Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LPHN3_0013900

Sequence Length

418 nt

GC Content

0.5502

GUGGCAAGCACAGUGAACGACAUCCUGCCCUUGCUGCUCCAUUGCGACACGCUGAGCGCAGCCCAGGAGGCGCUCUUCCACCCAGACAUCUGCUUCAGCAGCCAGCUGCAGAGCGCACCGCUGCUCAUCGUGGACAAGGGCCCCGUGGAGCUACCAGAGGAGUUCGCGGUCCAGGUGCCCAAGGAGCACAGAUUGCAGCGCAAGCUUUCAGCCGUGCCCCAAUUCCAAUGGCUGUGGUCCGCAGAGAGCUAUCCUGUGAGAGCUAUCCUAUAGAGCUUCGCUGUCCAGGAACAGACGUCAUCAUGAUAGAAAGUGCCAACUAUGGCAGGACUGAUGACAAAAUUUGUGACUCUGACCCUGCUCAGAUGGAGAAUAUCCGAUGUUAUCUGCCAGAUGCCUAUAAGAUUAUGUCUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-136.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -141.53

Frequency: 0.0002

Diversity: 98.64

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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