Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0016800
Sequence Length
2636 nt
GC Content
0.4621
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-745.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -796.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 587.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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