Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0016900
Sequence Length
2715 nt
GC Content
0.4663
GAGUAAGUCCAUGAGUGAUGUCAGCGCAGAAGAUGUUCAAAACUUGCGUCAGCUGCGUUACGAGGAGAUGCAGAAAAUAAAAUCACAAUUAAAAGAACAAGAUCAGAAAUGGCAGGAUGACCUUGCAAAAUGGAAAGAUCGUCGAAAAAGUUACACUUCAGAUCUGCAGAAGAAAAAAGAAGAGAGAGAAGAAAUUGAAAAGCAGGCACUUGAGAAGUCUAAGAGAAGCUCUAAGACGUUUAAGGAAAUGCUGCAGGACAGGGAAUCCCAAAAUCAAAAGUCUACAGUUCCGUCAAGAAGGAGAAUGUAUUCUUUUGAUGAUGUGCUGGAGGAAGGAAAGCGACCCCCUACAAUGACUGUGUCAGAAGCAAGUUACCAGAGUGAGAGAGUAGAAGAGAAGGGAGCAACUUAUCCUUCAGAAAUUCCCAAAGAAGAUUCUACCACUUUUGCAAAAAGAGAGGACCGUGUAACAACUGAAAUUCAGCUUCCUUCUCAAAGUCCUGUGGAAGAACAAAGCCCAGCCUCUUUGUCUUCUCUGCGUUCACGGAGCACACAAAUGGAAUCAACUCGUGUUUCAGCUUCUCUCCCCAGAAGUUACCGGAAAACUGAUACAGUCAGGUUAACAUCUGUGGUCACACCAAGACCCUUUGGCUCUCAGACAAGGGGAAUCUCAUCACUCCCCAGAUCUUACACGAUGGAUGAUGCUUGGAAGUAUAAUGGAGAUGUUGAAGACAUUAAGAGAACUCCAAACAAUGUGGUCAGCACCCCUGCACCAAGCCCGGACGCAAGCCAACUGGCUUCAAGCUUAUCUAGCCAGAAAGAGGUAGCAGCAACAGAAGAAGAUGUGACAAGGCUGCCCUCUCCUACAUCCCCCUUCUCAUCUCUUUCCCAAGACCAGGCUGCCACUUCUAAAGCCACAUUGUCUUCCACAUCUGGUCUUGAUUUAAUGUCUGAAUCUGGAGAAGGGGAAAUCUCCCCACAAAGAGAAGUCUCAAGAUCCCAGGAUCAGUUCAGUGAUAUGAGAAUCAGCAUAAACCAGACGCCUGGGAAGAGUCUUGACUUUGGGUUUACAAUAAAAUGGGAUAUUCCUGGGAUCUUCGUAGCAUCAGUUGAAGCAGGUAGCCCAGCAGAAUUUUCUCAGCUACAAGUAGAUGAUGAAAUUAUUGCUAUUAACAACACCAAGUUUUCAUAUAACGAUUCAAAAGAGUGGGAGGAAGCCAUGGCUAAGGCUCAAGAAACUGGACACCUAGUGAUGGAUGUGAGGCGCUAUGGAAAGGCUGGUUCACCUGAAACAAAGUGGAUUGAUGCAACUUCUGGAAUUUACAACUCAGAAAAAUCUUCAAAUCUAUCUGUAACAACUGAUUUCUCCGAAAGCCUUCAGAGUUCUAAUAUUGAAUCCAAAGAAAUCAAUGGAAUUCAUGAUGAAAGCAAUGCUUUUGAAUCAAAAGCAUCUGAAUCCAUUUCUUUGAAAAACUUAAAAAGGCGAUCACAAUUUUUUGAACAAGGAAGCUCUGAUUCGGUGGUUCCUGAUCUUCCAGUUCCAACCAUCAGUGCCCCGAGUCGCUGGGUGUGGGAUCAAGAGGAGGAGCGGAAGCGGCAGGAGAGGUGGCAGAAGGAGCAGGACCGCCUACUGCAGGAAAAAUAUCAACGUGAGCAGGAGAAACUGAGGGAAGAGUGGCAAAGGGCCAAACAGGAGGCAGAGAGAGAGAAUUCCAAGUACUUGGAUGAGGAACUGAUGGUCCUAAGCUCAAACAGCAUGUCUCUGACCACACGGGAGCCCUCUCUUGCCACCUGGGAAGCUACCUGGAGUGAAGGGUCCAAGUCUUCAGACAGAGAAGGAACCCGAGCAGGAGAAGAGGAGAGGAGACAGCCACAAGAGGAAGUUGUUCAUGAGGACCAAGGAAAGAAGCCGCAGGAUCAGCUUGUUAUUGAGAGAGAGAGGAAAUGGGAGCAACAGCUUCAGGAAGAGCAAGAGCAAAAGCGGCUUCAGGCUGAGGCUGAGGAGCAGAAGCGUCCUGCGGAGGAGCAGAAGCGCCAGGCAGAGAUAGAGCGGGAAACAUCAGUCAGAAUAUACCAGUACAGGAGGCCUGUUGAUUCCUAUGAUAUACCAAAGACAGAAGAAGCAUCUUCAGGUUUUCUUCCUGGUGACAGGAAUAAAUCCAGAUCUACUACUGAACUGGAUGAUUACUCCACAAAUAAAAAUGGAAACAAUAAAUAUUUAGACCAAAUUGGGAACAUGACCUCUUCACAGAGGAGAUCCAAGAAAGAACAAGUACCAUCAGGAGCAGAAUUGGAGAGGCAACAAAUCCUUCAGGAAAUGAGGAAGAGAACACCCCUUCACAAUGACAACAGCUGGAUCCGACAGCGCAGUGCCAGUGUCAACAAAGAGCCUGUUAGUCUUCCUGGGAUCAUGAGAAGAGGCGAAUCUUUAGAUAACCUGGACUCCCCCCGAUCCAAUUCUUGGAGACAGCCUCCUUGGCUCAAUCAGCCCACAGGAUUCUAUGCUUCUUCCUCUGUGCAAGACUUUAGUCGCCCACCACCUCAGCUGGUGUCCACAUCAAACCGUGCCUACAUGCGGAACCCCUCCUCCAGCGUGCCCCCACCUUCAGCUGGCUCCGUGAAGACCUCCACCACAGGUGUGGCCACCACACAGUCCCCCACCCCGAGAAGCCAUUCCCCUUCAGCUUCACAGUCAGGCUCUCAGCUGCGUAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-767.