Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0015500
Sequence Length
2234 nt
GC Content
0.4517
ACUCUUUCAAAAGAUUUAUGGUGAGAAUGGGAGUAAGUCCAUGAGUGAUGUCAGCGCAGAAGAUGUUCAAAACUUGCGUCAGCUGCGUUACGAGGAGAUGCAGAAAAUAAAAUCACAAUUAAAAGAACAAGAUCAGAAAUGGCAGGAUGACCUUGCAAAAUGGAAAGAUCGUCGAAAAAGUUACACUUCAGAUCUGCAGAAGAAAAAAGAAGAGAGAGAAGAAAUUGAAAAGCAGGCACUUGAGAAGUCUAAGAGAAGCUCUAAGACGUUUAAGGAAAUGCUGCAGGACAGGGAAUCCCAAAAUCAAAAGUCUACAGUUCCGUCAAGAAGGAGAAUGUAUUCUUUUGAUGAUGUGCUGGAGGAAGGAAAGCGACCCCCUACAAUGACUGUGUCAGAAGCAAGUUACCAGAGUGAGAGAGUAGAAGAGAAGGGAGCAACUUAUCCUUCAGAAAUUCCCAAAGAAGAUUCUACCACUUUUGCAAAAAGAGAGGACCGUGUAACAACUGAAAUUCAGCUUCCUUCUCAAAGUCCUGUGGAAGAACAAAGCCCAGCCUCUUUGUCUUCUCUGCGUUCACGGAGCACACAAAUGGAAUCAACUCGUGUUUCAGCUUCUCUCCCCAGAAGUUACCGGAAAACUGAUACAGUCAGGUUAACAUCUGUGGUCACACCAAGACCCUUUGGCUCUCAGACAAGGGGAAUCUCAUCACUCCCCAGAUCUUACACGAUGGAUGAUGCUUGGAAGUAUAAUGGAGAUGUUGAAGACAUUAAGAGAACUCCAAACAAUGUGGUCAGCACCCCUGCACCAAGCCCGGACGCAAGCCAACUGGCUUCAAGCUUAUCUAGCCAGAAAGAGGUAGCAGCAACAGAAGAAGAUGUGACAAGGCUGCCCUCUCCUACAUCCCCCUUCUCAUCUCUUUCCCAAGACCAGGCUGCCACUUCUAAAGCCACAUUGUCUUCCACAUCUGGUCUUGAUUUAAUGUCUGAAUCUGGAGAAGGGGAAAUCUCCCCACAAAGAGAAGUCUCAAGAUCCCAGGAUCAGUUCAGUGAUAUGAGAAUCAGCAUAAACCAGACGCCUGGGAAGAGUCUUGACUUUGGGUUUACAAUAAAAUGGGAUAUUCCUGGGAUCUUCGUAGCAUCAGUUGAAGCAGGUAGCCCAGCAGAAUUUUCUCAGCUACAAGUAGAUGAUGAAAUUAUUGCUAUUAACAACACCAAGUUUUCAUAUAACGAUUCAAAAGAGUGGGAGGAAGCCAUGGCUAAGGCUCAAGAAACUGGACACCUAGUGAUGGAUGUGAGGCGCUAUGGAAAGGCUGGUUCACCUGAAACAAAGUGGAUUGAUGCAACUUCUGGAAUUUACAACUCAGAAAAAUCUUCAAAUCUAUCUGUAACAACUGAUUUCUCCGAAAGCCUUCAGAGUUCUAAUAUUGAAUCCAAAGAAAUCAAUGGAAUUCAUGAUGAAAGCAAUGCUUUUGAAUCAAAAGCAUCUGAAUCCAUUUCUUUGAAAAACUUAAAAAGGCGAUCACAAUUUUUUGAACAAGGAAGCUCUGAUUCGGUGGUUCCUGAUCUUCCAGUUCCAACCAUCAGUGCCCCGAGUCGCUGGGUGUGGGAUCAAGAGGAGGAGCGGAAGCGGCAGGAGAGGUGGCAGAAGGAGCAGGACCGCCUACUGCAGGAAAAAUAUCAACGUGAGCAGGAGAAACUGAGGGAAGAGUGGCAAAGGGCCAAACAGGAGGCAGAGAGAGAGAAUUCCAAGUACUUGGAUGAGGAACUGAUGGUCCUAAGCUCAAACAGCAUGUCUCUGACCACACGGGAGCCCUCUCUUGCCACCUGGGAAGCUACCUGGAGUGAAGGGUCCAAGUCUUCAGACAGAGAAGGAACCCGAGCAGGAGAAGAGGAGAGGAGACAGCCACAAGAGGAAGUUGUUCAUGAGGACCAAGGAAAGAAGCCGCAGGAUCAGCUUGUUAUUGAGAGAGAGAGGAAAUGGGAGCAACAGCUUCAGGAAGAGCAAGAGCAAAAGCGGCUUCAGGCUGAGGCUGAGGAGCAGAAGCGUCCUGCGGAGGAGCAGAAGCGCCAGGCAGAGAUAGAGCGGGAAACAUCAGUCAGAAUAUACCAGUACAGGAGGCCUGUUGAUUCCUAUGAUAUACCAAAGACAGAAGAAGCAUCUUCAGGUUUUCUUCCUGGUGACAGGAAUAAAUCCAGAUCUACUACUGAACUGGAUGAUUACUCCACAAAUAAAAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-627.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -670.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 549.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((....)))).)(((..........(((((((((((((.((((..((.(((((((..(((((.........)))))..)))))))))..((((((((............................(((((.(((.((((..(((((.(((..........))).)))))......))))...))).)))))(((((........(((((.(((((...........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((...)))...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..((((..((.((..(.....)..)))).))))...(((.(.(((.................))).).)))....(((((((((((............((((.(((.....)))..)))).((.(((((.....))))).))...((......)).........)))))))))))...)))))))((...........))....))))).))))))))))((((...))))........((((((((((.(((((((.((((((((.((((((.((((((.....((((...))))..)).)))).)))).((((.......))))((((((.(((((((((((((((..........)))))..(((......)))((((((.(((((((........((.(.((((((..(((((...............)))))..)))))).)))(((.((......))..))).(((....)))))))))))))))).(((.......)))....(..(((........)))..)..((((((((((((((...(((.(((((((..(((((((.....(((...(((((.(((((...((..(.((.(((((((((((((((...((((((((((..((((((((((..