Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LMO7_0023600

Sequence Length

432 nt

GC Content

0.5069

GAAACAAUAAAUAUUUAGACCAAAUUGGGAACAUGACCUCUUCACAGAGGAGAUCCAAGAAAGAACAAGUACCAUCAGGAGCAGAAUUGGAGAGGCAACAAAUCCUUCAGGAAAUGAGGAAGAGAACACCCCUUCACAAUGACAACAGCUGGAUCCGACAGCGCAGUGCCAGUGUCAACAAAGAGCCUGUUAGUCUUCCUGGGAUCAUGAGAAGAGGCGAAUCUUUAGAUAACCUGGACUCCCCCCGAUCCAAUUCUUGGAGACAGCCUCCUUGGCUCAAUCAGCCCACAGGAUUCUAUGCUUCUUCCUCUGUGCAAGACUUUAGUCGCCCACCACCUCAGCUGGUGUCCACAUCAAACCGUGCCUACAUGCGGAACCCCUCCUCCAGCGUGCCCCCACCUUCAGCUGGCUCCGUGAAGACCUCCACCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-103.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -111.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 85.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.......................((((....(((..((((((((((((((.(((((..........((.((....)).))....)))))((((((...(((((((((.((..(.(((((((.((((...(((.....((((....(((((..(.(......).)..))))))))).....)))..))))..))))))).)..)).)))...(((((...((((((((.....((((.((.....))))))..)).))))))..)))))...((((.....))))...))))))...)))))))))))))))).))))..)))....)))).((((......)))).............(((....((((((((........))).)))))....)))(((((..........)))))...))(......)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.......................((((....(((..((((((((((((({.{((((..........({.{{....}).}}....))))|((((((...(((((((((.{{..{.(((((((.((((...(((.....((((,...(((((..{,(....},,.)..)))))))))....,)})..))))..))))))),|..}}.}}}{,.(((((...((((((({.....((((.((.....))))))..))},)))))..))))).,.((((.....))))...))))))...)))))))))))))))).))))..)))....)))).,,,,.{{{{{||||..{{{........|||....((((((((........))).)))))....}}},.,|})}))}.}}{{||..|...,,|..}}}.)