Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LMTK2_0001600

Sequence Length

426 nt

GC Content

0.4413

GAAUUUGAAGAUAAUUUUGAUGAUGAGAUAGAUUUCACACCACCAGCAGAAGACACUCCCUCUGUUCAGUCCCCAGCAGAGGUCUUCACACUUUCAGUACCAAAUAUUUCACUCCCAGCUCCCUCGCAAUUCCAGCCUUCUGUAGAGGGAUUGAAGUCUCAAGUUGCCCGCCACAGUCUAAACUACAUACAGGAAAUUGGAAAUGGCUGGUUUGGAAAGGUUCUCUUGGGAGAGAUUUACACGGGCACUAGCGUAGCAAGAGUCAUCGUGAAGGAGUUAAAAGCAAGUGCCAACCCAAAGGAACAAGAUACUUUUUUGAAAAAUGGAGAACCUUACUACAUUCUUCAGCAUCCAAAUAUUCUUCAGUGUGUUGGACAGUGCGUAGAAGCGAUUCCCUACCUCCUGGUGUUUGAGUUCUGUGACUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-97.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -106.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 74.60

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((.(((.....))).)))..(((((((((.((((...((((((..(((((.....((((((((........)))))))))))))............................(((.(((((((((............))).)))))))))........((((((..(((((.((((((..(((((..(((((.(((((....(((((..(((.((((((((((((((.............((((((.((.((((.....(((...)))....))))...)).))))))..))))......(((((.....)))))......)))))))))).)))......))))).)))))...)))))..))))))))))).))).))....)))))).........))))))..)))).)))))..))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((.(((.....))),})}..{((((((((.((((.{.((((((..(((((.....((((((((........)))))))))))))...,....,||............,.,..{{{.(((((({({............))}.))))))})),,},....{(((((.,(((((.((((({.,.((((..(((((.(((((..,.(((((..(((.((((((((((((((.............((((((.((.((((.....(({...}))....))))...)).))))))..))))......(((((.....)))))......}))))))))).))}.,....))))).)))))...)))))..))))))))))).))),)}.,..)))))}.........))))))}.)))).)))))..))))