Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0018900
Sequence Length
2021 nt
GC Content
0.4775
AUGGAUGAUGCUUGGAAGUAUAAUGGAGAUGUUGAAGACAUUAAGAGAACUCCAAACAAUGUGGUCAGCACCCCUGCACCAAGCCCGGACGCAAGCCAACUGGCUUCAAGCUUAUCUAGCCAGAAAGAGGUAGCAGCAACAGAAGAAGAUGUGACAAGGCUGCCCUCUCCUACAUCCCCCUUCUCAUCUCUUUCCCAAGACCAGGCUGCCACUUCUAAAGCCACAUUGUCUUCCACAUCUGGUCUUGAUUUAAUGUCUGAAUCUGGAGAAGGGGAAAUCUCCCCACAAAGAGAAGUCUCAAGAUCCCAGGAUCAGUUCAGUGAUAUGAGAAUCAGCAUAAACCAGACGCCUGGGAAGAGUCUUGACUUUGGGUUUACAAUAAAAUGGGAUAUUCCUGGGAUCUUCGUAGCAUCAGUUGAAGCAGGUAGCCCAGCAGAAUUUUCUCAGCUACAAGUAGAUGAUGAAAUUAUUGCUAUUAACAACACCAAGUUUUCAUAUAACGAUUCAAAAGAGUGGGAGGAAGCCAUGGCUAAGGCUCAAGAAACUGGACACCUAGUGAUGGAUGUGAGGCGCUAUGGAAAGGCUGGUUCACCUGAAACAAAGUGGAUUGAUGCAACUUCUGGAAUUUACAACUCAGAAAAAUCUUCAAAUCUAUCUGUAACAACUGAUUUCUCCGAAAGCCUUCAGAGUUCUAAUAUUGAAUCCAAAGAAAUCAAUGGAAUUCAUGAUGAAAGCAAUGCUUUUGAAUCAAAAGCAUCUGAAUCCAUUUCUUUGAAAAACUUAAAAAGGCGAUCACAAUUUUUUGAACAAGGAAGCUCUGAUUCGGUGGUUCCUGAUCUUCCAGUUCCAACCAUCAGUGCCCCGAGUCGCUGGGUGUGGGAUCAAGAGGAGGAGCGGAAGCGGCAGGAGAGGUGGCAGAAGGAGCAGGACCGCCUACUGCAGGAAAAAUAUCAACGUGAGCAGGAGAAACUGAGGGAAGAGUGGCAAAGGGCCAAACAGGAGGCAGAGAGAGAGAAUUCCAAGUACUUGGAUGAGGAACUGAUGGUCCUAAGCUCAAACAGCAUGUCUCUGACCACACGGGAGCCCUCUCUUGCCACCUGGGAAGCUACCUGGAGUGAAGGGUCCAAGUCUUCAGACAGAGAAGGAACCCGAGCAGGAGAAGAGGAGAGGAGACAGCCACAAGAGGAAGUUGUUCAUGAGGACCAAGGAAAGAAGCCGCAGGAUCAGCUUGUUAUUGAGAGAGAGAGGAAAUGGGAGCAACAGCUUCAGGAAGAGCAAGAGCAAAAGCGGCUUCAGGCUGAGGCUGAGGAGCAGAAGCGUCCUGCGGAGGAGCAGAAGCGCCAGGCAGAGAUAGAGCGGGAAACAUCAGUCAGAAUAUACCAGUACAGGAGGCCUGUUGAUUCCUAUGAUAUACCAAAGACAGAAGAAGCAUCUUCAGGUUUUCUUCCUGGUGACAGGAAUAAAUCCAGAUCUACUACUGAACUGGAUGAUUACUCCACAAAUAAAAAUGGAAACAAUAAAUAUUUAGACCAAAUUGGGAACAUGACCUCUUCACAGAGGAGAUCCAAGAAAGAACAAGUACCAUCAGGAGCAGAAUUGGAGAGGCAACAAAUCCUUCAGGAAAUGAGGAAGAGAACACCCCUUCACAAUGACAACAGCUGGAUCCGACAGCGCAGUGCCAGUGUCAACAAAGAGCCUGUUAGUCUUCCUGGGAUCAUGAGAAGAGGCGAAUCUUUAGAUAACCUGGACUCCCCCCGAUCCAAUUCUUGGAGACAGCCUCCUUGGCUCAAUCAGCCCACAGGAUUCUAUGCUUCUUCCUCUGUGCAAGACUUUAGUCGCCCACCACCUCAGCUGGUGUCCACAUCAAACCGUGCCUACAUGCGGAACCCCUCCUCCAGCGUGCCCCCACCUUCAGCUGGCUCCGUGAAGACCUCCACCACAGGUGUGGCCACCACACAGUCCCCCACCCCGAGAAGCCAUUCCCCUUCAGCUUCACAGUCAGGCUCUCAGCUGCGUAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-584.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -621.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 417.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.(((((((........((.(.((((((..(((((...............)))))..)))))).)))(((.((......))..))).(((....)))))))))))))))))(((.......))).(((((.(((........))).....((((((((((((((...(((.(((((((..(((((((.....(((...(((((.(((((...((..(.((.(((((((((((((((...((((((((((..((((((((((..(((((....))))).....(((....))).(((((((((((....((((((((..(.(((.(((((.....((((....)))).....))..))).))).)..)))).......))))....)))))))))))(((.((.((((((((..((((((((...(((((((((((.(((.(((....))).))).)))))).)))))..........................(.((((....)))).)(((((..(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))....((.(((((((.(......).)))))))...))...((((((..........))))))...)))))....))))))))..))))))))..)).)))....))))))).)))..))))))))))(((((((....(((((.((((.((.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))......((((((((..........)))))))).............(((((((.(((..(((((...............))))).))))))))))))))))))))))