Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0002200

Sequence Length

1971 nt

GC Content

0.4414

CCACAGAUGAAGAUAUCCUUGCUAAAGGAAAACAGUCCAUCAGGAGUCAGGCUUUAGGAAAUCAGAACUCAGAAAACGAGAUCCUCCUGGAAGGCGAUGAUGAUACUCUGUCAUCCGUGGAUGAGAAAGAUUUAGAGAAUCUUGCCGGUCCUGUUAGCCUGAGCACACCAGCUCAGCUUGUGGCCCCCUCUGUUGUAGUAAAGGGCACUCUUUCUGUCACCUCCUCCGAACUCUAUUUUGAGGUGGAUGAAGAGGAUCCUAACUUCAAAAAAAUCGACCCCAAGAUCUUGGCAUAUACAGAAGGGCUGCAUGGAAAAUGGCUGUUCACAGAGAUACGAUCAAUCUUUUCUCGUCGUUAUCUUUUGCAAAAUACAGCCCUGGAGAUCUUUAUGGCAAACAGAGUUGCUGUGAUGUUCAACUUCCCAGACCCUGCAACAGUAAAGAAAGUGGUUAACUAUCUACCUCGUGUUGGCGUUGGAACAAGUUUUGGAUUGCCUCAAACCAGACGUAUUUCAUUAGCUAGUCCACGUCAGCUUUUUAAGGCUUCUAAUAUGACCCAGCGAUGGCAACACAGAGAGAUAUCUAAUUUUGAGUACUUGAUGUUUCUCAACACGAUAGCAGGACGGAGUUAUAAUGACUUAAAUCAGUAUCCAGUGUUUCCUUGGGUCAUCACUAAUUAUGAAUCAGAAGAACUGGAUCUUACCUUGCCCACCAACUUCAGAGAUUUGUCCAAGCCAAUAGGAGCUCUGAACCCAAAAAGAGCAGCAUUCUUCGCUGAGCGUUAUGAAUCAUGGGAAGAUGAUCAAGUUCCAAAGUUUCACUAUGGUACUCAUUACUCAACUGCAAGUUUUGUUCUUGCAUGGCUGCUAAGAAUAGAACCCUUUACAACUUAUUUCCUAAAUUUGCAAGGAGGCAAAUUUGAUCAUGCAGAUCGAACUUUUUCAUCAAUUUCCAGAGCUUGGCGAAACAGUCAGCGUGAUACCUCUGAUAUUAAGGAGUUGAUCCCUGAAUUUUAUUAUCUCCCUGAGAUGUUUGUCAACUUCAAUAAUUAUAAUCUUGGAGUGAUGGAUGAUGGGACAGUAGUGUCUGAUGUCGAACUUCCUCCUUGGGCCAAAACCUCAGAAGAAUUUGUUCACAUAAACAGAUUGGCCCUGGAGAGUGAAUUUGUUUCCUGCCAGCUUCACCAAUGGAUUGAUCUCAUUUUUGGCUAUAAACAGCAAGGACCAGAAGCUGUCCGAGCCCUCAAUGUGUUCUAUUACUUGACCUAUGAAGGAGCUGUCAAUCUGAAUUCAAUAACUGAUCCUGUGUUGAGAGAGGCUGUUGAAGCUCAAAUCCGAAGUUUUGGACAGACUCCUUCUCAACUACUCAUAGAGCCCCAUCCUCCCAGAGGUUCUGCCAUGCAAGUGAGUCCAUUGAUGUUCACAGACAAAGCCCAGCAGGAUGUUAUCAUGGUCCUCAAGUUUCCCUCCAACUCCCCUGUUACUCACGUGGCAGCCAACACCCAGCCUGGUUUGGCAACUCCCGCUGUGAUCACAGUCACUGCUAACAGGUUAUUUGCGGUGAACAAAUGGCACAACCUUCCUGCUCAUCAAGGUGCUGUACAAGACCAGCCAUACCAGCUGCCAGUGGAAAUCGAUCCUCUCAUAGCCAGCAAUACAGGAAUGCACAGGAGGCAAAUCACUGACCUUUUAGACCAAAGUAUUCAAGUGCAUUCCCAGUGCUUUGUCAUCACUUCAGACAACCGCUAUAUUCUCGUCUGUGGCUUCUGGGAUAAAAGUUUCAGAGUCUAUUCUACAGACACAGGAAGAUUGAUCCAAGUGGUGUUUGGCCAUUGGGAUGUCGUCACUUGCCUUGCUCGUUCUGAGUCAUAUAUUGGGGGAAAUUGCUACAUUCUCUCAGGGUCACGUGAUGCAACUCUUUUGCUGUGGUAUUGGAAUGGAAAAUGCAGUGGGAUUGGAGAUAACCCAGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-555.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -594.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 505.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((....(((.((((((((.(((...(((......))).(((((.(((((.((((((...((((((.(((.......)))....(((((...(((...(((((..(((((......((((.((((.(((((((...)))))))....(((((((((..((((((......))))))(.((((((((..(((((((.(((..((((..(((((.(..(((((((................)))))))..))))))..)))).))).))............((((....)))).....))))).)))))))).)......((((((....(((((((((((............)))).)))))))........))))))((((.((...(((((((((......))))))))).........))))))....(((....))).(((.(((.....))).)))...((((((((((((.(((.(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).)))))))))(((((....)))))((......))....((....))......((((((((((...............)))))))))))))))))))))))))).((((((...)))))).....((.(((((((.((((..(((.((((........)))).))))))).)))))))))...)))).))))......)))))..)))))...)))..)))))(((((..........))))).......((((((((((........((.(((((((((((..((((((...((((.....(((.....))).....))))....