Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LPHN3_0029000
Sequence Length
380 nt
GC Content
0.4211
AUUGCCUGUGCUGUUUUCGCUGCCCUGUUACAUUUCUUCUUCUUGGCUGCCUUCACCUGGAUGUUCCUGGAGGGGGUGCAGCUUUAUAUCAUGCUGGUGGAGGUUUUUGAGAGUGAACAUUCACGUAGGAAAUACUUUUAUCUGGUCGGCUAUGGGAUGCCUGCACUCAUUGUGGCUGUGUCAGCUGCAGUAGACUACAGGAGUUAUGGAACAGAUAAAGUAUGUUGGCUCCGACUUGACACCUACUUCAUUUGGAGUUUUAUAGGACCAGCAACUUUGAUAAUUAUGCUUAAUGUAAUCUUCCUUGGGAUUGCUUUAUAUAAAAUGUUUCAUCAUACUGCUAUACUGAAACCUGAAUCAGGCUGUCUUGAUAACAUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-98.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -105.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 65.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((.((.((....)).)).((((..(((..(((((...(((((.((((((...(((...)))))))))((((((((...(((.((((((((((((((((((((..(.((((....)))).)..)))).))))))))).....))).)))).))).))))))))((((((((((...)))))))))))).))).)))))..)))..)))).((((((.((((((.(((.....(((.((..........)).))).....)))))))))))))))....(((((..(((.((((((((....)))))))).))))))))...((((((..(((....)))..))))))......))))).)).(((((...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{.(((((.((.({....}).}}.((((..(((..(((((...{(((({(((((,,,.(((...})),))}))||{{{(((|,.,,,.,{{,((((((((((((((((..,.((((....)))).,..)))).))))))))).,,|,|}|.}}}}.,.),))))))}}{(((((((((...))))))))))}).}}}.)))))..))).,)))).{(((((.((((((.(((.....(((.((..........)).))).....))))))))))))))}....{(({{..{({.((((((({....}))))))).})),}}},...((((((..(((....}))..))))))......))))).}}.(((((...)))))
Back