Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0018300
Sequence Length
2454 nt
GC Content
0.4731
GGAAUCCCAAAAUCAAAAGUCUACAGUUCCGUCAAGAAGGAGAAUGUAUUCUUUUGAUGAUGUGCUGGAGGAAGGAAAGCGACCCCCUACAAUGACUGUGUCAGAAGCAAGUUACCAGAGUGAGAGAGUAGAAGAGAAGGGAGCAACUUAUCCUUCAGAAAUUCCCAAAGAAGAUUCUACCACUUUUGCAAAAAGAGAGGACCGUGUAACAACUGAAAUUCAGCUUCCUUCUCAAAGUCCUGUGGAAGAACAAAGCCCAGCCUCUUUGUCUUCUCUGCGUUCACGGAGCACACAAAUGGAAUCAACUCGUGUUUCAGCUUCUCUCCCCAGAAGUUACCGGAAAACUGAUACAGUCAGGUUAACAUCUGUGGUCACACCAAGACCCUUUGGCUCUCAGACAAGGGGAAUCUCAUCACUCCCCAGAUCUUACACGAUGGAUGAUGCUUGGAAGUAUAAUGGAGAUGUUGAAGACAUUAAGAGAACUCCAAACAAUGUGGUCAGCACCCCUGCACCAAGCCCGGACGCAAGCCAACUGGCUUCAAGCUUAUCUAGCCAGAAAGAGGUAGCAGCAACAGAAGAAGAUGUGACAAGGCUGCCCUCUCCUACAUCCCCCUUCUCAUCUCUUUCCCAAGACCAGGCUGCCACUUCUAAAGCCACAUUGUCUUCCACAUCUGGUCUUGAUUUAAUGUCUGAAUCUGGAGAAGGGGAAAUCUCCCCACAAAGAGAAGUCUCAAGAUCCCAGGAUCAGUUCAGUGAUAUGAGAAUCAGCAUAAACCAGACGCCUGGGAAGAGUCUUGACUUUGGGUUUACAAUAAAAUGGGAUAUUCCUGGGAUCUUCGUAGCAUCAGUUGAAGCAGGUAGCCCAGCAGAAUUUUCUCAGCUACAAGUAGAUGAUGAAAUUAUUGCUAUUAACAACACCAAGUUUUCAUAUAACGAUUCAAAAGAGUGGGAGGAAGCCAUGGCUAAGGCUCAAGAAACUGGACACCUAGUGAUGGAUGUGAGGCGCUAUGGAAAGGCUGGUUCACCUGAAACAAAGUGGAUUGAUGCAACUUCUGGAAUUUACAACUCAGAAAAAUCUUCAAAUCUAUCUGUAACAACUGAUUUCUCCGAAAGCCUUCAGAGUUCUAAUAUUGAAUCCAAAGAAAUCAAUGGAAUUCAUGAUGAAAGCAAUGCUUUUGAAUCAAAAGCAUCUGAAUCCAUUUCUUUGAAAAACUUAAAAAGGCGAUCACAAUUUUUUGAACAAGGAAGCUCUGAUUCGGUGGUUCCUGAUCUUCCAGUUCCAACCAUCAGUGCCCCGAGUCGCUGGGUGUGGGAUCAAGAGGAGGAGCGGAAGCGGCAGGAGAGGUGGCAGAAGGAGCAGGACCGCCUACUGCAGGAAAAAUAUCAACGUGAGCAGGAGAAACUGAGGGAAGAGUGGCAAAGGGCCAAACAGGAGGCAGAGAGAGAGAAUUCCAAGUACUUGGAUGAGGAACUGAUGGUCCUAAGCUCAAACAGCAUGUCUCUGACCACACGGGAGCCCUCUCUUGCCACCUGGGAAGCUACCUGGAGUGAAGGGUCCAAGUCUUCAGACAGAGAAGGAACCCGAGCAGGAGAAGAGGAGAGGAGACAGCCACAAGAGGAAGUUGUUCAUGAGGACCAAGGAAAGAAGCCGCAGGAUCAGCUUGUUAUUGAGAGAGAGAGGAAAUGGGAGCAACAGCUUCAGGAAGAGCAAGAGCAAAAGCGGCUUCAGGCUGAGGCUGAGGAGCAGAAGCGUCCUGCGGAGGAGCAGAAGCGCCAGGCAGAGAUAGAGCGGGAAACAUCAGUCAGAAUAUACCAGUACAGGAGGCCUGUUGAUUCCUAUGAUAUACCAAAGACAGAAGAAGCAUCUUCAGGUUUUCUUCCUGGUGACAGGAAUAAAUCCAGAUCUACUACUGAACUGGAUGAUUACUCCACAAAUAAAAAUGGAAACAAUAAAUAUUUAGACCAAAUUGGGAACAUGACCUCUUCACAGAGGAGAUCCAAGAAAGAACAAGUACCAUCAGGAGCAGAAUUGGAGAGGCAACAAAUCCUUCAGGAAAUGAGGAAGAGAACACCCCUUCACAAUGACAACAGCUGGAUCCGACAGCGCAGUGCCAGUGUCAACAAAGAGCCUGUUAGUCUUCCUGGGAUCAUGAGAAGAGGCGAAUCUUUAGAUAACCUGGACUCCCCCCGAUCCAAUUCUUGGAGACAGCCUCCUUGGCUCAAUCAGCCCACAGGAUUCUAUGCUUCUUCCUCUGUGCAAGACUUUAGUCGCCCACCACCUCAGCUGGUGUCCACAUCAAACCGUGCCUACAUGCGGAACCCCUCCUCCAGCGUGCCCCCACCUUCAGCUGGCUCCGUGAAGACCUCCACCACAGGUGUGGCCACCACACAGUCCCCCACCCCGAGAAGCCAUUCCCCUUCAGCUUCACAGUCAGGCUCUCAGCUGCGUAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-705.