Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LPHN3_0022900
Sequence Length
1508 nt
GC Content
0.4463
UUGAAAUCUGGUGAAACAGCUGCCAACAUUGCUAGAGAGCUGGCUGAACAGACAAGAAAUCACUUGAAUGCUGGGGACAUCACCUACUCUGUCCGGGCCAUGGACCAGCUGGUAGGCCUCCUAGAUGUACAGCUUCGGAACUUGACCCCAGGUGGAAAAGAUAGUGCUGCCCGGAGUUUGAACAAGCUUCAGAAAAGAGAGCGCUCUUGCAGAGCCUAUGUCCAGGCAAUGGUCGAGACAGUUAACAACCUCCUUCAGCCACAAGCUUUGAAUGCAUGGAGAGACCUGACUACGAGUGAUCAGCUGCGUGCGGCCACCAUGUUGCUUCAUACUGUGGAGGAAAGUGCUUUUGUGCUGGCUGAUAACCUUUUGAAGACUGACAUUGUCAGGGAGAAUACAGACAAUAUUAAAUUGGAAGUUGCAAGACUGAGCACAGAAGGAAACUUAGAAGACCUAAAAUUUCCAGAAAACAUGGGCCAUGGAAGCACUAUCCAGCUGUCUGCAAAUACCUUAAAGCAAAAUGGCCGAAAUGGAGAGAUCAGAGUGGCCUUUGUCCUGUAUAACAACUUGGGUCCUUAUUUAUCCACGGAGAAUGCCAGUAUGAAGUUGGGAACGGAAGCUUUGUCCACAAAUCAUUCUGUUAUUGUCAAUUCCCCUGUUAUUACGGCAGCAAUAAACAAAGAGUUCAGUAACAAGGUUUAUUUGGCUGAUCCUGUGGUAUUUACUGUUAAACAUAUCAAGCAGUCAGAGGAAAAUUUCAACCCUAACUGUUCAUUUUGGAGCUACUCCAAGCGUACAAUGACAGGUUAUUGGUCAACACAAGGCUGUCGGCUCCUGACAACAAAUAAGACACAUACUACAUGCUCUUGUAACCACCUAACAAAUUUUGCAGUACUGAUGGCACAUGUGGAAGUUAAGCACAGUGAUGCGGUCCAUGACCUCCUUCUGGAUGUGAUCACGUGGGUUGGAAUUUUGCUGUCCCUUGUUUGUCUCCUGAUUUGCAUCUUCACAUUUUGCUUUUUCCGGGGGCUCCAGAGUGACCGUAACACCAUCCACAAGAACCUCUGCAUCAGUCUCUUUGUAGCAGAGCUGCUCUUCCUGAUUGGGAUCAACCGAACUGACCAACCAAUUGCCUGUGCUGUUUUCGCUGCCCUGUUACAUUUCUUCUUCUUGGCUGCCUUCACCUGGAUGUUCCUGGAGGGGGUGCAGCUUUAUAUCAUGCUGGUGGAGGUUUUUGAGAGUGAACAUUCACGUAGGAAAUACUUUUAUCUGGUCGGCUAUGGGAUGCCUGCACUCAUUGUGGCUGUGUCAGCUGCAGUAGACUACAGGAGUUAUGGAACAGAUAAAGUAUGUUGGCUCCGACUUGACACCUACUUCAUUUGGAGUUUUAUAGGACCAGCAACUUUGAUAAUUAUGCUUAAUGUAAUCUUCCUUGGGAUUGCUUUAUAUAAAAUGUUUCAUCAUACUGCUAUACUGAAACCUGAAUCAGGCUGUCUUGAUAACAUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-411.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -439.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 588.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((.(.(..(((((..(..........)..)))))..).).))))((((......))))..((((..((((((......(((((((((((((((...(((.((((((((..(((.((........))..))).))))...)))).)))........)))..))))))..((((((.....)))))).(((((....)))))))))))...)))))).))))...((((((((((((((.(((((((....(((.((((..(((.(((((.(((.(((...(.((((...(((((..((.(((.((((((.....((((((.....(((((((((.((((((((((((((((((..((((..(((.((...(((.((((((.(........).)))))).)))..)).)))))))..)).)).))))))...(((((.((((.....))))..)))))......((((...)))))))))))).))).....)))))).........))))))..))))))..))).)).)))))..))))).))).))))))))..))))))))))((............)).....((((((((((.(((((((.