Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0017600
Sequence Length
429 nt
GC Content
0.3753
GAGUAAGUCCAUGAGUGAUGUCAGCGCAGAAGAUGUUCAAAACUUGCGUCAGCUGCGUUACGAGGAGAUGCAGAAAAUAAAAUCACAAUUAAAAGAACAAGAUCAGAAAUGGCAGGAUGACCUUGCAAAAUGGAAAGAUCGUCGAAAAAGUUACACUUCAGAUCUGCAGAAGAAAAAAGAAGAGAGAGAAGAAAUUGAAAAGCAGGCACUUGAGAAGUCUAAGAGAAGCUCUAAGACGUUUAAGGAAAUGCUGCAGGACAGGUUCACCUGAAACAAAGUGGAUUGAUGCAACUUCUGGAAUUUACAACUCAGAAAAAUCUUCAAAUCUAUCUGUAACAACUGAUUUCUCCGAAAGCCUUCAGAGUUCUAAUAUUGAAUCCAAAGAAAUCAAUGGAAUUCAUGAUGAAAGCAAUGCUUUUGAAUCAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-84.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -93.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 88.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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