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -752.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 567.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...))(...((((((((..((((.((((........))))..))))..))))))))..((((..((.((..(.....)..)))).)))).((((...)))).......((((((((..((((((.......(((((((((((............((((.(((.....)))..)))).((.(((((.....))))).))...((......)).........))))))))))).....((((((((((.((((((........)))))).((((((..(((((((((.((((....((((.....(((((((((((((.(((((.((((((.((((((.....((((...))))..)).)))).)))).)).....(((((.(((((((.........))))))).....(((((.(((....(((......)))))))))))))))).........))))).)))).))))))...)))...)))).....)))).))......((((((....((......))(((((....)))))...((((.(((.((((......((((((....(((........)))......))))))(((((((.(.((((((((((((((((...((((((((((((((...........))))....(((.....)))..)))))))((((((((((..((((((((((..(((((....))))).....(((....))).(((((((((((....((((((((..(.(((.(((((.....((((....)))).....))..))).))).)..)))).......))))....)))))))))))(((.((.((((((((..((((((((...(((((((((((.(((.(((....))).))).)))))).)))))..........................(.((((....)))).)(((((..(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))....((.(((((((.(......).)))))))...))...((((((..........))))))...)))))....))))))))..))))))))..)).)))....))))))).)))..))))))))))(((((((....(((((.((((.((.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))......((((((((..........)))))))).......(((...(((((((.(((..(((((...............))))).))))))))))))))))...)))))...))))))).).)))...)..))))))).)))))))..))))(((....)))..))))))...........))))))).)))))).(((((((..(((((((...(((((.....)).((((((((.(......(((((....)))))..((((.(....).))))..(((.....))).).)))))).))....((((.(((((((((((((((((((......))))).)))..((((((...((((......)))).)).))))..))))))).)).))...((((.((((..(((.((.((((((.((.((.((..............)).)).)).)))))).)).))).......((((...((((.(((.(((((((((...((((....((....)).))))....)))))))))((((((....)).))))(((((((((......(((.(((((..(...((...(((................(((((((..(((.((..(((((.((((............(((((.(((((....)))))..))))).((((((....))))))...((((((.((.......)).)))))).....................)))).)))))................((((....(((..((((((((((((((.(((((..........((.((....)).))....)))))((((((...(((((((((.((..(.(((((((.((((...(((.....((((....(((((..(.(......).)..))))))))).....)))..))))..))))))).)..)).)))...(((((...((((((((.....((((.((.....))))))..)).))))))..)))))...((((.....))))...))))))...)))))))))))))))).))))..)))....)))))).)))..))))))))))...))...)..)))))....)))......))))))).)).))).)))).)))).)))).))))(((........))).....((((((...))))))