Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LPHN3_0019800
Sequence Length
1325 nt
GC Content
0.4634
AUAUCUCUACCACAGGACCUCUUGGCAUGGGAAGCACUACCACCAGUACCACCCUUCGGACCACAACUUUGAGCCCAGGAAGGAGUACCACCCCGUCAGUGUCAGGAAGAAGAAACCGGAGUACUAGUACCCCAUCUCCAGCUGUCGAGGUACUUGAUGACAUGACCACACACCUUCCAUCAGCAUCGUCCCAAAUCCCAGCUCUCGAAGAGAGCUGUGAGGCUGUGGAAGCCCGAGAAAUCAUGUGGUUUAAGACUCGUCAAGGACAGAUAGCAAAGCAGCCAUGCCCUGCAGGAACUAUAGGUGUAUCAACUUAUCUAUGCCUUGCUCCUGAUGGAAUUUGGGAUCCCCAAGGUCCAGAUCUCAGCAACUGUUCUUCUCCUUGGGUCAAUCAUAUAACACAGAAGUUGAAAUCUGGUGAAACAGCUGCCAACAUUGCUAGAGAGCUGGCUGAACAGACAAGAAAUCACUUGAAUGCUGGGGACAUCACCUACUCUGUCCGGGCCAUGGACCAGCUGGUAGGCCUCCUAGAUGUACAGCUUCGGAACUUGACCCCAGGUGGAAAAGAUAGUGCUGCCCGGAGUUUGAACAAGCUUCAGAAAAGAGAGCGCUCUUGCAGAGCCUAUGUCCAGGCAAUGGUCGAGACAGUUAACAACCUCCUUCAGCCACAAGCUUUGAAUGCAUGGAGAGACCUGACUACGAGUGAUCAGCUGCGUGCGGCCACCAUGUUGCUUCAUACUGUGGAGGAAAGUGCUUUUGUGCUGGCUGAUAACCUUUUGAAGACUGACAUUGUCAGGGAGAAUACAGACAAUAUUAAAUUGGAAGUUGCAAGACUGAGCACAGAAGGAAACUUAGAAGACCUAAAAUUUCCAGAAAACAUGGGCCAUGGAAGCACUAUCCAGCUGUCUGCAAAUACCUUAAAGCAAAAUGGCCGAAAUGGAGAGAUCAGAGUGGCCUUUGUCCUGUAUAACAACUUGGGUCCUUAUUUAUCCACGGAGAAUGCCAGUAUGAAGUUGGGAACGGAAGCUUUGUCCACAAAUCAUUCUGUUAUUGUCAAUUCCCCUGUUAUUACGGCAGCAAUAAACAAAGAGUUCAGUAACAAGGUUUAUUUGGCUGAUCCUGUGGUAUUUACUGUUAAACAUAUCAAGCAGUCAGAGGAAAAUUUCAACCCUAACUGUUCAUUUUGGAGCUACUCCAAGCGUACAAUGACAGGUUAUUGGUCAACACAAGGCUGUCGGCUCCUGACAACAAAUAAGACACAUACUACAUGCUCUUGUAACCACCUAACAAAUUUUGCAGUACUGAUGGCACAUGUGGAAGUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-364.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -387.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 427.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((((((((.(((((..(..(((.((((((((((((.((((...(((((((..((......))..))...))))).))))(((.......)))..((((.((((((...((((..............)))).((((((..(...((((((((...(((((((...((((((.((((.(((..........((((((((...))))))))))).))))))))))...((....)).)))))))......))))))))..).))))))...(((....)))...(((((...((((((((........)))))))).)))))..((((((((.((((((...)))))).))))....))))......)))))))))).(((((((............(((((((..((((((.((.....((((((.....(((((....)))))........((((......))))...(((((...(((..(((.........)))..)))..)))))))))))...))))))))...))))))).....)))))))..)))))......))))))).)))(((((((....))))))).)..)))))((.(((((...))))))).((((..(((....)))..))))..............(((((((.((((((((.(((((.(((.(((...(.((((...(((((..((.(((.((((((.....((((((.....(((((((((.((((((((((((((((((..((((..(((.((...(((.((((((.(........).)))))).)))..)).)))))))..)).)).))))))...(((((.((((.....))))..)))))......((((...)))))))))))).))).....)))))).........))))))..))))))..))).)).)))))..))))).))).)))))))).....(.(((((........))))).)((.((((.(((.((((..((((((.((((...))))))).))).)))).))).)))).))(((((.....(((((.(....).))))).....)))))......))))))))...))))))))))))))))....((((((..........)))))).)))))..((((((.(((.(((((..(((((((((((...))))))......)))))..)))))..)))...((((.(((((((((...(((.(((...((((((..(((.....))).))))))................))))))..)))))))).).))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{..{({{{{{{{{{|||,{|({{{{(..(((.{(((((((((((.((((...(((((((.,({......})..}),..))))).))))(((.......}}}..(((,,(((({,...((((..............)))).((((((..,{,.((((((((...(((((((...((((((.((((.(((..........((((((((...))))))))))).))))))))))...{{....}}.)))))))......))))))))..).))))))...(((....})).,,{((((...((((((((........)))))))),))||||,||{{((((.((((((...)))))).))))....,||||,.,,||}))}}}})|.(((((((............(((((((..((((((.((..,.,((((((.....(((((....))))),...,,..((((......))))...{{((({..{{,..|||,..,,||,,})}..})),.))))))))))),..))))))))...))))))).....))))))).,)))))......))))))).)))(((({((,...,}|||||.....,}|}||,(((({...)))))||.{(((..(((...,))),.))}},|,..,,,.}}}}.(({(({{.,,{{{{{{,,{((({({({,{,.||{,({{{...{{{||,,||.|||}|{{(((,,{{{{{(((({{{,,{({{{{({{.{((((((((((({(((((,,(((({({((,{....(({.((((((.(,.......).)))))}.}}}..}}|}}})}}},.}}.}}.}))}))},.(((((.((((.....))))..)))))......{{{{,,,}}|},}}}}}}}.))),||,.}}}}),.........,}))},..))))}}..,})|)}.}}}},..})))||}}},}}}}}|,,..,,,,.|||||,,......,}))},|{,.,,{{|(((,(({{.,{(((({,((({,,.||||}}}.}}},}}}},)))|||||||}.,|||,,|{{{({{{{{||{{|,|||{{{{...,.|||.....,)}}})))),},}}))))},})))))))}...,{{{{{..........||||||.{{.{{..........}})}.}}))}}.,,{((((((...))))))}.,.,|}}})}}}))}))})))}},.||||}|||{(((((.,.|||}||....(({(({..{{{.....}}}.))))))..............,,}))))),)})))}))),).))))),.))}}}}
Back