Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LPHN3_0030900

Sequence Length

295 nt

GC Content

0.4305

GUCAUGGGUUAUAGGUGCAAUAGCUCUUCUCUGCCUAUUAGGAUUGACCUGGGCCUUUGGACUCAUGUAUAUUAAUGAAAGCACAGUCAUCAUGGCCUAUCUCUUCACCAUUUUCAAUUCUCUACAGGGAAUGUUUAUAUUUAUUUUCCAUUGUGUCCUACAGAAGAAGGUACGAAAAGAGUAUGGGAAAUGCCUGCGAACACAUUGCUGUAGUGGCAAAAGUACAGAGAGUUCCAUUGGUUCAGGGAAAACAUCUGGUUCUCGAACUCCUGGACGCUACUCCACAGGCUCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-74.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -79.88

Frequency: 0.0001

Diversity: 52.26

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((...(((.((....)).)))....))))).......))))((((((((.((((......((((.(((((....(.(((....(((..((((((((((((((.(((((.......(((((((((.((........)).)))).))))).......))))).)))..))..)))).)))))..))).))).)....))))).))))(((((....((.(((.((((((....((.(((((.......))))).))..))))))))).))))))))))).)))).).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((({{{{(.,,(((,((....)).}},....)))))}......))))((((((((.((({.((((........))))..,{,,,(,,..(((..((((((((((((((.(((((.......(((((((((.((........)).)))).))))).......))))).)))..)}.,)))).)))))..))).,}},,......,})}}||{(((((....{{.(((.((((((....((.(((((.......))))).))..))))))))).})))))))))).))))}}.)))