..))))....))).....))))))).))))))))))).))..)))))))))).))).))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...))(...((((((((..((((.((((........))))..))))..)))))))),.{{,((((((((..((({.((..{,.........((((((((.....((....((((.{.(((.(((.({....(((((((((((........,{,,{{{,.,{{.....))),.}}}}.((.(((((.....))))).))...{{......}){{,...,},))))))))))).......,{{((((({{(((((........))))))))))),,}},(((((((((({(({...{{,...,..,,.}})}..(((((((((((..((((.((((((.,...{(((...))))}.))},))).)))).{(((.......}}||((((((,{{{{{{,||,(((((..........)))))..,((,.....,,|((((((.((((({,.,,....,(({(.({(({{..|||||...,...})))}...,,,}|{{|||||,.,|}}|{,}|,.||..}}..)),,(((....)))))))))))))))))|||.,..,},}}}.,,.,,.,{{........))),.}..((((((((((((((.,.(({,(((((((..((((((({,...,{{...(((((,(((((...(((.(.((.(((((((((((((((...((((((((((..((((((((((..(((((....))))).....(((....))).(((((((((((....((({{{{{,.(,,((,(({,,.....((((....))))..,{,||.,,,),))).),,)),).......)))).,..)))))))))))(((.((.((((((((..((((((((...(((((((((((.(((.(((....))).))).)))))).)))))..............|||,,,......(.((((....)))).),,{{{..(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))....||,|{(((((.{......,.)))))}|{,.},...((((((..........))))))...,},))....))))))))..))))))))..)).)))....))))))).)))..))))))))))(((((({,...{((({,((((.({.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))......{{{{{{{{..........}}}}}))}...,{{,.,|,||(((((((.(((..(((((...............))))).))))))))))))))))))))))}.,,})),))),.|})))}).)))}}.},})))))}})))))}}..(((((...((((.((((.......{(,..{{{.{((({{{,..||,.|||..,}|{(((...,,||},..,.{{.((((((((.(......(((((....)))))..((({.(....).))))..(((.....))).}.)))))).)).,..,,,.}))))))))))))}),))}.......)))).))))...)))))..|{{,,..))}.)))))))...,,.....)),},.,)))))))).).))))).,,,.,|.,,||||,||.||}||.}}}}}}....,,{|,,||.},.},)))).)}.,,}.))))}}((((...((((.(((.(((((((((...((((....{{....)).)))),...)))))))))((((((....)).))))(((((((((..,...(((.(((((..{...((...((,.,(((((((..{,...{{((((...((((((((((..((({{,,.{{.........,,.|,,,,||...}))..)))))))))}{,|||}},.,,|||.,,.((((((.((.......)).))))))..,,,.|||...........|||,...,.......,,....,.....((((....(((..((((((((((((({.{((((..........({.{{....}).}}....))))|((((((...(((((((((.{{..{.(((((((.((((...(((.....((((,...(((((..{,{....},,.)..)))))))))....,)})..))))..))))))),|..}}.}}}{,.(((((...((((((({.....((((.((.....))))))..))},)))))..))))).,.((((.....))))...))))))...)))))))))))))))).))))..)))....))))....,}..))))))))))...))...}..)))))....)))...,..))))))).)).))).)))),))))})))))))))))))).,})))))),...))))..))..,.)))))))).........,.}..))..)))))))))))).,},}.{|,{,{(,...,.}})}.}.}}.)
Back