Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0000100
Sequence Length
1503 nt
GC Content
0.3965
AAGGACCAUGUCUCAUACAUUCCAUGAAUGGAGACUUGUUGAGGACCUUGGAGGGUCCUGAAAACUGCCUGAAACCAAAACUCAUUCAGGCUUCAAGAGAGGGUCAUUGUGUCAUAUUCUAUGAAAACGGCCUCUUCUGUACAUUCAGUGUGAAUGGAAAACUCCAGGCCACGAUGGAAACAGAUGAUAACAUAAGAGCCAUCCAGCUGAGCCGAGAUGGGCAGUACCUGCUCACAGGAGGAGACAGAGGAGUGGUCGUGGUCCGGCAGGUGUCGGACCUCAAGCAGCUCUUUGCCUAUCCAGGAUGUGACGCUGGAAUCCGGGCCAUGGCGCUGUCUUACGACCAGAGGUGCAUCAUUUCUGGCAUGGCUUCAGGAAGCAUUGUGCUAUUUUACAACGACUUUAACCGGUGGCAUCAUGAAUACCAAACCCGCUACUGAUGGUGACAGCUGUACAUCAACUCUGCCCCUAGGAUGAGCAGAAGUACCUGGAGCAUCAUUCUCUUCUACCACAUCUGAAUGUAACUUAAAUUUGCUCAAAGAAGCAAAAUAUUUUUUAAAGUUAUUAAUAAUUGCUAUUUUUGUAGUCUUUGCUUGACUUUUUUGGGGGGGAUUAGCAAAGCAGAAAACUGGCUGCUGGGUUCUGUAGUUUUAAAAAAUCUAUAUUUUUAGUCAUAAUGAGAAGUCUAUUUUCACCAAUUAUGGAAACAUACAGUGGAGCAAGUAAACCACUUAUUCCAGCUAUAAUAUUAUGAAGAACAUUUCCCAUGCAUCUACAAGCUUGAGAAAUAGGAUUUUCACAGUGGGGAAGUGGGUUACAAUAUUGGAAUAGGAAAAUUUGAUGCUGUAAUUUGGGUCCUGUAUUUUUCCAAACAACUGUGCUUCUUCAGCACUAAUAUUUCUGGGAUUUAAAUAGUAAUGUUUAAAUUAUGGUAAAUGUAAUUUAAAACAUCUCAAUUAAGUCUGUCUAUCAAUAUUGUUCUUCAAGCAUGUUUUAGACCUAGAAAAGUAUGGUUUGGGGGAGGCUAUUUUAUUGUGUGGUUAGCACAAGGAAUCUAAUUUAUAGCAAGUGUGAAAUAGUUACCAUUUUUUCCUGAUCUGUCAUCUUCAUAGCACAACAAAACGAAAUGAUGGAAAUGCUCUUGAGCUCACAACAUUUGUUUUUCUUUUAAAGUAAAUGCAAGUACCAAAGCUCACUACUGCGGUUUGCCUGUGCCUGGACAAUGAGGCGGAGCCACUGUUGUUUUGUUGGGGCACCCCCUUCCCUCCCCGGGUUUGCAAAUAGAGGCUACCGGGUGCUGUAUUCAGCAACACCUGUUUUACUAUUUGUUAUUAAACUAUCAUCUCCACCUUCCUUUUGAUUAGCAAUUUGUACUAAGAAACGAAACAAUGUUAUUUGGUGGUGUAUAAUUCUACUUUUCUAGUAGAUUACUGUGUGGAAUUCUGUGAAAAAUAUUUGAGAAAAGGCCUGUAUUGCAUAAAUAAAUUCUUUGUAUGUUGUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-405.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -437.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 404.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((.(((((...(((((...)))))))))).))((.(((((((....))))))).))....(((((((...........)))))))....((((.(((((...((.(((((...)))))..))))))).)))).(((((((((((((..((((....))))(((((((((((......(((....))).....)))))..).)).)))....(((((((...)))))))..((((((((..((((((((.(((((((((((..(((((((.((((......((.....))......))).).))))))).....))))))))))))))).))))....(((((((((...)))))))))....((((((((((((.(((((......))))).).)))....(((((((..................))))))).(((((((....)).)))))((((((((........).)))).))).)))))))).....))))))))..)))).))))))))).......((((((......))))))...........(((((....)))))((((.((((.(.(.(((((((...(((((....)))))...))))))))).)))).)))).((((((....((.((((.......(((((........((((((((((((.....))))))....)))))).........)))))......)))).))....))))))((((((((.((((((((........(((((..((((.((((.....(((((((((((((((((((((((.(((..........(((.((((((((..((.((((((((.(((((((((........(((.((((..((((((((((...((((((.((((((((((((((...(..((((((((((((((.....)))))))).))))))..)..))))))).(((((..(((((.(((.....)))))))).)))))))))))).)).))))...)))))))).))....)))).)))........))).)))))).))))))))...((((.....))))))..)))))))).)))(((((.(((...............))))))))((((((((...((((((......((((((.((((((...))).))).)))))).....)))))).....)).)))).)).((((((.(((((...(((((.....)))))...))))).)))))))))))))))..(((((....((........))..)))))(((((....)))))(((((......((...(((((((((((...................))))).))))))...))((((((.(((........))).))))))))))).....((((((.....)))))).))))))).)))))))))).................)))).)))).))))).......))))))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.((..,((((,..((((({,.}}}))))}},.,,{(.(((((((....))))))).)}....(((((((...........)))))))..,.{((({(({((..,,{.(((((...)))))..},)))))}))})|(((((((((((((..((((....}))}(((((,(((((......(((....))).....)))))..}.)).)))....(((((((...))))))},.((((((((.,((({((({((((((((((((,.(((((((.((((...,,,({....,))......))).).))))))).....))))))))))))})}.)))}..{.(((((((((...))))))))),...(((((((({(((.{{{(|......}}}}}.}.}},....(((((((....,,.....,,.....))))))).{((((((....)).))))}{{(((((,,.......).)))),.)).))))))))..,..))))))))..)))).))))))))).......,(((((......)))))|{{{{({{{{{,(({{,.,,,,{{{{(({{.....|||||(((({.{||,|,,.{{{{{((((({..|{{|,(((((.....,,,}|}|},{||,{((((({,{{,,{||,.,,,..,,,}}},.{{{{{((((((.....)))))}....}}}))},,,|,,|,||{((((,(,(({..{{||||.|||||.,{....,,.,,((((((.{(((({.{(,((...,,,,.||,|}.}}}||,|,.|||}||,||||||||||}||,,}}}......{{{.((((((((..((.((((((((.((((((((({,..,,..(((.((((..{{((((((((,,.(((({(.((((((((((((((.,.(..((((((((((((((.....)))))))))))))))..)..))))))).(((((..(((({{(((.....)))))))).)))))))))))).)).)))),,,)))))))).},....)))).)))..,,.}}.)))},))))).))))))))...((((.....))))))..)))))))).|||{((((.{((...............)}}}})))}}}..}||}},((((((......((((((.((((({...})).))).)))))).....))))))..,,,))}}...})}|{(((((.,,,,,..}||||{}}},})))))}}}))))){|||,,,)))),)))),}}}||||...||||.|||}})),})|(({(((((....))))),||))}}....,|.,.||||{,.,|}},........,,,,,.......}||,||||}},,,|{{({{{{.{{{|......,))).}))))))}}},..,,.((((((.....)))))).}}}}},)}))))}}}}})}}}}}}}}},}}}}}...))))).|,{|||||,.{{{{....}))))})))}))),.
Back