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -819.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 804.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(..((.((.(((.((.((..(((...((((.(((((((((.(((((((..((........))..)))))))..............................((....))(((((.....)))))..........(((((((....(((((...((((.........))))......(((((((((((((.........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((...)))...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..((((..((.((..(.....)..)))).))))...(((.(.(((.................))).).)))....(((((((((((............((((.(((.....)))..)))).((.(((((.....))))).))...((......)).........)))))))))))...)))))))((((((.(((((........))))))))))).(((((.(.(((.((.......((((.....(((((((((((((.(((((.((((((.((((((.....((((...))))..)).)))).)))).)).....(((((.(((((((.........))))))).....(((((.(((....(((......)))))))))))))))).........))))).)))).))))))...)))...)))).......(((((((.....))).)))).)))))))))))......((((((............))))))..(((((..(((((..((.(......).)).....))))))))))...........)))))).)))))))..((((((((((((...........))))....(((.....)))..))))))))(((((((((..((((((((((..(((((....))))).....(((....))).(((((((((((....((((((((..(.(((.(((((.....((((....)))).....))..))).))).)..)))).......))))....)))))))))))(((.((.((((((((..((((((((...(((((((((((.(((.(((....))).))).)))))).)))))..........................(.((((....)))).)(((((..(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))....((.(((((((.(......).)))))))...))...((((((..........))))))...)))))....))))))))..))))))))..)).)))....))))))).)))..))))))))).(((((((....(((((.((((.((.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))...))))).....)))))))......))))))))).((((((((((((((((.(((..(((((...............))))).))))))))))...(((((.(((((.....(((((.(((((..((((.((((.((.(((((..((((.(((.((((.....(((((.............(((...(((.(..(((((((..(.(((((((((......((((.(((.((((....(((((((...(((((.(((((....(((((((.((((..((((........((((((((.((.........(((((((((((((((((((......))))).)))..((((((...((((......)))).)).))))..))))))).)).))......(((..((......))..)))((((....))))............(((((((((..((((..((((.............)))).))))..(((((((((...((((....((....)).))))....)))))))))....((....))))))))))).((.((....)).)).))))))))))))))))))..))))))).....))).)))))))(((((((.((((...(((............(((((.(((((....)))))..))))).((((((....))))))...((((((.((.......)).))))))......((((..........)))).................(((...)))......((.((((((...)))))).)).............((.((....)).))(((((((((..((..........((((((.......(((((...(.((.((((...((((...(((..((((..(((((.((..(....((....))..)..))))))).))))..)))...))))..)))).)).)..)))))......))))))......))..))))))))).)))))))))))))).((((.....))))....)))))))....)))).)))))))......)))).))))).)..).))))))....).)))...)))..)).)))......))))....))).))))..).))))))...)))).))))..))))).....))))).......((((((...)))))).))))).)))))