Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LMTK2_0005100
Sequence Length
2924 nt
GC Content
0.5359
AAAAGAGACCCGCGGCUGAAGAUGUGCACAGGCUGCUGACUUACCUGCGGCUGCAGAGCCAGCGGGACUCAGAGGUCGACUUUGAACAGCAGUGGAACGCUCUGAAGCCGAACACAAACAGCAGAGACUCCUCCAACAAUGCUGCAUUCCCAAUUCUCGACCACUUUGCCAGGGACCGGCUGGGUCGUGAAAUGGAGGAAGUCCUCACCGUGACCGAAACCAGCCAGGGCCUGAGCUUCGAGUAUGUCUGGGAGGCCGCUAAGCACGACCACUUUGACGAGCGCAGCCGGGGCCACCUGGACGAAGGCUUGUCCUACACGAGCAUCUUCUAUCCGGUUGAAGUUUUUGAGAGUUCGCUUUCAGAUCCUGGGCCCGGAAAGCAAGAUGACAGCGGCCAGGAUGUCCCCCUGAGGGUCCCUGGAGUGGUUCCUGUUUUUGAUGCCCACAACCUUUCUGUUGGAAGCGACUAUUAUAUCCAGUUAGAAGAAAAAAGUGGUAGUAACUUGGAGCUUGAUUACCCACCAGCGCUGCUCACAACCGACAUGGAUAAUCCAGAAAGGACUGGCCCUGAACUGUCCCAGCUCACGGCGCUCAGGAGCGUUGAACUUGAGGAGUCCAGUACAGAUGAGGACUUCUUCCAAAGCAGUACAGACCCCAAAGACUCUAGCUUACCAGGGGACUUACACGUGACCAGUGGCCCCGAGAGCCCUUUCAACAAUAUAUUUAAUGAUGUGGACAAAUCGGAAGAUUUGCCCAGUCACCAAAAAAUAUUCGACUUAAUGGAAUUAAACGGAGUUCAAGCCGACUUUAAACCUGCCACUUUAAGUUCCAGUUUGGAUAACCCCAAAGAGUCAGUCAUAACAGGCCACUUUGAGAAAGAAAAGCCCCGUAAGAUUUUUGACAGUGAGCCUCUCUGCCUAUCAGAUAAUCUUAUGCACCAAGAUAAUUUUGAUCCAUUGAAUGUUCAAGAAUUGUCAGAAAACUUUUUAUUUCUUCAAGAGAAAAACUUACUAAAAGGCUCAUUGUCCAGCAAAGAACACAUAAAUGAUCUUCAGACAGAACUUAAGAAUGCUGGUUUUACUGAAGCUAUGUUAGAAACGUCAUGUAGAAACUCUUUAGAUACUGAGCUUCAGUUUGCUGAAAAUAAGCCAGGCUUGUCUUUGUUGCAGGAAAACGUAAGCACAAAGGGUGACGAUACAGAUGUCAUGCUCACAGGUGACACUUUGAGCACCUCAUUGCAGUCUUCCCCGGAAGUGCAGGUACCUCCUACCUCCUUCGAAACAGAAGAAACGCCCCGUCGGGUACCCCCAGACUCACUCCCAACACAGGGAGAAACCCAGCCCACGUGUUUAGAUGUUAUUGUCCCGGAGGACUGUCUCCACCAGGACAUCAGUCCAGACGCUGUGACUGUCCCGGUUGAAAUUCUCUCAACUGAUGCCAGAACCCACAGCCUGGAUAACAGGUCCCAGGACUCUCCUGGCGAGAGUGAGGAGACCCUGCGACUCACCGAAAGUGACUCUGUUCUUGCUGAUGACAUCCUUGCCAGCAGGGUGAGUGUAGGGAGUAGUCUCCCGGAACUGGGACAGGAAUUGCACAAUAAACCAUUUUCGGAAGACCAUCACAGUCAUCGCCGGCUAGAGAAAAACUUAGAGGCUGUGGAGACUUUAAAUCAGCUCAAUUCUAAAGACGCAGCAAAAGAAGCAGGCUUGGUGUCUGCCCUCUCCUCGGACUCAACCAGUCAGGACAGCCUCCUGGAGGACAGCUUGUCAGCACCCUUCCCAGCCUCUGAGCCGUCCCUGGAAACCCCGGACUCUCUGGAGUCAGUGGAUGUCCACGAAGCGCUACUGGACUCUUUAGGAUCUCACACUCCCCAGAAACUAGUGCCCCCCGAUAAGCCGGCAGACAGUGGCUACGAAACAGAGAACUUGGAGUCUCCCGAGUGGACCUUGCAUCCCGCUCCCGAGGGCACCGCAGACUCAGAACCAGCCACCACGGGCGAUGGCGGCCACAGCGGUCUGCCUCCCAACCCGGUCAUUGUCAUCUCAGAUGCCGGCGAUGGUCACAGAGGCACAGAAGUGACCCCUGAGACGUUCACAGCUGGCUCCCAGGGUUCAUACCGAGACUCUGCGUACUUCUCAGACAAUGACUCUGAGCCCGAGAAAAGGUCUGAGGAGGUCCCGGGAACCUCCCCAUCCGCCUUGGUGUUGGUACAGGAGCAGCCCCUACCCGAGCCAGUCCUCCCCGAGCAAAGUCCUGCUGCCCAGGAUAGCUGCCUGGAAGCCAGAAAGAGCCAGCCAGAUGAAAGUUGUCUGUCUGCUUUGCACAACUCCAGUGACCUGGAAUUAAGAGCCACGCCGGAGCCAGCACAGACUGGUGUUCCCCAGCAGGUGCAUCCCACGGAAGACGAGGCCAGCAGUCCCUGGAGUGUGCUGAAUGCAGAACUUAGCAGCGGCGAUGACUUCGAGACACAGGACGAUCGCCCCUGCACCCUCGCUUCCACGGGGACCAACACGAACGAACUCCUUGCCUACACCAAUUCUGCGCUGGACAAGUCCCUGUCCAGCCACUCCGAGGGCCCGAAGUUGAAGGAGCCGGACAUCGAAGGGAAGUACCUGGGGAAACUCGGGGUGUCAGGGAUGCUCGACCUCUCAGAGGACGGGAUGGAUGCAGACGAGGAGGACGAAAACAGCGACGACUCGGACGAGGACCUGCGGGCCUUCAACCUGCAUAGCCUCAGCUCCGAGUCGGAGGACGAGACCGAGCACCCCGUGCCCAUCAUCCUCAGCAACGAGGACGGAAGGCACCUGCGGAGUCUGUUGAAGCCCACAGCGGCCAAUGCCCCCGACCCACUGCCCGAGGACUGGAAGAAGGAAAAGAAGGCAGUCACGUUUUUCGAUGAUGUCACAGUCUACCUGUUUGACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-997.