Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LMTK2_0003200

Sequence Length

355 nt

GC Content

0.5099

GGACUGGCUUUGGCUGCUCAGGCGAAUGGAUGCAGGGAGGCCGCAGGGAGACUGGCGCAGCCGUCUUUUCUUGACUCAGAUUUAAAGAACACUGAAAGCUAUUGGCUUGCUUUCUAAAUUUUAUUAACUGAUUCGAGGAAACUUUAAUUUGGAAUGAAAUCAUAUCAAUAAAUAUUUAAUCAUAUGGUUGCUCCCCUUUGAAGAGUAGGCUUGUUAACGUGGGUGACCUGAAGGCGUAUCUGCGCAGCGAGCAGGAGCACAUGCGGGGGGACUCACAGACCAUGCUGCUGCAGAGGAUGGCGUGCGAGGUCGCCGCGGGGCUGGCCGCCAUGCACAAGCUGCACUUCCUGCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-112.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -119.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 72.45

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((((.......)).))).....((..(((((((((.((....))((((.(((...)))))))((((((((.((((..((((((((....((((((.........))))))....)))).)))))))).)))))))).((((((...(((....((((((((...(((....)))...))))))))..)))...)))))).((((.(((((...((((((((((((....((((((((..(((((.((((((......((.(((....))).))..)).)))))))))...)))).))))...))))))))((((......)))))))).))))))))).))))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

...{{(((,,,..,,||,|}}.,...||,.{||||{||||||{{,{{{(({{.(((...))))}}|((((((((.((((..{{({{(({....((((((.........))))))....}))).,,)})))).)))))))),((((((...(((..,.((((((((...(({....}))...)))))))).,)))...)))))).({{{{(((((...((((((((((((....((((((((.,(((((.((((((......((.(((....))).))..)).))))))))).,.))))}))))...))))))))((((......)))))))).))))))))).))))))))}},.