Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LMTK2_0000600

Sequence Length

688 nt

GC Content

0.4797

GGGAGGCGCCACCUGCUGCAGAAGUUUCCUCAUCUUUUGUGAUCCUGUGUGUGUGCAGUUUAAUAAUAUUAAUAGUGUUAAUUGCAAACUGUGUAUCCUGCUGUAAGGACCCAGAAAUAGACUUUAAGGAAUUUGAAGAUAAUUUUGAUGAUGAGAUAGAUUUCACACCACCAGCAGAAGACACUCCCUCUGUUCAGUCCCCAGCAGAGGUCUUCACACUUUCAGUACCAAAUAUUUCACUCCCAGCUCCCUCGCAAUUCCAGCCUUCUGUAGAGGGAUUGAAGUCUCAAGUUGCCCGCCACAGUCUAAACUACAUACAGGAAAUUGGAAAUGGCUGGUUUGGAAAGGUUCUCUUGGGAGAGAUUUACACGGGCACUAGCGUAGCAAGAGUCAUCGUGAAGGAGUUAAAAGCAAGUGCCAACCCAAAGGAACAAGAUACUUUUUUGAAAAAUGGAGAACCUUACUACAUUCUUCAGCAUCCAAAUAUUCUUCAGUGUGUUGGACAGUGCGUAGAAGCGAUUCCCUACCUCCUGGUGUUUGAGUUCUGUGACUUGGGUGACCUGAAGGCGUAUCUGCGCAGCGAGCAGGAGCACAUGCGGGGGGACUCACAGACCAUGCUGCUGCAGAGGAUGGCGUGCGAGGUCGCCGCGGGGCUGGCCGCCAUGCACAAGCUGCACUUCCUGCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-203.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -215.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 148.54

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((((.((((((.((......(((..((((((((((((((((((((((((....(((((((...)))))))))))))....((((...((((((...((...(((((.((..((((((.....)))))).)).))))).((.(((((....)))))))))..))))))...))))..((((((((........)))))))).............................((((..((((.((((((......((((((......(((((....)))))..((((((((.(((((.((.....((((.(((((....((.(((.(((....(((.((((((((((((((.............((((((.((.((((.....(((...)))....))))...)).))))))..))))......(((((.....)))))......)))))))))).)))...(((...(((((((((((((....))))).)))))...)))..)))))).))).))....)))))))))...))..)))))...))))))))..)))))).....)))).)).)))).)))))))))))))))....)))))))..))))).))))))))).))))(((((.(((.(((((...)).))).))).))))).....)).)))))(.....)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((((((.((((((.(({.....{{{..((((((((((({(((((((((((({,,{(({(({,...}})))))}))}}},,.|((({,{{((((((...((,,.(((((.((..((((((,...,)))))).)).))))).{(.(((((....}))))}},}..,|||||,.,},,,..{{|||||{..,,,,.,)))))}))}...,,,}.,...,}}.............{(((..((((.((((((......((((((....|||||{|....|}}}},.((((((((.(((((.,{.,,,.((((.(((((....((.(((.(((.,..(((.((((((((((((((.............((((((.((.((((.....(({...}))....))))...)).))))))..)))),.....(((((.....)))))......}))))))))).))).,,(((.,.((((((({((((,.....)})),)))))..,)))..)))))).))).))....)))))))))...})..)))))...)))))))).,)))))).....)))).)).)))).))))))))))))})),,..)))))))..}}))).))))))))).))))(((((.(((.((((,...}}.))).))).))))).....)).)))))(.....)