..)).)))..)))).)))).))).)))).)))))))..)..(((.....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{(,.{{{((.({{,((.{({.(((((((..(((((.........)))))..))))))}.,,,|,.||||||{.........,,...............,{,{(,{,,.{{(({{(,,,,.|||}|.........,|{|||||....,{{{{...{|||.},}}}...},}}......((((({((((({(.........((((....((((((..((((.((((...)))).)))).))))))....))))(((((((.(((...})}...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..||{{,,((,((..(....,|..||,}||,},...(((.(.(((.................))).).)))....{{(((((((({......,,||||||,..|||.....|}},.,}}}.{{.(((((.....))))).))...{{......,}{{,...,}})))))))))))...)))))))(((((,,(((((........))))))))))),||||||{.{((.((,||,...|{{{.....|||{(((({((((,((((({{,((((.((((((.,...{(((...))))}.))},))).)))).||,....{{{{{,(((((((,,,...,,.}}}||||,....{{{{{.|||,,..{((......}}}||||||}||||||.........||}|},}||}|,}}}})...}}}...)))).....,,{((({{(,....})),}))}.))}}))}}))},{{{....)))|||,,|||..,,,))),.}..{{{{({,((,{,.{((........))),....,||||||||||,,,...,,..,||||||.}||||||,.,{{{(((,{{(({,,.,,,,,..,|||...,{{{,{,{{|||||||||}}}|(((((((((..((((((((((..(((((....))))).....(((....))).(((((((((((....((({{{{{,.(,,((,(({,,.....((((....))))..,{,||.,,,),))).),,)),).......)))).,..)))))))))))(((.((.((((((((..((((((((...(((((((((((.(((.(((....))).))).)))))).)))))..............|||,,,......(.((((....)))).),,{{{..(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))....||,|{(((((.{......,.)))))}|{,.},...((((((..........))))))...,},))....))))))))..))))))))..)).)))....))))))).)))..)))))))))}(((((({,...{((({,((((.({.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))...,,}||....,}}}}}}}....,,}))))}.,,,{{{{{{|,{(((((((.(((..(((((...............))))).))))))))))}}}|||||,||||{...,.{|||{.{({||.}{|||.|{|{.||,|{{{|.,{{{{.{((.{(,{,{.{({({,{.......,,...,|{,||||{{|...(((((({..{.(((((.{{(,,,,..,({{{{((,(((({.,.{{{{,(((,.{{{{|||||{,,,(,,(({{{|.||||..((({....,,,.{{||||||.||....,,...||||||||||||{|{|{((......))))},)))..{{{|||...(({,......)))).)),.}}}..}}})))),.},)),}}}}.|,|||||......},..}}}||||.||.||.},..,,......,({({{{{{,,.||||.||.,{,.,,,,,.,,,,...||{{,{(,.(((((((((...({((....{{....)).)))),...))))))))),,{{{{....)),))))||||,((,({....}|,|},||||}}}}}}||}}}||}..|||||||,....}}|.||||}}}(((((({{(({{,,{(((,.{{........,{{{{.(((({....))))),,))))),|(((((,,,.}}|||,,..((((((.((.......)).))))))..,,..|||,..........||}}............,....,,....|||{....{{{,{(((((,,|||||||.||{{{..........{{.{|..,.)),}},{{{||||(,,((,,...,,((({{{{,||..|,(((((((.((((...(((.....((((,...(((((..{.(.,,,,|,.}..}}}})))))....,),)..))))..)))))))||,.}},}}||||{({{,...|||||,{|....,||||.||...}},,))))}}))),)))))}})))))}}.((((.....))))....)))))}}.},})))),))))))),.,,},}})),}}}}),),.,.})))}),|||||}}}.},)),..|,,}}},,....)))}....})),)))).,).)))}))),.)))).)))),|))))),,...})))).......((((((...)))))).))}}}.}}})}.,.{{{|}..,,...)))).))))),)).))))))),,).,|||.....)))
Back