(((((....))))).....(((....))).(((((((((((....((((((((..(.(((.(((((.....((((....)))).....))..))).))).)..)))).......))))....)))))))))))(((.((.((((((((..((((((((...(((((((((((.(((.(((....))).))).)))))).)))))..........................(.((((....)))).)(((((..(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))....((.(((((((.(......).)))))))...))...((((((..........))))))...)))))....))))))))..))))))))..)).)))....))))))).)))..))))))))))(((((((....(((((.((((.((.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))......((((((((..........)))))))).............(((((((.(((..(((((...............))))).))))))))))))))))))))))....))).)))..))))))).)))))....)))....)))))))..(((((...((((.((((.......(((..(((.((((((((......(((.....((((.....)))).......((((((((.(......(((((....)))))..((((.(....).))))..(((.....))).).)))))).)).........)))))))))))))).))).......)))).))))...)))))..(((....))).)))))))..........)))....)))))))).).)))))...........)))))..))))).)))))).......(((((((((..((((..((((.............)))).))))..(((((((((...((((....((....)).))))....)))))))))....((....))))))))))).((.((....)).)).)).)))))...)))..))))))).)))..............(((((...))))))))))))........................)))))))).((.(((.((((((....)))))).))).))........)))).)..)))))..)))))))..........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((....)))).)(((........,{(((((((,(({,({,{((,(((,(((((((..(((((.........)))))..))))))}.{,.{,,((({({{,........,................{((((.{{{.{{((..(((((.{({.{.....,,.}}).)))))......}},,,,.))).))))){{{{,.......,(((((.(((({.,.........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((,,,}}|,..((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..||,{,{((,((,.(....,|..||,}||,}....(((.(.(((.................))).).)))....{||{{||{{||...,..}}||||||...|||,,...||},.,}}}.{{.{((((.....})))}.)),..{{......,|{{,...,)})}}))))))))...))))))){{.....,...,.,,..,,))))).))))))))))||||.,,}}}},,,,...,|||{{{,,({.{((((((.(((((((({(,((((.((((((.,...{(((...)))),.))},))).)))).((((.......}}}|((((((,(((((({{{,(((((..........)))))..,(({,....,.{((((((.((((({,.,,....{(({(.({(({{..|||||...,...})))}...,,,,|{{|||||,.,|}}|{,||,.||..}}..)),,(((....))))))))))))))))),{,....,},}}}.,,.,,.{({........)))..,..((((((((((((((.,.(((,(((((((..((((((({,...{{{...(((((,(((((...(((.(.((.(((((((((((((((,..((((((((((..((((((((((..(((((....))))).....(((....))).(((((((((((....((({{{{{,.(,,((,(({,,.....((((....))))..,{,||.,,,),))).),,)),).......)))).,..)))))))))))(((.((.((((((((..((((((((...(((((((((((.(((.(((....))).))).)))))).)))))..............|||,,,......(.((((....)))).),,{{{..(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))....||,|{(((((.{......,.)))))}|{,.},...((((((..........))))))...,},))....))))))))..))))))))..)).)))....))))))).)))..))))))))))(((((({,...{((({,((((.({.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))......{{{{{{{{..........}}}}}))}...,{{,.,|,||(((((((.(((..(((((...............))))).))))))))))))))))))))))}.,,})),))),.|}))},).)))}}.},})))))}})}}))}}..(((((...((((.((((.......(({..{{{.{((({{{...||,.|||..,,}{(((...,,||},..{.{{.((((((((.(......(((((....)))))..((({.(....).))))..(((.....))).}.)))))).)).,..,,,.})))))))))))))),))}.......)))).))))...)))))..|{|,,..))}.)))))))..........)),,,.,)))))))).).)))))..........,|}}}||.})))|.)))))).......{{{{{{{{{,.||||.||.{|,.,,,..,,,.,.,,}},}}}|..(((((((((...((((....{{....)).)))),...))))))))).,|,{|...,))})))))))).||,|{.,,,)).)}.}),})})}...})}.,)}}))))|)}),,........,...,{(((.,,})))}}}}}}}},.||......,..,{{{.{{{{{...,))))).,)))}}.{(((((....)))))}...((((((.((.......)).)))))),,))))))).,,.......)))
Back