Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMTK2_0000400
Sequence Length
466 nt
GC Content
0.4313
GGGAGGCGCCACCUGCUGCAGAAGUUUCCUCAUCUUUUGUGAUCCUGUGUGUGUGCAGUUUAAUAAUAUUAAUAGUGUUAAUUGCAAACUGUGUAUCCUGCUGUAAGGACCCAGAAAUAGACUUUAAGGAAUUUGAAGAUAAUUUUGAUGAUGAGAUAGAUUUCACACCACCAGCAGAAGACACUCCCUCUGUUCAGUCCCCAGCAGAGGUCUUCACACUUUCAGUACCAAAUAUUUCACUCCCAGCUCCCUCGCAAUUCCAGCCUUCUGUAGAGGGAUUGAAGUCUCAAGUUGCCCGCCACAGUCUAAACUACAUACAGGAAAUUGGAAAUGGCUGGUUUGGAAAGGUUCUCUUGGGAGAGAUUUACACGGGCACUAGCGUAGCAAGAGUCAUCGUGAAGGAGUUAAAAGCAAGUGCCAACCCAAAGGAACAAGAUACUUUUUUGAAAAAUGGAGAACCUUACUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-107.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -117.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 79.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.....))).)).(((..((((((((((.....))))(((((((((((((((((....(((((((...)))))))))))))..(((.(..((((......)))).))))...((((((....(((((((((.(((.....((.((.(((((....))))))).))......(((((.....((((((((........)))))))))))))............................(((.(((((((((............))).)))))))))..)))))))))).))......))))))...)))))))))))....))))))..)))...(((.((((((((((((((.............((((((.((.((((.....(((...)))....))))...)).))))))..))))......(((((.....)))))......)))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((.....))).)}.(((..(((((({(({,....))))((((((((((((((((({,{{((,((,....},)))))))))))..{({,(..((((......))))..))}...((((((....(((((((({,(((.....{(.{(.(((((....,}))}}}.},...,..(((((.....{(((((((........)))))))))))))........,}}......,,,,,.,....({(.(((((({{{............))).)))))))))..)))))))))).}),.....))))))...)))))))))))....))))))..)))..,(((.((((((((((((((.............((((((.((.((((.....(({...}))....))))...)).))))))..))))......(((((.....)))))......}))))))))).)))
Back