((((((((((((((....))).)))))))))))...................((((((((......))))))))((((.....))))))))))..)))))..))))))))))))))))))...((((...))))...)))))).))))))..))))).)))))........(((((...)))))((((((((.((((((...........)))))))))))))).((.(((((....))))).))(((((((...((((..((((((.............(((((((......))))))))))))).)))).(((((.(((........))).)))))(((((((.....(((((((.((((........((..((((........))))..))..((((.(((......))))))).....((((((((((((....(((.(((((((.((..(((......).))..)).)))))))..)))....(((....)))))))).)))))))............((((((.(.........).))))))))))...))))))))))))))..))))...))).......))))))))))).))))))((((...(((...((((((.((((((((...((((.(((((((............((((.((((.......((.(((((....))))).))....(((((...(((.((......)).))).))))).............(((.((.....))))).)))).))))))))))))))).......((((((.(((.(((((((.............(((((....(((((((((((((((((....((((..(((((((..((((((((((....((((((((..(((((...((...((((.((((((((.(((((((((....)))))))))......))))))))..)))))).))).)).))))))))...)).))))))))....).))))))...))))...))))))........((((((((.........)))))))))))))).)))))....))))))))))).).))).)))..)))....)))).))))))))))..)))..))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((...,(((.((((((({{(((...(({.....,|||.(((((.(((((,((((,{{{.((((((.(((.......)))....(((((...(((...(((((..(((((......((((.{(((.(((((((...))))))).{(.((((((((({.((((((......))))))|,((((((((..(((((((.(((..((((..(((((({..(((((((....,,..........)))))))..))))))..)))).})}.}}............((({....}))).....))))).)))))))).,......((((((...{(((((((((((.,..........))))},))))))})......))))))((((,((.{.(((((((((......))))))))).}.}}....)}))))...,((,...,)},.{((.(((.....))).)))...((((((((((({{(({,(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).)))))))))(((({....})))){{......},.{{,,,..,}),......((((((((((...............))))))))))}))))))}))))))))})(((({...})))),.....{(.(((((((.{(((..(((.((((........)))).))))))}.)))))))}}...)))}.))))......)))))..)))))...)))..)))))(((((..........))))).......((((((((((........,,.(((((((((((..((((((...(((...,,,.|||,|.,.....,....{{{{,.((((((((((((((....))).)))))))))))..................,((((((((......))))))))|,,,.,}}}),,,))))))..)))))..))))))},)))))))))}...{(({,.,,}}}...}))))).}}..})}}}}))).))))).......,(((((...)))))|{{(((({{((((({...........))))))))))}}}}.{{,(({{{....|||||,}}||,{{,{...((((..((((((.............{((((((......))))))))))))).)))).(((((.(((,,....}.))).)))})(((((((,....{{(((({.{(((,....,,{((..{{{,.,,..,})))}}.|)),.{{{{,(,(,,{...||,||}}..,.,{{{||{|||{{{....{|,.{{{{{{,.{|,.|||,|,{{{|{||{{||{(||||||{{|(,.....},.},}))}))))).)))}})))))},.,...,,||{{{{.,..,.,....)})))}}})}}}...}}))))))))))))..|||},},)))}..,}},))))))))))).))))))((((...(((...((((((.((((((((,,,,{{{,|((|{((,,,.,,{.....{|||,||||.......{{,((||{.,,,)))}),))....,{{{{..,{{{,|{|,.,..}}{|||.,}}}|.,,|}.......,|||{(({.....,,,)}))},.}}},||||}}||}||,......|||.}|.,,,}|{||{{,..,.,,,,,{{{,{((((,,..{{{{(((({{{,{{{((....{({{..{{{{{{|||||{{{{||||,,,,{{{|||{{,,||{||,,,{{.,.{{{{.{{{|||||{{((((((((....)))))))))||,,,,|||}}}}|,,||}|||,}}}.||,,}|||||}...}))))))})))}|.,|,|||}||,,,}|||,}.,}))))........((((((((.........)))))))))))))).)))))},..)))))})})))}),},,}))},)))}....)))),))))))))))..)))..))).)