{,(((........,,....,.....,.{,.,,,||,.....,,,))})))}))))..,..)))),})))}..,,....{((((..{....)..))))).,.)))})}})))..,....{.((((((((((..(((((....,((((.(......).))))}...))))).))))))))))})))..)).))))..)))))...))))).........))).)).))))|,{,.{(({....}))).,,.,)
Back