(((.((((((((...........((((((((((((..((((.(((.(((((((((((((((((((.....(((....)))...)))))))..))))...))))))))...((((((..........))))))))).))))......................(((((((...))))))).).)))))))))))............)))))))).)))..))))))).....((((((..(((.....))).)))))).......(((((......(((((...(((((((((.(((((((...((((..(((((...(((((.((......)))))))...)))))((((((.((....((((.(((.(((....((((((.((...(((...........)))....)).))))))....))).))).))))..))))))))......((((((..(((.....)))..)))))).))))))))).((((((..(((.......)))....)))))))).)))))))))...)))))..)))))..............((((((((((.((.(((...))).))..)))).)))))).....))))))))))))))))).))).(((((..(((((.(((((.....(((.......)))...))))))))))....)))))((((((((((...)))))))))).......((.(((.((((((((..((((((.((((((.(((.....(((.((..........)).))).....)))))))))))))))....(((((..(((.((((((((....)))))))).))))))))..))))))))...))).))...((((........)))))))))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((,.,,,((({...,{({,((({{{,,.(({{{..,})))}},...{{,.((((......))))..||(({{((,{{,..{((((((((((((,,,..}}}}|||},,||}|||..{{{.,{,,{{.,.,|||||||,{,||.,,|}}|||{|..,,{,,{{|{{,|||,(((({((,,,.,,||}}},|..,{{{{{{,(({{|...))))),..,||,|{|||{{{{(({(,(,(((({......,((({(({(,,,..{((((((,.{(((,{{(({{{,{(({,,..,,{{{,|{||||,|||{|{,(({{{((({{{((((({{{{|||||{,...,{{(((((((({((((({,(((({({{{.,....{({,((((((,(,,.,,,,.}.||||||.}},..}}||}}}|||,.}|,|}.||}}}}},,(((({.((((.....)))}..))))).....,||||||||||||,,}},}}.}}}}||}|}}|||,......,,..,)),...}))),|...||||..|{{|,{{|}|||||.}||,||{{,..,|,,|.{||||,,,,,,,.,)))}.}|,.,,,||(((,((((.{((((((,((({{{,|||||,,.}}},|},}||||||||||||.||||,,||{,((((({(((((({{{({{(...,.{{{,,,,,}}...}}}}})},,))))..,)}}}}}}}...,{{{{,..........||{{{{.{{.((..........}))).)))))}...{((((((...))))))}.,.}}}))))))))}}))))))}}.,)))))))|{{|{{.,,)))))}....((((((..{{{.....})).)))))).........,,...,,,,|||||}.}||{||||||}||||,,|}..{||{..({({(,,,(((({.{{...,,.}}})))},,.)))))(((((,{((....((((.(((.(((....((((((.((...(((...........)))....)).))))))....))).))).))))..))))))))..,,.,|||{{{.}|||}},,,)))}}})))))}),,.,,,,)}||,,||},,,.....}}})),,}.}))}}))))})),)))}))},.})))).|}}}}.,,,..,,.,,....|({{{(((((,{{,(({...})).)),,)}}),)))})}.....,|}|}}}}|||||||||{||..,.((({.,..)))).,,,))}|{|||||{{((((.....({{{{{....((((.,.({((((((((((...)))))))))).)}.,.)))),,})))))..))))))}}}}))}}}||},,|,...|{,}}}}...}))).||||.|||.,.|{|||||{||..,,||||,..{{{{{..{({.((((((({....}))))))).})},}}},..,{{{{{|..|{|....}}}..))))}},,,..,))))))))))))},}}).)))}
Back