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1045.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 498.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((.....(((((..(((.(((.....(((((((.....(((((((((....)))).)))))..((((((.....)))))).)))))))....))))))..)))))........((((((((....)))......)))))...(((..(((((((.(((....(((.((((((((((((((..((...(((((((((((((((((((((.(.....(((.(((((((........(((((((.((((..((....(((((((.(((((((((((((((...((((((....))))).)....))))))).....((..((((((((.(((((....((..((((((((....))))))))..))....))))).)).))))))....)).(((((..(.(((.....))).)))))).((((.((........))...))))....((((((.((((.............))))..))))))...)))))))).))........)))))....))..)))))).)))))....((....((((...))))....))...)))))))..))).....).))))))((((....))))(((.(((.((....)).))).))).)))))))))))))))...))(((.((.((((..................)))).)))))((((..(((((((((..((((....))))...(((((.(((..((((.(((.((((((....)))))).)))))))...))).))))).(((((..(((........((.((((((((.((.((((((........)))))).))..))))))))..)))))..)))))..........)))))))..((.(((((.(((((..((...(((((.((((((((((((.((((.....))))..(((((.......)))))..(((((((...((((....)))).....))))))).........((((((...))))))...........))))))))))))(((((((((.((......)).)))((((.((...........))))))....(((((((((..((.......(((.((.(((...))).)))))))..))))))))))))))))))))..))..))))).))))).))...))...))))..((((...(((.((.(((...((((...((((((.((......)).))))))...))))...))).)))))....))))(((((.....))))).((((......)))).........((((((....))).)))...(((((......)))))..)))))))).((((......))))...(((((.((.(((.....))).)).)))))...((((((..((((((.(((...(((((((.......)))))))....)))....))))))))))))....)))))).)).).....))))))))))..)))....(((.((((((.(((((((((((.(.(((((.((..(..((((((((...(((((((((.(((...((...((((.((((((.(((....................))).)))))).))))..))))).)))))..(((((((........))))..(((((((.(.((((((..((((((...........(((((............(((((((.((.(.((((...(((..(((..((..((((((.....)))))).))....((((((.(((.((.((((..((((((((.(((((((((..(((((((((((....))))).(((((.((((..((((.(((...)).).)))).)))).)).)))(((((((..(((....(((..((((..(((((((((((((((((......(((.....)))(((((((((((((((..........))))))....)))......)))))).......(((......)))((.(((((((.....)).))))))).......))))))))))........)))))))((..(((.(((.(((((....))).)).))).)))..))....(((((((((((((((........))))))).(..((((((((((.....(((.......))).....))))))))))..).((((..((((..........(((((((.((((.(((((..((.(......).))......(((((((((...((((((.....)))))).)))...(((((((.((...........(((((((...)))))))(((((((((((((.((((((.((((((.........(((.(((((..(...((((...((((......))))...))))...)..)))....)).))))))..))).))))))))))).))).))))).....((((.((((((...(((........)))..)))))).))))...)).)))))))))))))..............))))))))).)))))))...((.((((((((......))))))))))....)))).))))........))))))))..))))..))).)))..)))))))....)))))).)))))))))........))))))))..)))).)).))).)))))))))..))).........((((((((((((((...((((((.......))))))...)))).).))))))))))))).))).))))))).....(((((..((.(((((......))))).))..))))))))))))).)))))))))))))))))