....))).)))..))))))).)))))....)))....)))))))..(((((...((((.((((.......(((..(((.((((((((......(((.....((((.....)))).......((((((((.(......(((((....)))))..((((.(....).))))..(((.....))).).)))))).)).........)))))))))))))).))).......)))).))))...)))))..(((....))).)))))))..........)))....)))))))).).))))).(((.((.((((((.((.((.((..............)).)).)).)))))).)).))).(((((.((((...((((.(((.(((((((((...((((....((....)).))))....)))))))))((((((....)).))))(((((((((......(((.(((((..(...((...(((................(((((((..(((.((..(((((.((((............(((((.(((((....)))))..))))).((((((....))))))...((((((.((.......)).)))))).....................)))).)))))................((((....(((..((((((((((((((.(((((..........((.((....)).))....)))))((((((...(((((((((.((..(.(((((((.((((...(((.....((((....(((((..(.(......).)..))))))))).....)))..))))..))))))).)..)).)))...(((((...((((((((.....((((.((.....))))))..)).))))))..)))))...((((.....))))...))))))...)))))))))))))))).))))..)))....)))))).)))..))))))))))...))...)..)))))....)))......))))))).)).))).)))).))))..((((((..((((((.............((((((...))))))...............((((........))))..)))))))))))).))))).))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((.((((({,.,,....{((((.({(({{..|||||...,...})))}.....,,|{{{||{|,.,|}||{,||..||..}}..)),,{{{....)))))))))))))))))(((.......))).(((((.(((........))).....((((((((((((((.,.(((,(((((((..((((((({,...{{{...(((((,(((((...(((.(.((.(((((((((((((((,..((((((((((..((((((((((..(((((....))))).....(((....))).(((((((((((....((({{{{{,.(,,((,(({,,.....((((....))))..,{,||.,,,),))).),,)),).......)))).,..)))))))))))(((.((.((((((((..((((((((...(((((((((((.(((.(((....))).))).)))))).)))))..............|||,,,......(.((((....)))).),,{{{..(((((((...(.((((....(((((....)))))........)))).))))))))....||,|{(((((.{......,.)))))}|{,.},...((((((..........))))))...,},))....))))))))..))))))))..)).)))....))))))).)))..))))))))))(((((({,...{((({,((((.({.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))......{{{{{{{{..........}}}}}))}...,{{,.,|,||(((((((.(((..(((((...............))))).))))))))))))))))))))))}.,,})),))),.|})))}).)))}}.},})))))}})}}))}}..(((((...((((.((((.......{({..{{{.{((({{{,..||,.|||..,,}{(((...,,||},..{.{{.((((((((.(......(((((....)))))..((({.(....).))))..(((.....))).}.)))))).)).,..,,,.})))))))))))))),))}.......)))).))))...)))))..|{|,,..))}.)))))))...,......)),},.,)))))))).).))))).(({.{(.((((((.((.((.((.,............)).)).)).)))))).)}.})).((({(.((((...((((.(((.(((((((((...((((....{{....)).)))),...)))))))))((((((....)).))))(((((((((..,...(((.(((((..{...((...((,.,(((((((..{,...{{((((...((((((((((..((({{,,.{{.........,,.|,,,,||...}))..)))))))))}{,|||}},.,,|||.,,.((((((.((.......)).))))))..,,,.|||...........|||,...,.......,,....,.....((((....(((..((((((((((((({.{((((..........({.{{....}).})....))))|((((((...(((((((((.{{..{.(((((((.((((...(((.....((((,...(((((..{,(....},,.)..)))))))))....,)})..))))..))))))),|..}}.}}}{,.(((((...((((((({.....((((.((.....))))))..))},)))))..))))).,.((((.....))))...))))))...)))))))))))))))).))))..)))....))))....,}..))))))))))...))...}..)))))....)))...,..))))))).)).))).)))),))))..((((((..((((((............,((((((...)))))).,,............((((........))))..)))))))))))).))))).))))).......
Back