Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMO7_0020700
Sequence Length
1328 nt
GC Content
0.4970
AAUAUUGAAUCCAAAGAAAUCAAUGGAAUUCAUGAUGAAAGCAAUGCUUUUGAAUCAAAAGCAUCUGAAUCCAUUUCUUUGAAAAACUUAAAAAGGCGAUCACAAUUUUUUGAACAAGGAAGCUCUGAUUCGGUGGUUCCUGAUCUUCCAGUUCCAACCAUCAGUGCCCCGAGUCGCUGGGUGUGGGAUCAAGAGGAGGAGCGGAAGCGGCAGGAGAGGUGGCAGAAGGAGCAGGACCGCCUACUGCAGGAAAAAUAUCAACGUGAGCAGGAGAAACUGAGGGAAGAGUGGCAAAGGGCCAAACAGGAGGCAGAGAGAGAGAAUUCCAAGUACUUGGAUGAGGAACUGAUGGUCCUAAGCUCAAACAGCAUGUCUCUGACCACACGGGAGCCCUCUCUUGCCACCUGGGAAGCUACCUGGAGUGAAGGGUCCAAGUCUUCAGACAGAGAAGGAACCCGAGCAGGAGAAGAGGAGAGGAGACAGCCACAAGAGGAAGUUGUUCAUGAGGACCAAGGAAAGAAGCCGCAGGAUCAGCUUGUUAUUGAGAGAGAGAGGAAAUGGGAGCAACAGCUUCAGGAAGAGCAAGAGCAAAAGCGGCUUCAGGCUGAGGCUGAGGAGCAGAAGCGUCCUGCGGAGGAGCAGAAGCGCCAGGCAGAGAUAGAGCGGGAAACAUCAGUCAGAAUAUACCAGUACAGGAGGCCUGUUGAUUCCUAUGAUAUACCAAAGACAGAAGAAGCAUCUUCAGGUUUUCUUCCUGGUGACAGGAAUAAAUCCAGAUCUACUACUGAACUGGAUGAUUACUCCACAAAUAAAAAUGGAAACAAUAAAUAUUUAGACCAAAUUGGGAACAUGACCUCUUCACAGAGGAGAUCCAAGAAAGAACAAGUACCAUCAGGAGCAGAAUUGGAGAGGCAACAAAUCCUUCAGGAAAUGAGGAAGAGAACACCCCUUCACAAUGACAACAGCUGGAUCCGACAGCGCAGUGCCAGUGUCAACAAAGAGCCUGUUAGUCUUCCUGGGAUCAUGAGAAGAGGCGAAUCUUUAGAUAACCUGGACUCCCCCCGAUCCAAUUCUUGGAGACAGCCUCCUUGGCUCAAUCAGCCCACAGGAUUCUAUGCUUCUUCCUCUGUGCAAGACUUUAGUCGCCCACCACCUCAGCUGGUGUCCACAUCAAACCGUGCCUACAUGCGGAACCCCUCCUCCAGCGUGCCCCCACCUUCAGCUGGCUCCGUGAAGACCUCCACCACAGGUGUGGCCACCACACAGUCCCCCACCCCGAGAAGCCAUUCCCCUUCAGCUUCACAGUCAGGCUCUCAGCUGCGUAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-380.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -408.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 296.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...........(((((((....(((((.((((.((.........((((((((...))))))))))))))))))))))))))......((((((((..........)))))))).....((((((.((((((((.(((..(((((...............))))).)))))))))))..(((((.(((((.....(((((.(((((..((((.((((.((.(((((..((((.(((.((((.....(((((.............(((...(((.(..(((((((..(.(((((((((......((((.(((.((((....(((((((...(((((.(((((....(((((((.((((..((((........((((((((.((.........(((((((((((((((((((......))))).)))..((((((...((((......)))).)).))))..))))))).)).))......(((..((......))..)))((((....))))............(((((((((..((((..((((.............)))).))))..(((((((((...((((....((....)).))))....)))))))))....((....))))))))))).((.((....)).)).))))))))))))))))))..))))))).....))).)))))))(((((((.((((...(((............(((((.(((((....)))))..))))).((((((....))))))...((((((.((.......)).))))))......((((..........)))).................(((...)))......((.((((((...)))))).)).............((.((....)).))(((((((((..((..........((((((.......(((((...(.((.((((...((((...(((..((((..(((((.((..(....((....))..)..))))))).))))..)))...))))..)))).)).)..)))))......))))))......))..))))))))).)))))))))))))).((((.....))))....)))))))....)))).)))))))......)))).))))).)..).))))))....).)))...)))..)).)))......))))....))).))))..).))))))...)))).))))..))))).....))))).......((((((...)))))).))))).)))))...((((........))))))))))...((.(.((........)).).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,.,{{{.,,,(((((({....{((({,((((.({,........((((((((...)))))))))))))))))))))))))).....,({...,||..,,,..}}}).))|||,.....((((((.{(((((((.(((..(((((...............))))).))))))))))},.(((((.(((((.....(((((.(((((..((((.((((.((.(((({..((((.(((.{({({,.{{((,.{.............||,}}}},,}...((((((,..(.(((((,((({.....((({{(((.((((....((((((({..(((({{(((((..{.{((((((.((((..((((........((((((((.((.....,...{((((((((((((((((((......))))).)))..((((((...((({.....,))}}.)),,)))..)))))))}.}.))...,,.{{(..((......}}..))){|||....,},},...........(((((((((..((((.{{,{{.............,,}},||||..(((((((((...({((....{{....)).))))}...)))))))))..,.||...,))))))))))).((.((....)).)).))))))))))))))))))..)))))))}....))).)))))))(((((({{((((..,(((..,,........{((((.(((((....)))))..))))}.{(((((,,,.}}|}|}...((((((.((.......)).))))))......|{{,..........||}}............,....{{,...|}|,....,..{((((,,..,)))),}.}}|,,..........||.,|,,,}))}},(((((((((..((.......{((,,{{||}..|,{{(((((.{{({...(((,....((((....(((((..,.(.,,,,||.},.}}}}}}}}}....,},),,))))..)))))))|{{.|||||.||||{||....))))}.,},..,}}}}}.},,}.))..))))))))).)))))))))))))).((((.....))))....))))))).,.,)))).)))))))......)))).))))).}..,.)))))).{{(((..,.}}))}..||{||,...,.,))))....))).))))..}.))))})}..)))).))))..))))).....))))).......((((((...)))))).))))).))))).|.((((,.......}}}}})))))...{,.,||||...,}}}}}.,..)})
Back