(((....))).))).....)))).)))))).))..)..))...))))).).))))))...))))).))).))).))).....)).)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,.({,....(((((..(((.(((..,..(((((((.....(((((((((....)))).)))))..((((((.....)))))).))))))).,..))))))..)))))........((((((((....}))......)))))...{((..(((((((.(((....{((.((((((((((((((.,{,...(((((((((((((((((((((.(.....(((.(((((((.{,,{.,,(((({,(,{(((,.((,..,(((({((.((((((({(((((((...((((((....))))).)....))))))).....({..((((((((.(((((.,..((..((((((((....))))))))..)).,}.))))).)).))))))....}).(((((..{.(((.....))).}))))).||{{,|{..,,,...},.},)))}....{(((({,((((.............}))),.}))))}...}))))))).))..,,}}}.))))}....)),.))))}),)))))....((....((((...))))....))...)))))))..))).....).))))))((((....)))){((.(((.((....)).))).)),.)))))))))))))))..,},{{{.{{.{{{(.,,{,,....,|||....||||.|||,},{{{..{,(((((((..((((....))))...,{{((.(({..((((.{((.((((((....)))))),))}))))...,},.}))),.(((((..(((........((.((((((((.(({{{{{({........)))))))),..))))))))..)))))..)))))..........)))))))..{{.{{{{{.{{{||,,{{,,,,,,,,.((((((((((((.{{((,....}}}}...}}},,.}......(((((((((((..{{{...,}).)))))))))))),{{,.........{{(({,...))))},...........))))))))))))(((((((((.(,......}}.}}}|,{{.,{,,,||..,,..},}}))}}},(((((((((..((.......{((.,,.{{{...,}),}}})}))..)))))))))})))))..,,,.,}}..))))),))))),}}|,.}}...}}))..((((...(((.((.(((...((((...((((((.((......)).))))))...))))...))).)))))....))))(((((.....))))).((((......)))).........((((((....))).)))...(((((......)))))..)))))))).((((......))))...(((((.((.(((.....))).)).)))))...((((((..((((((.(((,..(((((((.......)))))))..}.)))....))))))))))))....)))))).)).}.....))))))))))..)))|.,.{((.((((((.(((((((((((.(.(((((.((..(..((((((((...(((((((((.(({.{{{,...((((.((((((.(((....................))).)))))).))))..)}}}}.})}}},.{{{({,(,,.....,)),,..(((((((.(.((((((..((((((...,,......(((((........,,.,(((((((.((.{.((((,,,(((..(((..((..{(((((.....)))))).)}....((((((.(((.((.((((..((((((((.(((((((((..((((((({.(({..(((((((((((.{((,......}}})))))}}}))))..})),}.,.....(((((((..{{{..,.(((..((((..(((((((((((((((((........({{..,{{{(,(((({,,((((((..........))))))..},))}}.}}|,|||}}}.......{{{.,..,,||,{..(((((((.....))}))))),},...,,,))))))))))........)))))))((..(((.(((.(((((....))).)).))).)))..))...,(((((((((((((((,.....,,))))))).(..((((((((((..,..(((.......))).....))))))))))..).((((..((((.......,..(((((((.((((.(((((..((.,......}.)}..,,..(((((((((...((((((.....)))))).)))...(((((((.((..,{,{..,,.(((((({...})))))){|||||||((((,,((((((.(((((((..,.....,((.,{({({.{...((((...((((......)))),..))))...|..}))....}),}}))))..))).))))))))))).,,,.}))}}.....((((.((((((...(((........)))..)))))).))))...)).)))))))))))))..............))))))))).)))))))...{{.((((((((......))))))))}}....)))).))))........)))))))).,))))..))).}))..)))))))....)))))).)))))))))........))))))))..)))).)).))).)))))))))..}},.........(((((((((,((((...((((((.......))))))...)))).,.))))))))))))).})).))))))).....(((((..((.(((((......))))).}),.))))))))))))).)))))))))))))))))(((....))).}},.....)))).)))))).))..)..})...})))).).))))))...))))).))).))).)))))}..||{,,,...}}}
Back