Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0000600

Sequence Length

1031 nt

GC Content

0.4985

UAUCUCCUCCUGCAGAGUCCAUUGAUGUUCACAGACAAAGCCCAGCAGGAUGUUAUCAUGGUCCUCAAGUUUCCCUCCAACUCCCCUGUUACUCACGUGGCAGCCAACACCCAGCCUGGUUUGGCAACUCCCGCUGUGAUCACAGUCACUGCUAACAGGUUAUUUGCGGUGAACAAAUGGCACAACCUUCCUGCUCAUCAAGGUGCUGUACAAGACCAGCCAUACCAGCUGCCAGUGGAAAUCGAUCCUCUCAUAGCCAGCAAUACAGGAAUGCACAGGAGGCAAAUCACUGACCUUUUAGACCAAAGUAUUCAAGUGCAUUCCCAGUGCUUUGUCAUCACUUCAGACAACCGCUAUAUUCUCGUCUGUGGCUUCUGGGAUAAAAGUUUCAGAGUCUAUUCUACAGACACAGGAAGAUUGAUCCAAGUGGUGUUUGGCCAUUGGGAUGUCGUCACUUGCCUUGCUCGUUCUGAGUCAUAUAUUGGGGGAAAUUGCUACAUUCUCUCAGGGUCACGUGAUGCAACUCUUUUGCUGUGGUAUUGGAAUGGAAAAUGCAGUGGGAUUGGAGAUAACCCAGGCAGUGAGACUGCUGCUCCUCGGGCCAUUUUGACCGGCCAUGACUAUGAGGUCACAUGUGCUGCGGUGUGUGCGGAGCUAGGCCUGGUGUUGAGUGGUUCACAAGAAGGACCAUGUCUCAUACAUUCCAUGAAUGGAGACUUGUUGAGGACCUUGGAGGGUCCUGAAAACUGCCUGAAACCAAAACUCAUUCAGGCUUCAAGAGAGGGUCAUUGUGUCAUAUUCUAUGAAAACGGCCUCUUCUGUACAUUCAGUGUGAAUGGAAAACUCCAGGCCACGAUGGAAACAGAUGAUAACAUAAGAGCCAUCCAGCUGAGCCGAGAUGGGCAGUACCUGCUCACAGGAGGAGACAGAGGAGUGGUCGUGGUCCGGCAGGUGUCGGACCUCAAGCAGCUCUUUGCCUAUCCAGGAUGUGACGCUGGAAUCCGGGCCAUGGCGCUGUCUUACGACCAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-346.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -365.55

Frequency: 0.0000

Diversity: 296.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((((((((.....(((((((((((..((((...........((((((.((.(((.(((((((((.................(((((((....))))))).(((((((..(((((((((.(((.(.(((((((((.(((...(((((((.............))))))).....)))))))...((((((........(((((((........))))...))).((((.(((.(((......))).))....).))))....)))))).((((((((((((..((((((.(((.(((..((((.((((....))))..(((((.(((.(((((.........)))))..((((((........))))))(((((((((....)))))))))(((((((((....(((((.((((...((((.((((((.....)))))).))))(.((((((.(((((.((((.....)))).......((((((((.........))))))))))).)).))))))).....)))).)))))....)))))))))....))).)))))))))...)))...)))))))))...)))..)))))..((((.........)))).(((((....)))))...)))).)))).).)))).)))))))))..))))))).(((((((.......)))))))(((((...(((((...))))))))))...))))))))).))))).))))))......(((((((...........))))))).....((((((....((((.(((((...)))))..))))))))))))))))).)))))).)).((((....))))(((((((((((......(((....))).....)))))..).)).)))....(((((((...)))))))))))))))))........(((((((((((((((....))))))))..(((((((.((..((((.(((((.........)))))....))))...)).)))).))))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

,.((((((((((....{((,,,({{{{{,,|,,|}}...((.{{{(,(((({((,((({((({{((({(,,.{{,,{,{,.,...(((((((....))))))).(((((((..(((((((((.((({(.{(((((((((((,{{{(((((((.....((({.,,((||((|,.,..}},|||,,||||,,,,,......,}|||((((........||||...,|,.(((({,{(.(({...,,,|||,||,,|.}|{|,|{,,,{.{,{,,(((,(((((,,..,{{{(((({{{|||{{{....{{{{..{{{|||||||||{{|||||.,,,{{|||||,,,||{||,,,({,,,,,,,.{{{||||||{((((((((....)))))))))|{,,,,|||}}}}|,,{|}|||,}}},||,,}|||||}...}))))))})))}|.,|,|||}||,,,}|||,|.,}))))........((((((((.........)))))))))))})).)))))},..))))),)})},}}}}}}))},,))),...}),))}}}|}||||...},,))},||||||,....,))))}),.,,,((((.........)))).|}}||..,.)))))}}.,.,,.)))).).}))).)))))))))..))))))).(((((((.......)))))))(((((...(((((...))))))))))...,}}})))||,}}}})})})))}}...,.(((((((...........))))))).....{(((((,{{.,,{{.(((((...)))))..}}))))))))||||.|,{{||||{.{..((((....)))).,|}}}|||||,.}}}}|||}},})),.....,}}))}.)})).)),....{((((((...))))))}))))))))))........(((((((((((((((....))))))))..{{(((((.((.,((((.(((((.........)))))....)))).}.)).)))),}}})))))))...