Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LMTK2_0001900

Sequence Length

731 nt

GC Content

0.4241

GUGAGCUGUUCAAGAGAGAUGAAAAUGAAGACUAAGUAAAGGCCAUUGGCCUGGUGAUUGGUGGUUACAUGAGAGUAGCUGGAUCGGAAAAAAAACAAUGCGCAAGGUAUUAAAGAAUUGGUAGGAAACUCAUUAAAAAAUAUUGUCAGUUUUAAAGCCUAAAACUGUUUUGGCAUGAUUCGUUUAAAAGAGGUGUUUUAUGUAUUUAUUCCUACCUUUAUUUGCACAAGCCUUUAUGUUAGUGUUCAUACUUUAUAGGUUAUAUAUUUAAUAUUUAGAUACUUAUAUUUCAUUUUUAAUGUUUUUUUCUCUACAGAGGGAUUGAAGUCUCAAGUUGCCCGCCACAGUCUAAACUACAUACAGGAAAUUGGAAAUGGCUGGUUUGGAAAGGUUCUCUUGGGAGAGAUUUACACGGGCACUAGCGUAGCAAGAGUCAUCGUGAAGGAGUUAAAAGCAAGUGCCAACCCAAAGGAACAAGAUACUUUUUUGAAAAAUGGAGAACCUUACUACAUUCUUCAGCAUCCAAAUAUUCUUCAGUGUGUUGGACAGUGCGUAGAAGCGAUUCCCUACCUCCUGGUGUUUGAGUUCUGUGACUUGGGUGACCUGAAGGCGUAUCUGCGCAGCGAGCAGGAGCACAUGCGGGGGGACUCACAGACCAUGCUGCUGCAGAGGAUGGCGUGCGAGGUCGCCGCGGGGCUGGCCGCCAUGCACAAGCUGCACUUCCUGCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-194.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -209.36

Frequency: 0.0000

Diversity: 162.57

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((.((((((((((((((((((((((..((((((.(((((...)))))..(((((...((((((......)))))).)))))..........(((((.....)))))........((((((((...................((((((((.....)))))))).....((((((..(((((.....)))))..)))))).....)))))))).......((....))((..((((((((((..(..((....))..)..))).)))))))..)).))))))..))))))))))).......))))))).....(((((....)))))..((((((((.(((((.((.....((((.(((((....((.(((.(((....(((.((((((((((((((.............((((((.((.((((.....(((...)))....))))...)).))))))..))))......(((((.....)))))......)))))))))).)))...(((...(((((((((((((....))))).)))))...)))..)))))).))).))....)))))))))...))..)))))...)))))))).))))))).)))(((.((((.((((((.((((..((.(((....))).)).....)))).)))).....((((((.((.((.((......)).)).))))))))(((.....)))...)))))).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.(((.{(((.,(((((((((((((((.(((((((((((((..{((((,,.,(((((,.,((((((......)))))).,})),..........|{{({,,...))}}}.....,..((((((((.............,.....((((((((.....)))))))).....((((((..(,{{{....,))}))..)))))).....))))))))..,.}},)}.)),)))))))).})))).)))))....(((((((....,({{{{,....))}}})))))))}))))))))).....,,,,,(((({...,))))},,||.,.,}}|.((((((((.(((((.,{.,,,.((((.(((((....((.(((.(((.,..(((.((((((((((((((.............((((((.((.((((.....(({...}))....))))...)).))))))..)))),.....(((((.....)))))......}))))))))).))).,,(((.,.((((((({((((,.....)})),)))))..,)))..)))))).))).))....)))))))))...})..)))))...)))))))).)))}))).)))(((.((((.((((((.((((..((.(((....))).)).....)))).))))..,{.{(((((,((,{(,((,,,...}),)},))))))))|),,..,}),}..,)))))).)))