Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0001400

Sequence Length

1119 nt

GC Content

0.4736

GCCCUGGAGAGUGAAUUUGUUUCCUGCCAGCUUCACCAAUGGAUUGAUCUCAUUUUUGGCUAUAAACAGCAAGGACCAGAAGCUGUCCGAGCCCUCAAUGUGUUCUAUUACUUGACCUAUGAAGGAGCUGUCAAUCUGAAUUCAAUAACUGAUCCUGUGUUGAGAGAGGCUGUUGAAGCUCAAAUCCGAAGUUUUGGACAGACUCCUUCUCAACUACUCAUAGAGCCCCAUCCUCCCAGAGGUUCUGCCAUGCAAGUGAGUCCAUUGAUGUUCACAGACAAAGCCCAGCAGGAUGUUAUCAUGGUCCUCAAGUUUCCCUCCAACUCCCCUGUUACUCACGUGGCAGCCAACACCCAGCCUGGUUUGGCAACUCCCGCUGUGAUCACAGUCACUGCUAACAGGUUAUUUGCGGUGAACAAAUGGCACAACCUUCCUGCUCAUCAAGGUGCUGUACAAGACCAGCCAUACCAGCUGCCAGUGGAAAUCGAUCCUCUCAUAGCCAGCAAUACAGGAAUGCACAGGAGGCAAAUCACUGACCUUUUAGACCAAAGUAUUCAAGUGCAUUCCCAGUGCUUUGUCAUCACUUCAGACAACCGCUAUAUUCUCGUCUGUGGCUUCUGGGAUAAAAGUUUCAGAGUCUAUUCUACAGACACAGGAAGAUUGAUCCAAGUGGUGUUUGGCCAUUGGGAUGUCGUCACUUGCCUUGCUCGUUCUGAGUCAUAUAUUGGGGGAAAUUGCUACAUUCUCUCAGGGUCACGUGAUGCAACUCUUUUGCUGUGGUAUUGGAAUGGAAAAUGCAGUGGGAUUGGAGAUAACCCAGGUGAGACUGCUGCUCCUCGGGCCAUUUUGACCGGCCAUGACUAUGAGGUCACAUGUGCUGCGGUGUGUGCGGAGCUAGGCCUGGUGUUGAGUGGUUCACAAGAAGGACCAUGUCUCAUACAUUCCAUGAAUGGAGACUUGUUGAGGACCUUGGAGGGUCCUGAAAACUGCCUGAAACCAAAACUCAUUCAGGCUUCAAGAGAGGGUCAUUGUGUCAUAUUCUAUGAAAACGGCCUCUUCUGUACAUUCAGUGUGAAUGGAAAACUCCAGGCCACGAUGGAAACAGAUGAUAACAUAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-340.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -360.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 364.64

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((((.(((((.(((........))).)))))(((((((.....(((((((.((((........((..((((........))))..))..((((.(((......))))))).....((((((((((((....(((.(((((((.((..(((......).))..)).)))))))..)))....(((....)))))))).)))))))............((((((.(.........).))))))))))...)))))))))))))).((((....))))........((((((.((.(((.(((((((((.................(((((((....))))))).(((((((..(((((((((.(((......((.(((((....))))).))....(((((...(((.((......)).))).))))).(((........))).((((........))))((((((.((.((((((((..........(((((((((((.((((((......(((.(((((....(((((((((((((((((....((((..(((((((..((((((((((....((((((((..(((((...((...((((.((((((((.(((((((((....)))))))))......))))))))..)))))).))).)).))))))))...)).))))))))....).))))))...))))...))))))........((((((((.........)))))))))))))).)))))....))))).)))....))))))...))).....(((((((..((((.......))))......)))))))...(((((((.........)))).))))))))))))))).)).)).))))))))))).)))))))))..))))))).(((((((.......)))))))(((((...(((((...))))))))))...))))))))).))))).))))))......(((((((...........)))))))....((((.(((((...((.(((((...)))))..))))))).))))...((((((...)))))).....))))))))....(((..............)))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

({((((({(.(((((.(((......,.|}|.||}}}(((((((.....{{(((({.{(((.....,{{((..{{{,.,,..,))))}}.,)),.{,{{,(,(,{{...}},|||}....,{{{||{|||{{{....{|,.{{{{{{,.{{..,,,.|,{{{||||{{||{{||||||{{|{,.....},.},}))}))))).)))}})))))},.,...,,|||||,.,..,|||...),)))|||}}}}...}}))}))))))))).{(({....}}}}..,.....((((((.((.(((.((((((((({{{,,,....,......(((((((....))))))).(((((((..(((((((((.(((,{.,(((({((((({..,||{||,{{....,((((...(({,((,,.,..}},|||,}||||,{{{........}))|((((........)))),,,|||.(({({,((,(({......}}},||,,||||||||{,,,{.{,{,,(((,(((((,,..{{{{(((({{{{||{{{....{{{{..{{{|||||||||{{{||||.,,.({{{{{{{,,||{||,,,{{,,.,{{{.{{{||||||{((((((((....)))))))))||,,,,||}}}}}|,,||}|||,}}}.||,}}|||||}...})}))))})))}|.,|,|||}}|,,.}|||,}.,}))))........((((((((.........)))))))))))))).))))),,..))))),)})}}}}}}}}))},,}))|....|||||||,.{{((.,....,}|}|,..,,.}}}}}})}}}|,|{{{{.........)))).})}}},}},))))))},}.}}.)))),)}}))).)))))))))..))))))).(((((((.......))))))){{{((...{({{{...))))))))))...,)))))))).))))).))))))......(((((((...........)))))))..,..((({(({{{.,,{{.(((((...)))))..},)))))}))|||,.((((({.,,})}}||,,...}))))}))},},|||,...},..,}....))).,},